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La Science, en bas, est vraiment anti-intellectuelle. Elle méfiee toujours de la raison pure, et exige la production du fait objectif. ~H.L. Mencken, Minorité Enregistrent : Notebook de H.L. Mencken's, 1956
Une molécule avec une charge nette se déplacera un champ électrique. Ce phénomène, nommé électrophorèse offre des moyens puissants de séparer des protéines et d'autres macromolécules telles que l'ADN et l'ARN. La vitesse du transfert d'une protéine (ou de toute molécule) dans un champ électrique dépend de la force de champ électrique, de la charge nette sur la protéine et du coefficient de friction.
La force électrique pilotant la molécule chargée vers l'électrode à l'opposé chargée est opposée par la drague méchante résultant du frottement entre la molécule mobile et le support. Le coefficient de friction dépend de la masse et de la forme de la molécule de passer et de la viscosité du support.
La séparation d'électrophorèse est presque toujours effectuée en gels (ou dans les supports pleins tels que le papier) plutôt que dans la solution libre pour deux raisons. Les premiers gels suppriment les courants connectifs produits par de petits gradients de la température, une condition pour la séparation pertinente. Les deuxièmes gels servent de passoirs moléculaires qui mettent en valeur la séparation. Molécules qui sont petites comparées aux pores dans le mouvement de gel aisément par le gel, tandis que les molécules beaucoup plus grandes que les pores sont presque immobiles. les molécules d'Intermédiaire-taille se déplacent par le gel avec de divers degrés de service. Les gels de polyacrylamide sont des medias supportants de choix pour l'elelectrophoresis parce qu'ils sont chimiquement inertes et sont aisément constitués par la polymérisation de l'acrylamide. D'ailleurs, leurs tailles de pore peuvent être contrôlées en choisissant de diverses concentrations d'acrylamide et de methylenebisacrylamide (un réactif d'édition absolue) au moment de la polymérisation.
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