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| AACompIdent - http://www.expasy.org/tools/aacomp/ AACompIdent. Identifiez une protéine par sa composition en acides aminés. ExPASY. - [Lu plus d'AACompIdent] |
| Outil d'AACompSim - http://www.expasy.org/tools/aacsim/ AACompSim est un outil qui permet à la comparaison de la composition en acides aminés d'une entrée de Suisse-Prot avec toutes autres entrées de Suisse-Prot afin de trouver les protéines dont les compositions en acides aminés sont les plus proches de celle de l'entrée choisie. ExPASY. - [Indiqué plus d'outil d'AACompSim] |
| Aldente - http://www.expasy.org/tools/aldente Aldente. Identifiez les protéines avec des données d'empreinte digitale de la masse de peptide. Un nouveau, rapide et puissant outil qui tire profit de la transformation de Hough pour le recalibrage de spectres et l'exclusion d'annexe. ExPASy - [lu plus d'Aldente] |
| CysView - http://research.i2r.a-star.edu.sg/CysView/ Les prises de CysView comme divers formats annotés d'entrée des ordres de protéine, et affiche graphiquement la cystéine appareillant des configurations. Elle groupe également des protéines avec les configurations semblables de connectivité du bisulfure. - [Lu plus de CysView] |
| FindMod - http://www.expasy.org/tools/findmod/ Prévoyez les modifications poteau-de translation de protéine potentielle et les substitutions simples potentielles d'acide aminé en peptides. Les masses expérimentalement mesurées de peptide sont comparées aux peptides théoriques calculés à partir d'une entrée spécifique de Suisse-Prot. ExPASy - [lu plus de FindMod] |
| FindPept - http://www.expasy.org/tools/findpept.html Identifiez les peptides qui résultent du fendage non spécifique des protéines de leurs masses expérimentales, prenant en considération des modifications chimiques artefactual, les modifications poteau-de translation (PTM), fendage autolytique de protéase. ExPASy - [lu plus de FindPept] |
| GDAP - http://www.doe-mbi.ucla.edu/Services/GDAP Le programme d'analyse du bisulfure de Genomic (GDAP) prévoit des liaisons disulfide pour un ordre écrit par l'utilisateur de protéine. GDAP permet d'accéder également aux prévisions pré-calculées des liaisons disulfide pour plus de 100 génomes microbiens. - [Lu plus de GDAP] |
| GlycoMod - http://www.expasy.org/tools/glycomod/ Prévoyez les structures possibles d'oligosaccharide qui se produisent sur des protéines de leurs masses expérimentalement déterminées (peut être utilisé pour les oligosaccharides libres ou dérivatisés et pour des glycopeptides). ExPASy - [lu plus de GlycoMod] |
| IsotopIdent - http://haven.isb-sib.ch/tools/isotopident/ IsotopIdent. Prévoit la distribution isotopique théorique d'un peptide, d'une protéine, d'une polynucléotide ou d'un composé chimique. - [Lu plus d'IsotopIdent] |
| ÉDITEUR DE LIENS - http://astro.temple.edu/~feng/Servers/BioinformaticServers.htm L'ÉDITEUR DE LIENS est un outil pour concevoir des ordres de peptide d'éditeur de liens pour l'usage dans la construction des protéines de fusion. L'utilisateur fournit la longueur désirée de l'éditeur de liens dans des angströms ou le nombre de résidus, et plusieurs autres contraintes peuvent également être spécifiées, inc. - [lu plus d'ÉDITEUR DE LIENS] |
| Mascotte - http://www.matrixscience.com/search_form_select.html Mascotte. Empreinte digitale de masse de peptide, requête d'ordre et recherche d'ion de MS/MS de Science Ltd, Londres de matrice. - [Lu plus de mascotte] |
| MultiIdent - http://www.expasy.org/tools/multiident/ MultiIdent. Identifiez les protéines avec pi, le Mw, la composition en acides aminés, l'étiquette d'ordre et les données de masse d'empreinte digitale de peptide. ExPASY. - [Lu plus de MultiIdent] |
| OMSSA - http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/omssa/ OMSSA. Identification de spectres de peptide de MS/MS en recherchant des bibliothèques des ordres connus de protéine. - [Lu plus d'OMSSA] |
| PepMAPPER - http://wolf.bms.umist.ac.uk/mapper/ PepMAPPER. Outil de masse d'empreinte digitale de peptide d'UMIST, R-U. - [Lu plus de PepMAPPER] |
