protocoles basés

Catégorie : Protocoles de pharmacologie et de toxicologie : Protocoles de titrages de l'enzyme

Protocole pour 3/7 analyse. Inclut : Détection de Caspase-3 et de -7 activités dans des analyses cellulaires ; Détection de Caspase-3 ou d'activité -7 utilisant Caspases épuré. - [Protocole lu d'analyse 3-7]

Catégorie : Bio-informatique

Utilisant AFPredictor, on l'a expliqué que le `a commandé les carbones extérieurs (OSCs) sont un dispositif de distinction d'AFPs et, plus spécifiquement, leurs surfaces glace-contraignantes. AFPredictor a identifié AFPs d'un grand ensemble de structures avec la spécificité plus considérablement que de 99%. En outre, il a été employé pour identifier une protéine glace-contraignante originale en protégeant une bibliothèque des structures modelées par homologie basées sur des ordres de cDNA obtenus à partir du seigle d'hiver froid-acclimaté (cereale de sécale). - [Lu un protocole de calcul de criblage pour l'antigel/protéines Glace-Structurantes]

Catégorie : Protocoles d'ACP

Le système de MagneSil peut sélectivement isoler les produits d'ACP qui sont plus le point d'ébullition de 150 longtemps des amorces et l'amorce - dimères.  La technologie peut être utilisée avec un certain nombre de postes de travail robotiques, y compris des postes de travail d'automatisation de Biomek 2000 du coutre de Beckman et de laboratoire de FX.  Le procédé peut également être suivi manuellement.  La reprise typique est plus de 80% pour un 1 produit de kb avec le transfert négligeable des amorces ou des nucléotides. - [Lu une méthode Particule-Basée magnétique pour épurer des produits d'ACP de protocole de solution]

Catégorie : Protocoles d'ADN : Protocoles d'ADN-Protéine d'EMSA

Une analyse électrophorétique non radioactive de décalage de mobilité basée sur le système de détection de digoxigenin avait été développée et appliquée à l'analyse de l'interaction entre le facteur de transcription de choc de la chaleur et l'élément de choc de la chaleur du crassa de N. (Bioch - [analyse électrophorétique non radioactive lue de décalage de mobilité d'A pour la détection d'élément de choc de la chaleur (HSE)]

Catégorie : Protocoles de biologie moléculaire : Protocoles d'hydrate de carbone

La méthode permet la détection et la quantification de l'activité de glycosyltransferase utilisant un procédé ELISA-basé et des anticorps monoclonaux hydrate de carbone-spécifiques. Évite l'utilisation des substrats radioactifs. Bruce A. Macher~Professor de chimie et de biochimie, université de l'Etat de San Francisco, San Francisco, CA - [lu une analyse ELISA-Basée sensible pour Glycosyltransferases]

Catégorie : Protocoles de biologie d'usine : Protocoles de génétique végétale

AFLP a été conçu comme méthode sensible d'a fortement - pour que l'empreinte génétique Soit utilisée dans une série de domaines. Nous employons cette technologie pour produire des repères basés par ADN pour des gènes de clonage impliqués dans des réponses phototropic à de plus hautes usines qui seulement ont été identifiées génétiquement par phénotype de mutant. Le protocole inclut : Produisez de la population F2 (ou F-3) de recombinaison polymorphe ; Isolez l'ADN genomic ; Restriction de l'ADN ; Ligature des adaptateurs ; Pré-amplification de l'ADN de descripteur ; AFLP-PCR ; etc. - [AFLP lu pour le clonage de position]

Catégorie : Protocoles d'ACP : ACP D'AFLP

Ulrich G. Mueller et L. LaReesa Wolfenbarger. Les polymorphismes amplifiés de longueur de fragment (AFLPs) sont l'amplification en chaîne par réaction (ACP) - repères basés pour le criblage rapide de la diversité génétique. AFLP. ARBRE l'octobre 1999 - [pdf genotyping et de prise d'empreintes digitales d'AFLP lu de revue]

Catégorie : Protocoles d'ACP : ACP D'AFLP

P Vos, R Hogers, M Bleeker, M Reijans, T van de Lee, M Hornes, un Frijters, pot de J, J Peleman, et M Kuiper. 1995. Recherche d'acide nucléique. La technique d'AFLP est basée sur l'amplification sélective d'ACP des fragments de restriction d'un sommaire total de genomic - [AFLP lu : une nouvelle technique pour l'empreinte génétique.]

