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Applications des Microarrays de protéine

Microarrays de protéine et d'anticorps

Applications de puce de protéine

Applications des puces de protéine
1) Proteomics
            Les technologies de puce de protéine fourniront un puissant, haut-débit et l'outil souple pour génome-mesurent l'analyse de la fonction de gène (voir le schéma 4).  L'activité enzymatique, les interactions de protéine-protéine et de protéine-nucléique-acide, et les interactions médicamenteuses de petit-molécule peuvent tout être analysées directement au niveau de protéine (77.78).  Des alignements peuvent être machinés pour adresser l'identification de protéine, la quantitation, et les études d'affinité.  Un alignement de profilage peut doser des niveaux des protéines spécifiques sur une échelle globale tenant compte d'une comparaison des états de normale et de maladie.  Un alignement d'affinité peut analyser les interactions des peptides, les protéines, les oligonucléotides, les sucres, les lipides, ou les petits molécules et produits chimiques avec les protéines immobilisées telles que des récepteurs, des enzymes, ou des anticorps (8). 
            Actuel, l'étape cadence-limiteuse est la production d'un grand nombre de protéines. La capacité d'automatiser la production et les protéines de protéine fondues aux étiquettes de haut-affinité accélérera considérablement le développement de protéine-puce.  Les puces à haute densité contenant de grands ensembles de protéines ou même de proteomes entiers permettront l'analyse de haut-débit des activités biochimiques, des interactions de protéine-protéine et des modifications poteau-de translation, telles que la phosphorylation, la dephosphorylation, la méthylation de protéine, et l'ubiquitination.

            L'objectif ultime du proteomics est aux activités biochimiques d'étude de chaque protéine encodée par une organization ou un proteome.  Une étude de borne limite entreprise a préparé la première puce de proteome en copiant ~94% (>5800 de 6200) des trames de lecture ouvertes de levure dans un vecteur d'expression de levure qui a exprimé les protéines comme le N-terminal GST-Son x6 doublent des fusions étiquetées.  Une méthode de purification de protéine de levure de haut-débit a été développée pour épurer individuellement des protéines. 80% de protéines de levure étaient intégraux et de quantité suffisante pour être discernables par la plupart des types d'analyse. Les protéines ont été alors épurées utilisant les étiquettes de GST et ont été alors attachées aux plaques en verre Ni-NTA-enduites utilisant les étiquettes HisX6.  En plus d'identifier des interactions connues, 33 protéines obligatoires originales ont été détectées.  150 protéines lipide-contraignantes originales ont été également identifiées.  Cette étude a expliqué qu'un proteome entier peut être immobilisé sur une surface en verre pour examiner directement pour des interactions avec les protéines et les petites molécules (26).
            Le couplage des puces de masse-spectrométrie et de protéine aura des applications larges en identifiant des joueurs dans des interactions de protéine-protéine, et également dans la découverte de drogue (80).  Les protéines et les ligands de petit-molécule bondissent aux protéines immobilisées sur la puce peuvent être identifiés utilisant le temps matrice-aidé de désorption/ionisation de laser de la spectroscopie de masse du vol (MADLI-TOF).  Des formats de Microwell sont en particulier adaptés à cette fin. Ainsi, des molécules et les protéines qui lient spécifiquement à beaucoup de différentes protéines peuvent être identifiées et cette information peuvent être employées pour déduire les réseaux et les voies moléculaires.
            Une zone qui exigera des améliorations technologiques est l'analyse des protéines de membrane.  Un grand nombre de protéines sont susceptibles d'être membrane-bondissent, puisqu'autant de car un tiers de toutes les protéines de levure sont des protéines de membrane ou des protéines sécrétées (81). Étant donné que plusieurs de ces protéines sont en activité quand dans des membranes, il peut donc être nécessaire de les épurer ou reconstituer avec des lipides associés. Cependant, ceci peut ne pas être si difficile. Un groupe pouvait immobiliser les membranes biotinylated qui contiennent le rhodopsin G-protéine-couplé de récepteur sur une surface en verre gold-coated, et établit une analyse fonctionnelle pour cette protéine (82).  Les procédures semblables peuvent permettre pour analyser des protéines de membrane dans un format de puce.
2) diagnostics
Une autre zone qui tirera bénéfice des zones de protéine est des diagnostics. L'analyse fortement parallèle sur des alignements permettra la détermination des repères de la maladie (par exemple repères de tumeur) en extraits avec seulement un minimum de matériel de biopsie (échantillon), créant de nouvelles possibilités pour surveiller le traitement de la maladie (cancer) et la thérapie (83).

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Ensuite : Microarrays de protéine : Futures directions et conclusions

Références pour des Microarrays de protéine et d'anticorps

De nouveau à :

Introduction et fond aux puces de protéine et aux puces d'anticorps.

Types de puces d'anticorps et de protéine

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