Les peptides (du ‚grec de ¿ Ï de „Î de mot Ï€ÎΜÏ€Ï, signification « digestible ») sont polypeptide composé de deux acides aminés ou plus enchaînés ensemble par un lien de peptide. Ils sont « digestibles » parce qu'ils sont généralement isolés dans la digestion des protéines par des protéases (les enzymes qui ont coupé des protéines en plus petites parties). Le lien entre les résidus d'acide aminé sont des liens de peptide qui se compose d'un lien d'amide.
Taille des peptides - quel est un peptide et qu'est-elle une protéine ?
Les protéines sont des molécules de polypeptide (ou composez-vous des sous-unités multiples de polypeptide). La distinction est que les peptides sont courts et des protéines de polypeptides sont longs. Il y a plusieurs différentes conventions pour déterminer ces derniers, qui ont des imperfections.
Une convention est que ces chaînes de peptide qui sont assez courtes pour être faites synthétiquement à partir des acides aminés constitutifs s'appellent les peptides plutôt que des protéines. Cependant, avec l'arrivée de meilleures techniques synthétiques, peptides tant que des centaines d'acides aminés peuvent être faites, y compris de pleines protéines comme l'ubiquitin. La ligature chimique indigène a donné l'accès encore à de plus longues protéines, ainsi cette convention semble être périmée.
Une autre convention place une ligne de démarcation sans cérémonie à approximativement 50 acides aminés de longueur (certains réclament des longueurs plus courtes). Cependant, cette définition est quelque peu arbitraire. De longs peptides, tels que le bêta peptide amyloïde lié à la maladie d'Alzheimer, peuvent être considérés des protéines ; et de petites protéines, telles que l'insuline, peuvent être considérées des peptides. En raison de la nature arbitraire de cette définition, il y a mouvement considérable au sein de la communauté scientifique pour attribuer la définition plus-spécifique que « un peptide est une molécule d'acide aminé sans structure secondaire ; au gain de la structure définie, c'est une protéine. » Ainsi la même molécule peut être un peptide ou une protéine selon son environnement, bien qu'il y ait des peptides qui ne peuvent pas être des protéines.
Classes de peptide
Voici les classes principales des peptides, selon la façon dont elles sont produites :
Peptides Ribosomal
Sont synthétisés par traduction d'ADN messagère. Ils sont souvent soumis à la protéolyse pour produire de la forme mûre. Ceux-ci fonctionnent, typiquement dans des organizations plus élevées, comme hormones et molécules de signalisation. Quelques organizations inférieures produisent des peptides comme antibiotiques, tels que le microcin J25. Puisqu'elles sont traduites, les résidus d'acide aminé impliqués sont limités jusqu'à ceux utilisés par le ribosome, et des modifications de posttranslational en, comme la phosphorylation, l'hydroxylation, la sulfonation, la formation du bisulfure, etc. généralement ils sont linéaires, bien que les structures de lasso soient communes. Des manipulations plus exotiques se produisent, cependant, comme la racémisation (comme dans le venin deplatypus) ou l'utilisation des modules nonribosmal de peptide (voir ci-dessous) (comme dans bistratamide a).
Sont synthétisés utilisant un complexe modulaire d'enzymes (qui fonctionne tout comme une bande de conveyeur sur une usine). Des peptides de Nonribosomal sont confinés principalement aux organizations, aux usines, et aux mycètesunicellulaires. Tous ces complexes sont présentés d'une mode semblable, et ils peuvent contenir beaucoup de différents modules pour exécuter un ensemble divers de manipulations chimiques sur le produit se développant. Généralement ces peptides sont cycliques (souvent avec les structures cycliques haut-complexes), bien que les peptides nonribosomal linéaires soient communs. Puisque le système est modulaire et étroitement lié aux machines pour les acides gras et les polyketides de bâtiment, des composés hybrides sont souvent trouvés. Oxazoles, thiazoles, et leurs contre-parties réduites indiquent souvent que le composé a été synthétisé de cette fa4con.
Peptides assimilés
Sont le résultat de la protéolyse non spécifique en tant qu'élément du cycle digestif. On l'a également documenté que, quand certaines protéines de nourriture telles que le gluten, la caséine, la protéine d'oeufs, et la protéine d'épinards sont décomposées, des peptides d'opioid sont formés. Ces peptides imitent les effets de la morphine, et ces individus qui ne peuvent pas les décomposer éprouveront la maladie mentale. Ces peptides sont tout à fait courts et reçoivent des noms tels que le casomorphine, l'exorphine de gluten, et le dermorphine. Les peptides finalement assimilés sont les peptides ribosomal, bien qu'ils ne soient pas faits sur le ribosome de l'organization qui les contient.
Fragments de peptide
Référez-vous aux fragments des protéines qui identifiaient ou mesurez la protéine de source. Souvent ce sont les produits de la dégradation enzymatique exécutés dans le laboratoire sur un échantillon témoin, mais peuvent également être des échantillons légaux ou paléontologiques qui ont été dégradés par des effets normaux.
Peptides dans la biologie moléculaire
Les peptides ont reçu la proéminence dans la biologie moléculaire ces derniers temps pour plusieurs raisons. Le premier et le plus important est que les peptides permettent la création des anticorps chez les animaux sans nécessité d'épurer la protéine d'intérêt. On peut simplement préparer les peptides antigéniques des sections de la protéine d'intérêt. Celles-ci suffiront en préparant des anticorps chez un lapin ou une souris contre la protéine.
Une autre raison est que les peptides sont devenus instrumentaux dans la spectrométrie de masse, permettre l'identification des protéines d'intérêt basées sur le peptide amasse et ordre.
Des peptides ont été récemment utilisés dans l'étude de la protéine [structure] et de la fonction. Par exemple, des peptides synthétiques peuvent être utilisés en tant que sondes pour voir où les interactions de protéine-peptide se produisent.
Des peptides inhibiteurs sont également employés dans la recherche clinique pour examiner les effets des peptides sur l'inhibition des protéines de cancer et d'autres maladies.
Familles bien connues de peptide
Les familles dans cette section sont toutes de peptide les peptides ribosomal, habituellement avec l'activité hormonale. Tous ces peptides sont synthétisés par des cellules en tant que plus longtemps des « propeptides » ou « proproteins » et tronqués avant de quitter la cellule. Ils sont déchargés dans la circulation sanguine où ils remplissent leurs fonctions de signalisation.