Catégorie : Protocoles d'ACP : ACP D'AFLP

Mannie Liscum et Paul Oeller. Service de biologie d'usine. Établissement de Carnegie de Washington, Stanford. La technologie d'AFLP est employée ici pour produire des repères basés par ADN pour des gènes de clonage impliqués dans des réponses phototropic à de plus hautes usines qui ont seulement été I - [AFLP lu : non seulement pour l'empreinte digitale, mais pour le clonage de position]

Catégorie : Protocoles de pharmacologie et de toxicologie : Protocoles de cytotoxicité : Analyses de cytotoxicité dans des protocoles de culture de cellules

Descibes de protocole que l'utilisation des cellules de fibroblaste de la souris L929 a cultivé in vitro dans une analyse de recouvrement d'agarose pour évaluer la toxicité des substances d'essai.  L'analyse peut être utile en évaluant le potentiel d'irritation des substances d'essai (par exemple produits agent-basés) comme alternative à l'essai d'oeil de lapin de Draize. - [Protocole lu d'analyse de recouvrement d'agarose]

Catégorie : Signalisation des protocoles de transduction de signal

Protocole relatif à une analyse image-basée de formation endothéliale de tube de cellules comme modèle d'angiogenèse. Inclut : Introduction, méthodes, résultats, discussion et références. - [Lu une analyse Image-Basée de formation endothéliale de tube de cellules]

Catégorie : Biologie de cellules et culture de cellules : Protocoles endothéliaux de cellules

Des modèles animaux traditionnels pour mesurer le degré de formation de vaisseau sanguin sont remplacés par les analyses de culture de cellules il est plus facile installer que, statistiquement fiables et peuvent être automatisés dans un laboratoire de criblage de drogue. Ces analyses se fondent sur la capacité des cellules endothéliales de former distinct sang-navire-comme des tubules dans une matrice extracellulaire où elles peuvent ultérieurement être visualisées par microscopie de fluorescence. - [Lu une analyse Image-Basée de formation endothéliale de tube de cellules comme modèle d'angiogenèse]

Catégorie : Protocoles d'ACP : ACP D'AFLP

Une introduction à AFLP et à fAFLP. Marquez E. Berres, université du Wisconsin. Le polymorphisme amplifié de fragment-longueur (AFLP) ou sa version fluorescente (fAFLP) est une technologie de prise d'empreintes digitales ACP-basée. AFLP implique fondamentalement la restriction de l'ADN genomic - [lu une introduction à AFLP et à fAFLP]

Catégorie : Biologie de cellules et culture de cellules : Protocoles de Cytometry d'écoulement : ADN souillant des protocoles pour l'écoulement Cytometry

Des méthodes simples et universellement applicables pour souiller les cellules fixes sont présentées, de même que des méthodes qui utilisent des détergents et le traitement protéolytique pour permeabilize des cellules. Supplémentaire, la cellule supravital souillant avec Hoechst 33342, qui est principalement utilisée pour trier les cellules de phase pour la cultivation ultérieure basée sur des différences d'ADN-contenu, est également décrite. Également présentées sont des méthodes pour la souillure des noyaux de cellules d'isolement dans les tissus paraffine-encastrés, et la déconvolution de l'ADN-contenu-fréquence… - [Analyse lue de contenu cellulaire d'ADN par protocole de Cytometry d'écoulement]

Catégorie : Biologie de cellules et culture de cellules : Protocoles d'Apoptosis : Analyse d'Apoptosis

Analyse de fragmentation d'ADN utilisant l'analyse de BOURRAGE. Par Shailaja Kasibhatla et autres, l'analyse de BOURRAGE est basée sur étiqueter l'ADN nucléaire des cellules de recyclage avec de la thymidine [3H] et moissonner des échantillons sur des filtres de fibres de verre. Apoptosis produira des fragments d'ADN assez petits pour passer par le filtre de fibres de verre, ayant pour résultat la radioactivité diminuée de l'échantillon particulier. Le massacre communiqué par les cellules de cytotoxicité ou de cellules a négocié par les lymphocytes cytotoxiques de T (CTL) peut également être mesuré par cette technique. - [Analyse lue de fragmentation d'ADN utilisant l'analyse de BOURRAGE (abonnement exigé)]

Catégorie : Biologie de cellules et culture de cellules : Protocoles de Cytometry d'écoulement : Protocoles d'analyse de données de Cytometry d'écoulement

Fournit plusieurs approches pour couler analyse de données cytometry. Des déterminations de fréquence basées sur l'analyse des histogrammes de fluorescence de simple-paramètre et des traçages de découpe de duel-paramètre sont présentées. Des étapes sont décrites pour calculer des valeurs pour des taux signal/bruit quand l'amplification logarithmique est utilisée pour la collecte de données. - [Analyse lue de protocole de données de Cytometry d'écoulement]

Catégorie : Protocoles de protéine : Trafic de protéine

Le protocole est basé sur des méthodes pour la résolution de GLUT4 contenant des vésicules et l'identification de la kinase de phosphoinositide contenant des vésicules dans les adipocytes 3T3-L1. Ils peuvent avoir une application plus large à toutes les membranes de densité de bas-support. Le protocole incorpore la stratégie d'utiliser une fraction de microsome de faible densité comme entrée de gradient, utilisée généralement dans les études de la SURABONDANCE 4 qui peuvent avoir une application plus large à d'autres investigations. - [Analyse lue du trafic de membrane et de la signalisation intracellulaire dans des gradients Self-Generated d'Iodixanol]

