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Electrotransformation de BMH 81-17mut S pour isoler les mutants Site-Dirigés de dsDNA

Détails d'Article 

Electrotransformation de BMH 81-17mut S pour isoler les mutants Site-Dirigés de dsDNA

La Date A ajouté : 27 mai 2008 05:54:46 AM
Auteur :
Catégorie : Protocoles de Transformation De Bactéries

La Cellule de Transfected Es de Cueillette Copie Le Protocole

La Cellule de Transfected Es de Cueillette Copie - Le Jour 14

  • 1. Dégelez les cellules electrocompetent sur la glace.
  • 2. Refroidissez les cuvettes et les tubes de microcentrifuge contenant l'ADN.
  • 3. Dans un tube à centrifuger stérile de 15 ml, mélangez 1 ml de solution de livre Electroporation.
  • 4. Contrôlez l'installation du matériel d'electroporation. Assurez-vous que le contrôleur d'impulsion est branché et réglé à 400. Placez la capacité à la tension de 25 F. Set à 2.5 kilovolts (maximum).
  • 5. Juste avant l'electroporation de chaque échantillon, remplissez Pasteur introduisent à la pipette et ampoule avec le 1 ml de mélange de livre dans le tube de 15 ml.
  • 6. Prenez les cellules vers le haut en 200 l extrémité, mélangez à de l'ADN et au transfert dans la cuvette en vidant l'extrémité en bas d'un côté de la cuvette. (conseil # 1).
  • 7. Effacez n'importe quelle humidité des côtés de la cuvette.
  • 8. Placez la cuvette dans le support de cuvette et appuyez sur les deux boutons rouges simultanément jusqu'à ce que le signaleur retentisse. (conseil # 2).
  • 9. Laissez les cellules secouer à 255 t/mn pendant 45 à 60 minutes à 37°C.
  • 10. Le après utilisation, rincent immédiatement les cuvettes complètement par de l'éthanol de ddH2O et de 95%. Laissez l'air de cuvettes sec.
  • 11. Plaquez 10 l de la suspension de cellules sur les plats de livre contenant l'antibiotique approprié pour le plasmide. (conseil # 3).
  • 12. Ajoutez le reste de la suspension de 1 ml à 5 ml de livre contenant l'antibiotique approprié. Ajoutez 2.5 ml à un tube stérile, et le repos à un autre tube stérile.
  • 13. Accroissez les cultures durant la nuit (12 à 16 heures) à 37°C dans un incubateur de secousse à 225 t/mn.
  • 14. Partie aliquote 1 ml par tube de microcentrifuge pour un total de 4 tubes de microcentrifuge (voir le conseil # 4).
  • 15. Préparez l'ADN de plasmide par le procédé de miniprep. (voir le protocole relatif à la préparation d'ADN de plasmide). Resuspendez l'ADN de plasmide en volume de 75 l de TE.
  • 16. Assimilez 1 l du miniprep en utilisant 40 unités de l'enzyme de restriction qui représente le seul site dans le plasmide initial en volume total de 40 l. (voir le protocole relatif à la digestion d'enzymes de restriction).
  • 17. Incubez la réaction de digestion pendant 2.5 à 4 heures.
  • 18. Electrophorese 2 l du mélange de sommaire de restriction sur un gel d'agarose pour contrôler que l'échantillon apparaît a entièrement assimilé (voir le protocole pour l'ADN d'Electrophoresing sur un gel d'agarose).
  • 19. Purifiez l'ADN dans le reste du mélange de réaction (voir le protocole relatif à la purification de l'ADN de plasmide) (voir le conseil # 5).
  • 20. Utilisez 0.3 l pour la transformation dans les cellules DH5 (voir le protocole relatif à la transformation). Plaquez 5 l et 50 l sur des plats de livre contenant l'antibiotique approprié.
  • 21. Sélectionnez les colonies et isolez l'ADN de plasmide. (voir le protocole relatif à l'isolement d'ADN de plasmide).
  • 22. Assimilez l'ADN avec de l'enzyme de restriction qui ne coupera pas le plasmide nouvellement subi une mutation. (voir le protocole relatif à la digestion d'enzymes de restriction).
  • 23. Ordonnancez ceux copie qui ne sont pas assimilés par l'enzyme spécifique de restriction dont le site a été subi une mutation (voir le protocole relatif à ordonnancer l'ADN). Ce sont copie qui devraient contenir la mutation site-dirigée (conseil # 6).
  • Solutions et mémoires tampons

