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Prévision de structure tertiaire de protéine. le pliage dimensionnel à trois dimensions des protéines a prévu utilisant les outils et le logiciel en ligne bioinformatic.
| CD-Recherchez - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi CD-Recherchez permet à l'utilisateur de rechercher la base de données économisée de domaine (CDD) des domaines structuraux et fonctionnels économisés dans un ordre d'intérêt ; liens aux structures à trois dimensions là où applicable. - [Lu plus CD-Recherchez] |
| Cn3D - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/CN3D/cn3d.shtml Application d'aide de web browser qui affiche simultanément la structure, l'ordre, et le cadrage à trois dimensions. - [Lu plus de Cn3D] |
| MMDB - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/MMDB/mmdb.shtml Base de données de modélisation moléculaire des structures à trois dimensions ; structures expérimentalement déterminées seulement. - [Lu plus de MMDB] |
| MONSTRE - http://monster.northwestern.edu/ Le MONSTRE prend un fichier de structure d'APB comme entrée, et prévoit les interactions de non-liaison qui ont le potentiel de fournir la stabilité à la molécule. La sortie peut être visualisée ou téléchargée comme XML ou texte, ou peut être visualisée comme structure 3D ou 2D diagramme. T - [lu plus de MONSTRE] |
| Groupe de structure de NCBI - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/ Bon point de départ avec des liens aux bases de données et aux outils. - [Lu plus de groupe de structure de NCBI] |
| APB - http://www.rcsb.org/pdb/index.html Banque de données de protéine ; inclut les structures théoriques. - [Lu plus d'APB] |
| PPG - http://bioserv.rpbs.jussieu.fr/cgi-bin/PPG Le générateur d'image de protéine (PPG) est un outil pour la fabrication des images (et des animations) des structures de protéine à partir des fichiers d'APB. - [Lu plus de PPG] |
| Bases de données structurales pratiques - http://xray.bmc.uu.se/embo/structdb/links.html Abrégé détaillé des liens pour structurer des bases de données, visualisateurs, outils. - [Bases de données structurales plus pratiques lues] |
| RasMol - http://www.bernstein-plus-sons.com/software/rasmol/ visualisateur à trois dimensions de structure, application d'aide de web browser. - [Lu plus de RasMol] |
| YASARA - http://www.yasara.org/ YASARA (encore une autre application artificielle scientifique de réalité) est un progiciel pour la visualisation, la simulation et la modélisation des molécules. Il utilise le langage portatif de vecteur (PVL) qui permet la visualisation des protéines très grandes. La vue de YASARA est poids du commerce - [lu plus de YASARA] |
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