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Sites Web contenant la bio-informatique proteomic et les bases de données proteomic.
| Outils d'ExPASy Proteomics - http://us.expasy.org/tools/ Divers outils pour l'identification et la caractérisation de protéine, les recherches par similarité, les recherches de configuration et de profil, la prévision poteau-de translation de modification, et plus. - [Lu plus d'outils d'ExPASy Proteomics] |
| GELBANK - http://gelbank.anl.gov/ GELBANK est une base de données des 2D images de gel des proteomes pour des espèces avec les génomes réalisés. L'utilisateur peut rechercher par description ou fragment d'ordre, ou par des caractéristiques de gel. Des liens sont faits entre l'ordre et le gel si disponibles. - [Lu plus de GELBANK] |
| GoMiner - http://discover.nci.nih.gov/gominer/ GoMiner organise et permet la visualisation de grands ensembles de gènes basés sur des classifications d'Ontology de gène. - [Lu plus de GoMiner] |
| Base de données de référence humaine de protéine - http://www.hprd.org/ La base de données de référence humaine de protéine (HPRD) est une ressource centralisée pour des informations sur les protéines humaines, leurs interactions avec d'autres protéines humaines, et des rapports de la protéine-maladie. L'information contenue dans HPRD curated par les experts, qui manu - [la base de données de référence plus humaine lue de protéine] |
| Initiative de normes de HUPO Proteomics - http://psidev.sourceforge.net/ L'initiative de normes de HUPO Proteomics (PSI) fournit des normes de représentation de données pour faciliter l'échange, la comparaison et la validation des données de proteomics. - [Lu plus d'initiative de normes de HUPO Proteomics] |
| ISOTOPICA - http://coco.protein.osaka-u.ac.jp/isotopica/ Les outils se sont développés pour faciliter l'identification du spectre de masse qui permettent le calcul des valeurs de masse avec des distributions isotopiques basées sur des formules moléculaires, des peptides/protéines, DNA/RNA, des ordres d'hydrate de carbone ou des combinaisons en. Un visualisateur pour le visu - [lu plus d'ISOTOPICA] |
| KCaM - http://glycan.genome.ad.jp/ La bouveteuse d'hydrate de carbone de KEGG (KCaM) prend les structures glycan comme entrée et renvoie une liste de structures glycan semblables utilisant un algorithme de cadrage d'arbre-structure. - [Lu plus de KCaM] |
| MASCOTTE (la Science de matrice) - http://www.matrixscience.com/ Identification de protéine par la masse de peptide ; excellente documentation ; incorpore le code de MOWSE mais laisse plus de méthodes de recherche sur plus de bases de données d'ordre. - [Lu plus de MASCOTTE (la Science de matrice)] |
| Pedro - http://pedro.man.ac.uk/ Logiciel et schémas pour modeler, saisir et diffuser des données expérimentales de proteomics - [lu plus de Pedro] |
| PeptIdent - http://us.expasy.org/tools/peptident.html PeptIdent est un outil qui permet l'identification des protéines utilisant pi, le Mw et les données de masse d'empreinte digitale de peptide. - [Lu plus de PeptIdent] |
| ProMoST - http://prometheus.brc.mcw.edu/promost/ ProMoST (outil de criblage de modification de protéine) est un programme pour calculer des valeurs précises de MW et de pi des protéines considérant les effets des modifications poteau-de translation. Des résultats sont affichés en tant que valeurs calculées de pi et de MW pour chaque protéine et sont - [lu plus de ProMoST] |
| ProSight PTM - https://prosightptm.scs.uiuc.edu/ ProSight PTM permet l'identification des protéines et de leurs modifications poteau-de translation (PTM) utilisant les données de spectres de masse de la fragmentation de dessus-down'de `des ions intacts de protéine (c.-à-d. sans toute digestion tryptique). - [Lu plus de ProSight PTM] |
| ProteinProspector - http://prospector.ucsf.edu/ Divers outils utilisés pour l'exploitation de base de données d'ordre en liaison avec des expériences de spectrométrie de masse. - [Lu plus de ProteinProspector] |
| Proteios - l'initiative d'Open Source Proteomics - http://www.proteios.org/ Proteios est une initiative pour créer une mémoire d'ouvrir-source, une analyse et un système d'organisation pour des expériences de proteomics. - [Lu plus de Proteios - l'initiative d'Open Source Proteomics] |
| Analyse de Proteome à EBI - http://www.ebi.ac.uk/proteome/ La base de données d'analyse de Proteome à EBI fournit des analyses statistiques et comparatives des proteomes prévus des organizations pour lesquelles il y a les génomes plein-ordonnancés. - [Lu plus d'analyse de Proteome à EBI] |
| Analyste de Proteome - http://www.cs.ualberta.ca/~bioinfo/PA/ L'analyste de Proteome est un outil de haut-débit pour prévoir des propriétés pour chaque protéine dans un proteome. L'utilisateur fournit un proteome dans le format de fasta, et le système emploie le PSI-souffle, le Psipred et le modéliseur pour prévoir la fonction de protéine et le localiza sous-cellulaire - [lu plus d'analyste de Proteome] |
| proteomicsSURF - http://proteomicssurf.com ProteomicsSURF est consacré pour fournir des informations de Web sur des technologies de proteomics et son proteomics appliqué. - [Lu plus de proteomicsSURF] |
| VAGABONDAGE - http://prowl.rockefeller.edu/ Outils logiciels et bases de données intégrées pour faciliter analyser la sortie des expériences de spectrométrie de masse de protéine. - [Lu plus VAGABONDAGE] |
| La machine globale de Proteome - http://thegpm.org/ Le projet global de la machine de Proteome (gal/mn) facilite l'analyse des proteomes pour des chercheurs utilisant la spectrométrie de masse tandem. Les objectifs du projet incluent fournir une plate-forme commune de validation et de test pour des résultats, faisant aux résultats plus de portab - [plus indiqué la machine globale de Proteome] |
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