     

    Cellules electrocompetent du mut S des cellules BMH 81-17 du mut S des cellules BMH 81-17 du mut S de BMH 81-17

    Voir le protocole relatif à faire les cellules electrocompetent

     

    Mémoire tampon 10 millimètre Tris de TE

    pH 8.0

    EDTA de 1 millimètre

     

    Plats de Livre

    Mémoire de plats de livre à 4°C jusqu'à ce que nécessaire
    Bacto-agar de 15 g/liter
    Laissez frais à 50°C avant d'ajouter tous les antibiotiques.
    Préparez en livre
    Le flacon de remous et versent le plat d'approximativement 30 ml/petri (100 millimètres).
    Laissez les medias réglés.
    éthanol de 95% (v/v)
    Stérilisez par la stérilisation à l'autoclave pendant 20 minutes à une pression de pouce de 15 pounds/square sur le cycle liquide.


    Bouillon de Luria (livre) NaCl de 5 g/liter
    extrait de levure de 5 g/liter
    tryptone de 10 g/liter
    1 ml/liter NacOh de 1 M


    NacOh de 1 M

    Solution de livre Electroporation 1 ml de mémoire tampon de livre
    10 millimètres de sulfate de magnésium
    0.4% glucose (w/v)


    Cellulesα DH5

    DH5α cellules electrocompetentα des cellules DH5
    Voir le protocole relatif à faire les cellules electrocompetent

     

    BioReagents et produits chimiques :

    • EDTA
    • Sulfate de Magnésium
    • Tris
    • Hydroxyde de Sodium
    • Chlorure de sodium
    • Bacto-Agar
    • Extrait de levure
    • Tryptone
    • Antibiotique
    • Éthanol
    • Glucose

     

    Extrémités de Protocole :

    1. Tapez les cellules vers le bas au bas de la cuvette de sorte que les cellules forment une couche uniforme d'un côté à l'autre. Essayez d'éviter tous les grands bulles d'air.

    2. La constante de temps devrait être de 7.0 à 7.5 millisecondes en tant que moins de 6.5 millisecondes donnent la viabilité réduite, moins de 4 donne une petite explosion, généralement d'une concentration ionique trop élevée dans les échantillons. Si la constante de temps est 8 plus grands que, l'efficacité de l'electroporation est basse. Si un quelconque de ces conditions résultent, prenez une cuvette, un échantillon, des cellules et un essai frais encore. Autrement, contrôlez la compétence des cellules et repurify l'ADN.

    3. Cette étape est employée pour contrôler l'efficacité d'electroporation. La fréquence d'electroporation de l'ADN linéaire est au sujet d'mille-plient moins efficace que l'ADN circulaire de plasmide. Puisqu'une partie considérable de l'ADN sera linéaire en utilisant ce protocole, l'efficacité globale par microgramme d'ADN sera moins que l'efficacité prévue habituelle.

    4. Si vous avez beaucoup de différents mutants, deux tubes de microcentrifuge par clone de mutant suffiront.

    5. Les contribuants de ce protocole purifient l'ADN en chargeant le reste du mélange de sommaire de restriction sur une colonne du biogel™ P10. Épurez conformément aux recommandations du constructeur.

    6. Pour les changements de base simples de l'ADN de cible, habituellement 100% des minipreps choisis aura le bon ordre subi une mutation. Pour des mutations plus compliquées, cette fréquence change de 10 à 100%.

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