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Capture Molecules and their Limitations अणु सीमाएँ हैं और उनके रिकॉर्ड
The most common form of analytical protein arrays are antibody microarrays in which antibodies (or antibody mimics) that bind specific antigens are arrayed on a glass slide at high density. सबसे सामान्य रूप विश्लेषणात्मक प्रोटीन arrays एंटीबॉडी microarrays हैं , जिनमें एंटीबॉडी ( या एंटीबॉडी कीटोन ) जो विशिष्ट एंटीजन बाध्य हैं arrayed स्लाइड पर एक गिलास में उच्च घनत्व है . A lysate is passed over the array and the bound antigen is detected after washing. एक के ऊपर सरणी lysate पारित हो जाता है और बाध्य प्रतिजन धोने के बाद पता चला है . The biggest challenge with these methods is producing reagents that identify the protein of interest and with high enough specificity in a high-throughput fashion.  Although antibodies are the traditional reagent of choice for detecting proteins in complex mixtures, polyclonal sera are often not specific and are expensive to produce. इन विधियों के साथ सबसे बड़ी चुनौती है कि उत्पादन अभिकर्मकों प्रोटीन का पता लगाने के ब्याज और पर्याप्त उच्च विशिष्टता के साथ एक उच्च throughput फैशन में है . एंटीबॉडी हैं हालांकि परंपरागत अभिकर्मक की पसंद का पता लगाने के लिए प्रोटीन में जटिल मिश्रण है , पॉलीक्लोनल सीरा हैं और अक्सर विशिष्ट नहीं हैं महंगी के उत्पादन के लिए है . Also, the conventional hybridoma method of producing highly specific monoclonal antibodies is time-consuming, laborious and costly (8). इसके अलावा , हाइब्रिडोमा परंपरागत तरीके से उत्पादन अत्यधिक विशिष्ट मोनोक्लोनल प्रतिपिण्डों की खपत का समय है , और महंगी श्रमसाध्य ( 8 ) .

Several studies using antibodies have recently been conducted despite the obstacles in obtaining specific antibodies. कई अध्ययनों का उपयोग कर एंटीबॉडी ने हाल ही में आयोजित किया गया है कि बाधाओं के बावजूद एंटीबॉडी प्राप्त करने में विशिष्ट है .  In one of the largest studies to date, Sreekumar et al. में से किसी एक में सबसे बड़ा अध्ययन करने के लिए तिथि , श्रीकुमार एट अल . spotted 146 distinct antibodies on glass to monitor the alternations of protein quantity in LoVo colon carcinoma cells. धब्बेदार 146 विशिष्ट कांच एंटीबॉडी पर निगरानी के लिए प्रोटीन की मात्रा में alternations बृहदान्त्र LoVo कार्सिनोमा कोशिकाओं . Their results revealed radiation-induced up-regulation of many interesting proteins, including p53, DNA fragmentation factor 40 and 45, tumour necrosis factor-related ligand, as well as down-regulated proteins (58). उनके परिणामों के विकिरण का पता चला प्रेरित करने के विनियमन के कई दिलचस्प प्रोटीन सहित p53 , डीएनए खंडन कारक 40 और 45 , ट्यूमर से संबंधित ligand परिगलन कारक है , साथ ही कम से प्रोटीन विनियमित ( 58 ) .

To date, most antibody microarrays were produced with several dozen or a few hundred commercially available poly- or mono-clonal antibodies.  Although tens of thousands of antibodies are commercially available, this number is insufficient because for most proteins there are no available antibodies.  The fact that many antibodies are glycosylated and contain large protein-based supporting structures means that they often cross-react with more than one target protein.  This can contribute to a large number of false positives (9).  Thus another problem has been obtaining high-specificity antibodies. तिथि करने के लिए , सबसे microarrays थे एंटीबॉडी पैदा के साथ कई दर्जन या कुछ सौ या व्यावसायिक रूप से उपलब्ध पॉली मोनो clonal एंटीबॉडी . यद्यपि हजारों एंटीबॉडी व्यावसायिक रूप से उपलब्ध हैं , यह संख्या अपर्याप्त है क्योंकि प्रोटीन के लिए सबसे एंटीबॉडी उपलब्ध नहीं हैं . तथ्य यह है कि कई एंटीबॉडी ग्लाइकोसाइलेटेड हैं और जिनमें बड़ी प्रोटीन संरचनाओं के आधार पर समर्थन का मतलब है कि वे अक्सर पार से प्रतिक्रिया के साथ एक से अधिक प्रोटीन का लक्ष्य है . योगदान दे सकते हैं यह एक बड़ी संख्या में झूठे सकारात्मक ( 9 ) . इस प्रकार एक अन्य समस्या उच्च प्राप्त करने की गई है एंटीबॉडी विशिष्टता है .

One of the greatest problem with antibody arrays is specificity. एक सबसे बड़ा के साथ समस्या एंटीबॉडी arrays विशिष्टता है . Proteins are often present in a very large dynamic range (106); thus, reagents that might have high affinity for one protein, but are low affinity for another will still exhibit detection of the lower affinity protein if it is much more prevalent (9). अक्सर में मौजूद प्रोटीन एक बहुत बड़ी गतिशील रेंज ( 106 ) ; इस प्रकार , अभिकर्मकों हो सकता है कि समानता के लिए एक उच्च प्रोटीन है , लेकिन कम आकर्षण का पता लगाने के लिए एक और तब भी प्रदर्शनी का आकर्षण कम प्रोटीन यदि वह अधिक प्रचलित है ( 9 ) . One group investigated the ability of 115 well-characterized antibody–antigen pairs to react in high-density microarrays on modified glass slides. एक समूह की क्षमता की जांच की विशेषता एंटीबॉडी - 115 अच्छी जोड़ी प्रतिजन प्रतिक्रिया में उच्च घनत्व microarrays ग्लास पर संशोधित स्लाइड . 30% of the pairs showed the expected linear relationships, indicating that a fraction of the antibodies were suitable for quantitative analysis (33). 30 % की जोड़ी से पता चला कि उम्मीद रैखिक संबंधों , संकेत है कि एक अंश के एंटीबॉडी के लिए उपयुक्त थे मात्रात्मक विश्लेषण ( 33 ) . Many groups have been using sandwich assays to avoid this problem.  A sandwich assay is performed by spotting the first antibody on the array and then detecting the using a second antibody that recognizes a different part of the proteins. कई समूहों का उपयोग किया गया है सैंडविच assays इस समस्या से बचने के लिए . सैंडविच में एक प्रदर्शन के द्वारा परख है spotting एंटीबॉडी पर सरणी के पहले और बाद का पता लगाने के प्रतिपिण्ड का प्रयोग करते हुए एक दूसरे को मान्यता है कि एक अलग हिस्से के प्रोटीन है . This approach dramatically increases the specificity of the antigen detection, but required that a least two high-quality antibodies exist for each antigen to be detected (8). इस दृष्टिकोण के नाटकीय ढंग से बढ़ विशिष्टता का पता लगाने के प्रतिजन है , लेकिन कम से कम दो आवश्यक है कि एक उच्च गुणवत्ता के लिए प्रत्येक एंटीबॉडी मौजूद होने का पता चला प्रतिजन ( 8 ) .

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References for Protein and Antibody Microarrays संदर्भ के लिए प्रोटीन और एंटीबॉडी Microarrays

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Introduction and Background to Protein Chips and Antibody Chips. परिचय और पृष्ठभूमि के लिए प्रोटीन चिप्स और एंटीबॉडी चिप्स .

Types of Antibody and Protein Chips चिप्स और प्रोटीन के प्रकार एंटीबॉडी