Cartes génétiques de Cancer pancréatique et de Cancer de cerveau terminés
Cartes génétiques de Cancer pancréatique et de Cancer de cerveau terminés
Le modèle génétique complet pour le cancer pancréatique mortel et le cancer de cerveau a été déchiffré par une équipe au centre de Cancer de Johns Hopkins Kimmel.
Les études, menées par le même groupe qui a terminé des cartes du cancer du sein et des génomes côlorectaux de cancer en 2007, sont enregistrées en deux articles en 5 septembre 2008, issue de la Science exprès.
Considéré d'être le résultat le plus complet jusqu'ici pour n'importe quel type de tumeur, la nouvelle carte a évalué des mutations dans pratiquement tous les gènes humains connus de protéine-codage, consistés en plus de 20.000 gènes, dans 24 cancers pancréatiques et 22 cancers de cerveau.
Un ensemble de noyau de processus de gène et de voies de normalisation, environ une douzaine pour chaque type de tumeur, se sont avérés pour être modifiés dans la majorité de tumeurs étudiées par les chercheurs. Dans le cancer pancréatique, ces 12 voies, y compris ceux liées au contrôle de dommages d'ADN, maturation de cellules, et invasion de tumeur, ont été modifiées en 67 pour cent à 100 pour cent de tumeurs.
« Ce point de vue change la voie que nous pensons aux tumeurs pleines et leur gestion, parce que les drogues ou d'autres agents qui visent les effets physiologiques de ces voies, plutôt que différents composants de gène, sont susceptibles d'être l'approche la plus utile pour développer de nouvelles thérapies, » dit Bert Vogelstein, M.D., codirecteurs du centre de Ludwig à Johns Hopkins et à un investigateur médical d'institut de Howard Hughes.
En plus des découvertes de voie, un certain nombre de différents gènes mutés ont été identifiés, y compris 83 gènes de cancer dans le cancer pancréatique et 42 sous la forme la plus mortelle du cancer de cerveau, le multiforme de glioblastoma (GBM). Supplémentaire, 70 gènes qui overexpressed excessivement dans l'un ou l'autre cancer encodent les protéines qui sont sur la surface des cellules ou sécrétée, leur faisant le diagnostic potentiel et examinant des cibles.
Un gène, la déshydrogénase 1 (IDH1) d'isocitrate, s'est avéré pour être fréquemment subi une mutation dans un sous-ensemble de cancers de cerveau de GBM. Les mutations étaient plus communes dans de jeunes patients de GBM, et ont été associées à la survie améliorée. Les mutations IDH1 ont été également trouvées dans presque tous les cas de GBMs secondaire (cancers qui progressent des tumeurs préexistantes de qualité inférieure), soulevant la possibilité que cette mutation peut être un repère utile pour identifier que les tumeurs cérébrales de qualité inférieure sont le plus susceptibles de développer en GBMs mortel.
Les « patients présentant les mutations IDH1 semblent être différents d'autres patients avec GBM, médicalement et biologiquement, » dit Victor Velculescu, M.D., Ph.D., professeur agrégé de l'oncologie. « Il est imaginable que ces patients tirent bénéfice finalement de différents traitements, potentiellement en visant IDH1. »
« L'horizontal des cancers humains est clairement plus complexe qu'a été précédemment apprécié. Le combat de lui va être plus d'un guérilla que conventionnel parce qu'il y a des douzaines de gènes mutés dans chaque tumeur, » dit Kenneth W. Kinzler, Ph.D., codirecteurs du centre de Ludwig à Johns Hopkins et à professeur de l'oncologie. « Individuellement, ces mutations ne semblent pas formidables. Mais fonctionnant ensemble, elles forment un ennemi qui exigera de nous de développer des stratégies originales pour les combattre, et la meilleure stratégie de long terme peut être dépistage précoce des tumeurs, quand le nombre de guérillero que les guerriers est encore petit et plus facilement a manipulé. »
Pour faire leurs résultats, les investigateurs ont intégré plusieurs méthodes d'analyse génétique. Ils avaient l'habitude des microarrays à haute densité pour identifier des changements de nombre de copie (des amplifications et des suppressions) et des technologies de ordonnancement de la deuxième génération pour évaluer l'expression de gène. Ils ont également développé des algorithmes statistiques originaux pour intégrer ces analyses génétiques complémentaires, aussi bien que des techniques pour séparer des changements probablement pour contribuer au déclenchement et à la progression de cancer des soi-disant mutations de passager, qui s'accumulent sans danger pendant le développement de cancer.
Chaque projet a coûté plus de $4 millions, avec le placement de fil de sortie pour l'initiative de génome de Cancer pancréatique de Goldman venant de la confiance charitable de solénoïde Goldman et de la confiance charitable de Lillian Goldman. La base de la Virginie et de D.K. Ludwig a fourni le placement de fil de sortie pour le projet de cancer de cerveau. L'initiative de tumeur cérébrale de Ludwig représente la première collaboration formelle des centres de Ludwig établis par les fonds de Ludwig en 2006.
Cette année des 38.000 personnes environ développeront le cancer pancréatique aux USA, avec des cadences de survie globales moins de 5 pour cent. Bien que peu de patients soient diagnostiqués avec les cancers de cerveau (approximativement 20.000 cas par an aux Etats-Unis), les résultats sont également catastrophiques. « Les raisons principales que nous avons choisi de nous concentrer sur ces cancers est parce qu'ils sont ainsi extrêmement et d'avoir de telles options limitées de traitement. Ce que nous nous renseignons sur ces tumeurs peut mener aux mesures diagnostiques améliorées ou les thérapies à l'avenir, » dit Ralph Hruban, M.D., directeur du centre de recherche sur le cancer pancréatique de solénoïde Goldman chez Johns Hopkins.
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