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| TESS : Système de recherche d'élément de transcription - http://www.cbil.upenn.edu/tess/ Le TESS est un outil de Web pour prévoir les accepteurs de facteur de transcription dans des ordres d'ADN. Elle peut identifier les accepteurs utilisant des chaînes de caractères de site ou de consensus et les matrices de position de poids du TRANSFAC, d'IMD, et de notre base de données de CBIL-GibbsMat. Vous pouvez également inclure - [lu plus de TESS : Système de recherche d'élément de transcription] |
| OligoAnalyzer - http://www.idtdna.com/analyzer/Applications/OligoAnalyzer/Default.aspx Outil d'OligoAnalyzer pour l'analyse d'oligonucléotide. Inclut l'analyse des épingles à cheveux, de l'individu-dimérisation, de la hetero-dimérisation et de tout autre paramètre. - [Lu plus d'OligoAnalyzer] |
| TFSEARCH : Recherchant les accepteurs de facteur de transcription - http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html TFSEARCH : Recherchant les accepteurs de facteur de transcription, le Japon - [lu plus de TFSEARCH : Recherchant les accepteurs de facteur de transcription] |
| PromoterScan 2 - http://bimas.dcrt.nih.gov/molbio/proscan/ PromoterScan 2 - [lu plus de PromoterScan 2] |
| Prévision d'instigateur - http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html Outil de recherche d'Eukaryote et d'instigateur de Prokaryote, par le réseau neurologique à LBNL - [lu plus de prévision d'instigateur] |
| Détecteur d'instigateur de dragon - http://research.i2r.a-star.edu.sg/promoter/promoter1_5/DPF.htm Détecteur d'instigateur de dragon - [lu plus de détecteur d'instigateur de dragon] |
| ClustalX - http://www-igbmc.u-strasbg.fr/BioInfo/ClustalX/ Clustal X est une version du programme multiple de cadrage d'ordre de Clustal W avec une interface graphique. Les couleurs d'affichage permettent aux dispositifs économisés d'être mis en valeur pour le visionnement facile en cadrage. Il est disponible pour plusieurs plates-formes, y compris des WI - [lu plus de ClustalX] |
| Chercheur d'île de CpG - http://www.uscnorris.com/cpgislands2/cpg.aspx Le chercheur d'île de CpG examine votre ordre pour les îles de CpG qui répondent aux critères. - [Lu plus de chercheur d'île de CpG] |
| Outil d'analyse d'instigateur de MatInspector. - http://www.genomatix.de/products/MatInspector/index.html Outil d'analyse d'instigateur de MatInspector. Grand outil pour l'analyse factorielle de transcription des instigateurs. Le besoin de s'enregistrer. Accès limité aux matrices. - [Lu plus d'outil d'analyse d'instigateur de MatInspector.] |
| Outils d'analyse de normalisation d'ordre - http://rsat.ulb.ac.be/rsat/ Centaines d'espèces - éléments de normalisation d'ordre - [outils d'analyse plus de normalisation lus d'ordre] |
| Primer3 - http://frodo.wi.mit.edu/cgi-bin/primer3/primer3_www.cgi Primer3 : sélectionnez les amorces d'un ordre d'ADN. Grand programme. - [Lu plus de Primer3] |
| PromoterInspector - http://www.genomatix.de/shop/index.html PromoterInspector. Le besoin de s'enregistrer d'abord. - [Lu plus de PromoterInspector] |
| Conception interactive d'amorce de GeneFisher - http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/genefisher/ Outil de conception interactif d'amorce de GeneFisher. - [Lu plus de conception interactive d'amorce de GeneFisher] |
| Outil de directives de conception de shRNA de lien de gène - http://www.genelink.com/sirna/shRNAi.asp Outil de directives de conception de shRNA de lien de gène. Outil de conception de shRNA d'explorateur de RNAi - [lu plus d'outil de directives de conception de shRNA de lien de gène] |
| TransFac - http://www.gene-regulation.com/pub/databases.html#transfac TRANSFAC® est la base de données sur des facteurs eucaryotiques de transcription, leurs accepteurs genomic et des profils ADN-contraignants. - [Lu plus de TransFac] |
| Le traçage de CpG GRAVENT - http://www.ebi.ac.uk/emboss/cpgplot/ en refief La détection des régions des ordres genomic qui sont riches en configuration de CpG est importante parce que de telles régions sont résistantes à la méthylation et tendent à être associées aux gènes qui sont fréquemment branchés. Des régions riches en configuration de CpG sont connues comme C - [lu plus de traçage de CpG GRAVEZ EN REFIEF] |
| Cister : détecteur de batterie de Cis-élément - http://zlab.bu.edu/~mfrith/cister.shtml Cister : détecteur de batterie de Cis-élément - [lu plus de Cister : détecteur de batterie de Cis-élément] |
| Serveur de prévision de l'instigateur 2.0 - http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ Serveur de prévision de l'instigateur 2.0. Promoter2.0 prévoit des sites de début de transcription des instigateurs vertébrés de PolII dans des ordres d'ADN. Il a été développé comme évolution des facteurs simulés de transcription qui agissent l'un sur l'autre avec des ordres dans des régions d'instigateur. Il Bu - [indiqué plus de serveur de prévision d'instigateur 2.0] |
| Balayage d'instigateur de WWW - http://bimas.dcrt.nih.gov/molbio/proscan/ Balayage d'instigateur de WWW. Prévoit des régions d'instigateur basées sur des homologies de marquage avec des ordres eucaryotiques putatifs d'instigateur de Pol II. - [Lu plus de balayage d'instigateur de WWW] |
| CpGProD - http://pbil.univ-lyon1.fr/software/cpgprod_query.html CpGProD est un logiciel mammifère-spécifique qui propose d'identifier les régions d'instigateur liées aux îles de CpG (CGIs). CpGProD utilise les caractéristiques structurales du CGIs lié aux instigateurs (début CGIs). Dans une première étape, CpGProD recherche - [lu plus de CpGProD] |
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