| PepSea. - http://195.41.108.38/PepSeaIntro.html PepSea. Identification de protéine par le peptide traçant ou le peptide ordonnançant de Protana, Danemark - [lu plus de PepSea.] |
| La masse de peptide - http://www.expasy.org/tools/peptide-mass.html Massachusetts de peptide calculent les masses des peptides et de leurs modifications poteau-de translation pour une entrée d'UniProtKB/Suisse-Prot ou d'UniProtKB/TrEMBL ou pour un ordre d'utilisateur. ExPASY. - [Lu plus de masse de peptide] |
| Peptidecutter - http://www.expasy.org/tools/peptidecutter/ Coupeur de peptide. Prévoit les sites potentiels de protéase et de fendage et les sites fendus par des produits chimiques dans un ordre donné de protéine. ExPASY. - [Lu plus de Peptidecutter] |
| PeptideMass - http://us.expasy.org/tools/peptide-mass.html Fend un ordre de protéine avec de l'enzyme choisie et calcule les masses des peptides produits. - [Lu plus de PeptideMass] |
| PFMUTS - http://www.mcs.vuw.ac.nz/~aleksand/pfmuts/pfmuts.html PFMUTS. Affiche les mutations simples et doubles possibles d'un fragment de peptide de l'empreinte digitale de la masse de peptide de MALDI. - [Lu plus de PFMUTS] |
| Phenyx - http://phenyx.vital-it.ch/pwi/ Phenyx. Identification de protéine et de peptide/caractérisation des données de PMF et de MS/MS de GeneBio, Suisse - [lu plus de Phenyx] |
| Profond. - http://65.219.84.5/service/prowl/profound.html Pro trouvé est Search Engine de Proteometrics pour obtenir des ordres de protéine cette meilleure allumette une liste des masses de peptide. Il emploie un algorithme bayésien bien-testé pour identifier des protéines basées sur beaucoup de critères, comme : - [Plus profond lu.] |
| ProteinInfo - http://65.219.84.5/service/prowl/proteininfo.html L'information de protéine est Search Engine de Proteometrics obtenant les ordres de protéine qui apparient un motif particulier d'ordre. Des fragments d'information d'ordre peuvent être écrits et tous les ordres s'assortissant que la configuration dans une base de données particulière sont recherchées. Protéine - [lu plus de ProteinInfo] |
| ProteinProspector - http://128.40.158.151/mshome3.4.htm Prospecteur de protéine. Une série d'outils d'UCSF (Mme-Adaptez, Mme-Étiquette, Mme-Assimilent, etc.) pour des bases de données d'ordre d'exploitation en même temps que des expériences de spectrométrie de masse. - [Lu plus de ProteinProspector] |
| ProtParam - http://us.expasy.org/tools/protparam.html Poids moléculaire de calcul, pi théorique, composition en acides aminés, composition atomique, coefficient d'extinction, demi vie prévue, incrément d'instabilité, incrément aliphatique et moyenne grande de hydropathicity. - [Lu plus de ProtParam] |
| VAGABONDAGE - http://65.219.84.5/ProteinId.html VAGABONDAGE. Chimie de protéine et ressource de spectrométrie de masse de Rockefeller et d'universités de NY - [lu plus VAGABONDAGE] |
| Qgrid - http://www.netasa.org/qgrid/index.html Le serveur qui fournit des diagrammes d'arbre de batterie d'une protéine a basé sur les atomes ou le hydrophobicity chargés de chacun de ses résidus. Le diagramme tient compte de l'inspection visuelle de la distribution des régions hydrophobes et chargées en protéines. - [Lu plus de Qgrid] |
| Search Engine du sonar MS/MS. - http://65.219.84.5/service/prowl/sonar.html Le Search Engine du sonar MS/MS est Search Engine de Proteometrics pour identifier des protéines utilisant l'information de MS/MS des peptides de sommaire. Il a été conçu spécifiquement pour les besoins de l'automatisation d'identification de protéine, utilisant des concepts de découverte et conçoit t - [lu plus de Search Engine de sonar MS/MS.] |
| TagIdent - http://www.expasy.org/tools/tagident.html Identification d'étiquette. Identifiez les protéines avec pi, l'étiquette de Mw et d'ordre, ou produisez d'une liste de protéines près de pi et d'un Mw donnés. ExPASY. - [Lu plus de TagIdent] |
| Le dépôt d'acide aminé - http://www.imb-jena.de/IMAGE_AA.html Inclut les structures et les propriétés chimiques, l'accessibilité dissolvante, les modifications poteau-de translation, et plus ; avec des références. - [Plus indiqué le dépôt d'acide aminé] |
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