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Prévision de Structure de Protéine

Les outils de Bioinformatic peuvent prévoir la structure d'une protéine dans 2-dimensions (2-D) ou trois-dimensions (3-D). Ceci peut ne pas être une vraie représentation de la structure réelle d'une protéine, toutefois c'est un bon point de départ pour prévoir les poches enzymatiques, et des domaines d'interaction de protéine-protéine. Après prévision, la confirmation de la structure de protéine peut être faite en utilisant des techniques de cristallographie de rayon X.

Les programmes de Bioinformatic prévoyaient la structure secondaire :

(voir s'il vous plaît la notre protéine structurer la base de données d'outils de Bioinformatic de prévision pour la 2-D prévision ;

et la prévision Bioinformatic de structure de protéine usine la base de données pour la prévision 3-D.; et notre base de données pour rechercher des données de structure de protéine des bases de données 3-Dimensional.

Des données expérimentales peuvent être employées pour aider en structure de protéine de prévision. Ce qui suit sont des expériences qui peuvent aider dans l'analyse de structure de protéine :

- localisation des obligations du bisulfure (fournissez les contraintes serrées sur l'emplacement des cystéines dans l'espace)

- données de spectroscopie qui peuvent donner des indices à la composition secondaire de structure de votre protéine d'intérêt

- les expériences de mutagénèse dirigées par site, (substituant l'alanine une aile du nez pour différents acides aminés et puis contrôlant la fonction de la protéine) qui peut donnent l'perspicacité importante aux résidus qui sont importants dans le site actif d'une enzyme ou des accepteurs agissants l'un sur l'autre ou des domaines de protéine-protéine.

- obtenez les données expérimentales des modifictions poteau-de translation (les sites par exemple de phosphorylation et de glycosylation peuvent suggérer les résidus qui doivent être extérieurement accessibles et peuvent être ainsi les résidus extérieurs)

- sites protéolytiques de fendage.

Maintenir ces données dans l'esprit quand la conduite de la prévision de la structure de protéine est importante, en tant que ceci est des données structurales qui ont été experimentally.0 prouvés

Question si les prévisions de structure sont conformes aux résultats expérimentaux. Ceci peut tester la validité des structures prévues de protéine.