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Génomique comparative
| Page d'annotation de génome d'IBM - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Annotations/home.html Les annotations Bio-Dictionnaire-basées d'IBM de la page remplie de génomes mentionne des annotations pour plus de 75 génomes complets (archae, bactéries, eurkaryotes, et virus). Vous pouvez questionner ces annotations au niveau d'ordre comme la recherche/comparent à travers des génomes. - [Lu plus de page d'annotation de génome d'IBM] |
| Génomes microbiens intégrés (IMG) - http://img.jgi.doe.gov/ Le système microbien intégré des génomes (IMG) facilite la comparaison des génomes ordonnancés par l'institut commun de génome (JGI). Il peut être recherché utilisant des mots-clés ou BLASTp, et les enregistrements de gène diplayed incluent les propriétés biochimiques, domaines de protéine, - [lu plus de génomes microbiens intégrés (IMG)] |
| Base de données de ordonnancement de grande puissance de projet d'ISC - http://www.intlgenome.org/viewDatabase.cfm La base de données de ordonnancement de grande puissance de ordonnancement internationale de projet du consortium (ISC) contient l'information sur le courant et remplie ordonnançant des projets, y compris des chronologies de projet, des agences de placement, ordonnançant la stratégie et les liens dehors pour projeter des pages Web. - [Lu plus de base de données de ordonnancement de grande puissance de projet d'ISC] |
| Mauve - http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve/documentation.php Le mauve est un outil logiciel autonome pour construire des cadrages multiples de génome. - [Plus mauve lus] |
| MIPS - http://mips.gsf.de/ Le centre d'information de Munich pour des projets d'ordres de protéine incluent : analyse fongique de génome, bio-informatique de génome d'usine, annotation structurale de génomique, de proteomics et de génome. Les projets et les bases de données incluent : CYGD, MNCDB, NGFN, MPPI, SIMAP, QUIPOS, MATDB, M - [lu plus de MIPS] |
| NEMBASE2 - http://zeldia.cap.ed.ac.uk/nematodeESTs/nembase.html NEMBASE2 est une ressource de base de données pour des ensembles de données d'est pour 37 espèces de nématode. Des ordres sont groupés au redundacy de redunce. Les comparaisons peuvent être par la bibliothèque et à un niveau d'ordre ; un outil de visualisation est inclus. Prévisions de région de codage pour chaque batterie, - [lu plus de NEMBASE2] |
| PartiGeneDB - http://www.partigenedb.org/ PartiGeneDB est une base de données d'environ 300 génomes partiels des organizations eucaryotiques qui ont été assemblées à partir des données d'est. - [Lu plus de PartiGeneDB] |
| PhenomicDB - http://www.phenomicdb.de/ PhenomicDB intègre l'information de génotype et de phénotype de plusieurs organizations des points d'émission de données publics. La cartographie des zones d'information phénotypiques permet la comparaison hétérospécifique de phénotype. - [Lu plus de PhenomicDB] |
| Sockeye - http://www.bcgsc.ca/gc/bomge/sockeye/ Le Sockeye est un outil de visualisation permettant à on de compiler et analyser l'information genomic dans une zone de travail tridimensionnelle. Il peut être employé pour visualiser des dispositifs à de divers niveaux, s'étendant de SNPs aux karyotypes. Le Sockeye affiche les dispositifs genomic le long des pistes - [lu plus de Sockeye] |
| Outils logiciels de TIGR - http://www.tigr.org/software/ Une liste de progiciels d'ouvrir-source disponibles pour exempt de l'institut pour la recherche de Genomic (TIGR). - [Lu plus d'outils logiciels de TIGR] |
| TraFaC - http://trafac.cchmc.org/trafac/index.jsp TraFaC (comparaison d'accepteur de facteur de transcription) est un outil que les régions de normalisation d'identifes utilisant une analyse comparative d'ordre approchent. - [Lu plus de TraFaC] |
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