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Limitations de Microarray d'Anticorps

Protéine et anticorps Microarrays

Problèmes et solutions possibles pour l'anticorps Microarrays

Disponibilité des anticorps
            Un autre défi aux alignements d'anticorps doit obtenir des anticorps contre ≥ les 100.000 protéines qui comportent le proteome humain.  Il y a actuel une fraction très petite des anticorps disponibles du proteome.  En outre, la spécificité de plusieurs de ces anticorps est mal documentée et des anticorps supplémentaires peuvent être exigés à
permettez la détection des modifications poteau-de translation.  La détection des protéines par des interactions–d'antigène d'anticorps est également caractérisée par un large intervalle de spécificité et d'affinité.  En outre, il est difficile d'obtenir un grand ensemble d'anticorps fortement spécifique
molécules. Par conséquent, la plupart des alignements d'anticorps sont limités dans leur utilisation et contiennent quelques agents bien définis de saisie dirigés à une classe particulière des repères de protéine (9.17) 
- ne pas agir glycosylation semblable

D'autres problèmes se posant à l'anticorps Microarrays et aux solutions possibles
Les stratégies classiques de la génération d'anticorps par l'immunisation animale semblent être impraticables. Les bibliothèques de recombinaison d'affichage d'anticorps sont plus prometteuses (59-61). Récemment, beaucoup de méthodes de recombinaison de produire des anticorps ont été étudiées.
Celles-ci incluent bactériophage anticorps-affichent, affichage de ribosome, SELEX (évolution systématique des ligands par enrichissement exponentiel), affichage de mRNA, et affichage affibody, qui a été développé pour avancer la production des anticorps et/ou des imitateurs d'anticorps (16.54.56.62).  Ces méthodes toutes comportent la construction de grands répertoires des régions viables de l'activité obligatoire potentielle, qui sont alors choisies par les ronds multiples des purifications d'affinité. Le candidat copie peut être encore choisi en utilisant la sélection de maturation qui améliore des affinités obligatoires.  Cependant, un système idéal de sélection, qui est rapide, robuste, sensible, à prix réduit, automatisé, et réduit au minimum, doit être entièrement développé encore (16.54).  Ces plus petits fragments d'anticorps habituellement ont diminué l'activité hétérospécifique et les propriétés semblables lors de la connexion (7.8.9.27).
En outre parce que les anticorps de recombinaison ont une affinité potentiellement élevée, spécificité élevée, et leur plus petit poids moléculaire, qui est habituellement le kDa environ 30 tandis que les anticorps non-de recombinaison sont le kDa environ 150, dense et orientée la connexion sur des surfaces de support est facilitée (63.64).
            Les anticorps ne sont pas les seules molécules qui peuvent lier des protéines.  Aptamers sont des oligonucleotids courts qui peuvent lier et réticuler les protéines covalentes de cible.  Ceci facilite
des états plus élevés de lavage de raideur qui favorise la détection de l'attache spécifique.  En outre, ces molécules sont facilement choisies, rangées, et synthétisées.  La cible épurée de protéine est une condition pour leur usage cependant, et les aptamers peuvent montrer l'attache décentrée pendant que RNAs tendent fortement à être négativement chargés (9). Un groupe (Somalogic) avait l'habitude récemment l'aptamer anti-humain immobilisé de l'immunodéficit virus-gp120 pour détecter des concentrations subnanomolar de protéine de cible en sérum humain de 5% (65). 

Ensuite : Méthodes et analyse de détection de Microarray de protéine

Références pour la protéine et l'anticorps Microarrays

De nouveau à :

Introduction et fond aux puces de protéine et aux puces d'anticorps.

Types de puces d'anticorps et de protéine