Catégorie : Protocoles d'Immunohistochemistry : Protocoles de recherche d'antigène

Protocole utilisé à pour immunohistochemistry sur les sections paraffine-encastrées. Basé sur l'utilisation de l'énergie de micro-onde d'effectuer la recherche d'antigène. Le procédé immunohistochemistry, sert du kit de HistoScan de Biomeda basé sur un système de détection d'anticorps de streptavidin-peroxidase/biotinylated deuxième avec 3 aminés, l'ethylcarbazole 9 (l'AEC) comme chromogène. Assurément, d'autres kits ou réactifs faits maison fonctionneront également. - [Recherche lue d'antigène pour Immunohistochemistry avec le protocole Paraffine-Encastré de tissus]

Catégorie : Biologie de cellules et culture de cellules

Protocole pour le criblage formation image-basé automatisé de haut-débit pour les petites molécules qui renversent la sénescence cellulaire. - [Criblage Formation image-Basé automatisé lu de Haut-Débit : Petites molécules qui renversent la sénescence cellulaire]

Catégorie : Protocoles bactériens de culture de cellules : Protocoles bactériens de stocks

4 contraintes d'Escherichia coli sont utilisées dans ces études : JM101 pour l'infection M13 et l'isolement, XL1BMRF'for M13 ou transformation pUC-basée d'ADN, et ED8767 pour la transformation d'ADN de cosmide. Pour mettre à jour leurs épisomes respectifs de F nécessaires pour l'infection M13 virale, JM101 est strié sur le plat minimal de medias d'heure du matin 9 et XL1BMRF est strié sur un plat de livre contenant la tétracycline. ED8767 est strié sur un plat de livre. Ces plats sont incubés à 37degC durant la nuit. Pour chaque contrainte, 3 ml. du liquide approprié. - [Protocole bactérien lu de maintenance de cellules]

Catégorie : Protocoles de protéine : Protocoles de concentration de quantitation de protéine : Protocoles d'analyse de protéine de Bradford

Inclut des étapes d'abréviations, de fond, et de procédé utilisant BSA. L'analyse de protéine de Bradford (1) est l'une de plusieurs méthodes simples utilisées généralement pour déterminer la concentration en protéine totale d'un échantillon.  La méthode est basée sur l'attache proportionnelle du colorant Coomassie aux protéines. L'analyse est colorimétrique ; à mesure que la concentration en protéine augmente, la couleur de l'échantillon d'essai devient plus foncée.  Coomassie absorbe à 595 nanomètre.  - [Analyse lue de concentration en protéine de Bradford]

Catégorie : Protocoles de transfection : Protocoles de transfection de phosphate de calcium

Cette méthode de transfection de phosphate de calcium fonctionne bien dans les variétés de cellule qui sont 1) fortement transformé et 2) l'adhérent (hela, U2OS, SAOS2, AdAH, NPC-KT et obtiennent de l'efficacité 20% à 100% de transfection selon la variété de cellule). Des travaux bien pour des expériences passagères mais des précautions devraient être utilisés dans la conception et la traduction des expériences basées sur la discussion ci-dessous. Fonctionne également très bien pour produire des variétés de cellule stables. Cette méthode est tout à fait sensible à la quantité de plasmide d'entrée. - [Méthode lue de transfection de phosphate de calcium]

Catégorie : Protocoles de transfection : Protocoles de transfection de phosphate de calcium

Ce protocole, est basé sur la méthode vénérable de Graham et de van der Eb (1973). Le procédé est employé principalement pour produire des lignes stables des cellules portant les copies chromosomiquement intégrées de l'ADN transfected. - [Transfection Calcium-phosphate-négociée lue des cellules avec de l'ADN à poids moléculaire élevé de Genomic]

Catégorie : Protocoles de transfection : Protocoles de transfection de phosphate de calcium

Le phosphate de calcium forme un précipité insoluble avec de l'ADN, qui attache à la surface de cellules et est prise dans les cellules par endocytosis. Le protocole est facilement adapté pour l'usage avec d'autres types de cellules, adhérentes et nonadherent. Ce protocole est une version modifiée d'une méthode éditée par la Jordanie et autres (1996) qui les méthodes calcium-phosphate-basées rigoureusement optimalisées de transfection pour les cellules chinoises d'ovaire de hamster et la ligne 293 des cellules embryonnaires humaines de rein. - [Transfection Calcium-phosphate-négociée lue des cellules eucaryotiques avec plasmide DNAs]

Catégorie : Protocoles de Xenopus

Le protocole décrit l'utilisation d'un colorant à base d'eau de base de souiller pour des mucosubstances acides et des mucines acétiques situés sur le cartilage des embryons fixes, permettant l'examen de la formation de cartilage. - [Souillure lue de cartilage du protocole tropicalis de Xenopus]