Cadrage Multiple d'Ordre

Cette Trousse à outils est une collection d'un éventail d'outils et de liens pour l'analyse d'ordre, la fonction, et la prévision de structure. Cette ressource offre les interfaces convienent de Web pour beaucoup d'outils librement disponibles. - [lu plus de Trousse à outils de Bioinformatics]

Un serveur multiple de cadrage de structure de protéine qui crée un tout-à-tout par paires cadrage en utilisant un programme combinatoire d'extension et puis en utilisant des méthodes d'optimisation de Monte Carlo conduit une optimisation globale itérative. Des résultats sont formatés en utilisant JO - [lu plus de CE-MC]

Le serveur de CHAOS/DIALIGN WWW est un site multiple de cadrage d'ordre qui passe des ordres d'entrée par le CHAOS pour créer une liste de similarites locaux. Ces similitudes servent de points de point d'attache, permettant à DIALIGN de conduire des cadrages globaux plus rapidement. Bidon de ABC - [lu plus de serveur de CHAOS/DIALIGN WWW]

Cadrage multiple standard d'ordre. - [lu plus de ClustalW]

Clustal X est une version du programme multiple de cadrage d'ordre de Clustal W avec une interface graphique. Les couleurs d'affichage permettent aux dispositifs économisés d'être mis en valeur pour le visionnement facile en cadrage. Il est disponible pour plusieurs plateformes, y compris Wi - [lu plus de ClustalX]

Programme multiple de cadrage qui assemble un cadrage global d'ordre des cadrages intervalle-libres de gens du pays par paires. Cette méthode pourrait être particulièrement utile en comparant les grands ordres qui ont seulement des similitudes locales. - [lu plus de DIALIGN]

Ce site fournit plusieurs outils de logiciel de bioinformatics emballés ensemble pour l'installation facile sur des ordinateurs de MacOSX. Le logiciel inclut des outils de NCBI, LES GRAVE EN REFIEF, ClustalW, Staden, T-Café et Primer3. - [lu plus d'eBioinformatics]

Suite diverse des outils pour l'analyse d'ordre ; beaucoup de programmes analagous à GCG ; aide sensible au contexte pour chaque outil. - [lu plus GRAVEZ EN REFIEF]

Un outil pour ombrager phylogénétique des ordres multiples des espèces étroitement liées. Ceci des analyses des cadrages multiples d'ordre peut être employé pour prévoir les éléments fonctionnels putatifs. - [lu plus d'eShadow]

Serveur étendu possédant un éventail d'outils pour la découverte de configuration dans des ordres d'ADN et de protéine aussi bien qu'en le texte. Les outils pour le cadrage multiple d'ordre, la découverte de gène, l'annotation de protéine, et d'autres applications existent également sur ce serveur. Un détail - [lu plus d'IBM Bioinformatics et groupe de découverte de configuration]

La trousse à outils de cadrage de LAGAN se compose des composants : CHAOS (un dispositif d'alignement par paires local optimalisé pour le non-codage, et d'autres régions mal économisées du génome), LAGAN (un programme par paires global fortement parametrizable de cadrage), Multi-LAGAN, et battage - [lu plus de LAGAN]

Le mauve est un outil autonome de logiciel pour construire des cadrages multiples de génome. - [ plus mauve lu]

Mulan est un outil d'alignement multiple d'ordre. Il utilise des algorithmes de roman tels que le tba et le multiTF pour exécuter respectivement des cadrages et pour découvrir les accepteurs de facteur de transcription. Des résultats peuvent être visualisés comme point-trace de différents cadrages d'ordre, ou - [lu plus de Mulan]

Le serveur de MyHits intègre plusieurs outils avec un foyer sur l'annotation de protéine et l'analyse des domaines de protéine. Les utilisateurs d'invité ont accès aux outils tels que ClustalW et T-Café et bases de données comme le Suisse-Prot, le Prosite et l'Interpro. L'enregistrement nous permet - [lu plus de MyHits]

Le programme structural de cadrage pour des protéines (COURROIE) est un programme Java-basé qui peut être exécuté au-dessus du Web en utilisant un navigateur permis par début de Web de Java ou être téléchargé et passage comme application autonome. Des cadrages peuvent être faits en utilisant une de plusieurs méthodes, inc. - [lu plus de COURROIE]

Outil d'alignement multiple d'ordre pour des ordres de protéine ; plus précis que ClustalW pour des ordres à l'identité de de 30% ; dans la sortie, les blocs économisés sont couleur codée pour indiquer la qualité du cadrage. - [lu plus de T-COFFEE]

le zPicture (par paires cadrage) et le multi-zPicture (cadrage multiple) sont les outils d'alignement Web-basés d'ordre basés sur le programme de cadrage de blastz. Des cadrages du zPicture peuvent être automatiquement soumis au rVista. - [lu plus de zPicture et de multi-zPicture]