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bioinformatics d'analyse de mutational de protéine

Bioinformatics, Protocoles, Protéine Proteomics d'ARN d'ADN

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Analyse Bioinformatics de Mutational de Protéine.

Les outils de Bioinformatic peuvent prévoir la structure d'une protéine dans 2-dimensions (2-D) ou trois-dimensions (3-D). Ceci peut ne pas être une vraie représentation de la structure réelle d'une protéine, toutefois c'est un bon point de départ pour prévoir les poches enzymatiques, et des domaines d'interaction de protéine-protéine. Après prévision, la confirmation de la structure de protéine peut être faite en utilisant des techniques de cristallographie de rayon X.

Programmes de Bioinformatic utilisés aux mutations de protéine :

Analyse corrélée de mutations de protéine des mutations corrélées

MutaProt : Comparaison des fichiers de PDB qui diffèrent par des mutations de point

 

Des bases de données pour des mutations de protéine - utilisez ces la base de données pour rechercher des mutations connues de protéine :

PMD : Base de données de Mutant de Protéine

PMR : Ressources de Mutant de Protéine

HGVS : Société Humaine de Variation de Génome

Polymorphismes simples de nucléotide pour la recherche biomédicale : Consortium de SNP

Recherche Simple de Nom des Textes d'Entrez Pubmed de Polymorphismes de Nucléotide

 

Les outils de Bioinformatic peuvent prévoir l'effet des mutations sur la fonction secondaire de structure et de protéine. Vous pouvez comparer les résultats du sauvage-type protéine à la protéine de mutant et examiner des effets possibles prévus de la mutation.

En outre, les données expérimentales sont nécessaires pour confirmer n'importe quelle prévision bioinformatic des mutants de protéine. Ceci peut être fait en examinant les résidus principaux dans la fonction de protéine ou les domaines d'interaction de protéine en utilisant la substitution d'aile du nez (alanine) et analyser les données expérimentales qui résultent.

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