À cause du minuteness des bactéries la recherche sur leur structure est occupée avec la grande difficulté. Une fois examinées sous le microscope, en leur état normal, par exemple dans l'eau, elles apparaissent simplement comme sans couleur les corps refractile des différentes formes ont nommé. On peut également observer la formation et la motilité de spore, quand ceux-ci existent, mais peu autrement peuvent être faites dehors à partir d'un photomicroscope. Pour leur recherche appropriée on profite toujours du fait de leurs affinités pour différents colorants, particulièrement ceux qui sont habituellement choisis en tant que bonnes taches pour les noyaux des cellules animales.
Certains points ont été ainsi déterminés. La cellule bactérienne se compose d'une masse brusquement contournée du protoplasme à la laquelle réagit, colorants particulièrement de base et azoïques comme le noyau d'une cellule animale cependant de ce fait que nous ne pouvons pas déduire que les deux sont identiques en « composition. Une bactérie saine quand présents souillés ainsi l'aspect d'une structure finement granulaire ou presque homogène. Le protoplasme est entouré par une enveloppe qui peut dans certains cas être expliquée par overstaining un spécimen avec un colorant azoïque fort, quand elle apparaîtra comme halo autour de la bactérie. Cette enveloppe peut quelques fois être vue pour être d'épaisseur considérable. Sa couche les plus secrets est probablement d'une cohérence plus dense, et contourne brusquement le protoplasme contenu, donnant à ce dernier l'aspect de l'entourage par une membrane. Elle est seulement, cependant, dans certaines des formes plus élevées qu'une membrane vraie se produit. Parfois la marge externe de l'enveloppe est brusquement définie, dans ce cas la bactérie semble avoir une capsule distincte, et est connue comme bactérie capsulated. La cohésion des bactéries dans les masses dépend en grande partie du caractère de l'enveloppe. Si ce dernier est visqueux, alors une grande masse des mêmes espèces peut se produire, formé de dans les bactéries dividuelles encastrées dans ce qui semble être une masse de gelée.
Quand ceci se produit, on le connaît comme Massachusetts de zoogloea d'une part, si l'enveloppe n'a pas cette propriété cohésive que la séparation des individus peut facilement avoir lieu, particulièrement dans un support liquide dans lequel elles peuvent flotter entièrement libre les uns des autres. Plusieurs des bactéries plus hautes possèdent une gaine qui a une structure beaucoup plus définie qu'est trouvées parmi les formes inférieures. Elle résiste à des influences externes, possède l'élasticité, et sert à lier les éléments de l'organization ensemble.
