Règlement de gène

Les POINTS CULMINANTS (engine assortie contente avancée pour des ordres) est un serveur qui peut être utilisé pour rechercher des répétitions courtes (entre 3 et 10 000 bases) à travers des espèces multiples. Les utilisateurs peuvent limiter des résultats d'une recherche par des recherches par mot-clé. - [Lu plus de POINTS CULMINANTS]

Traitez en lots l'extraction et l'analyse des régions cis-De normalisation (BEARR) prend une liste d'identificateurs de gène (tels que des IDs de RefSeq et d'Unigene), de configurations de consensus, et (sur option) d'une matrice de poids de position comme entrée et retours une liste d'allumettes pour les configurations dans le bot - [lu plus de BEARR]

Serveur qui balaye d'amont des gènes dans la même batterie d'expression de gène pour des motifs de normalisation d'ordre utilisant une stratégie de prélèvement de Gibbs. Le modèle de fond de Markov est utilisé pour des bases de non-motif, améliorant la spécificité des emplacements prévus de motif. - [Lu plus de BioProspector]

Serveur qui analyse le microarray et les données d'ordre d'instigateur liés à une réponse à un stimulus spécifique. Après analyse un réseau de normalisation transcriptional potentiel est créé. CARRIE détermine également quels facteurs de transcription étaient invol probable - [lu plus de CARRIE]

Le serveur qui essaye d'identifier tous les motifs a associé aux gènes prévus aux éléments de normalisation de part. Il modifie le prélèvement de Gibbs en polarisant des recherches vers des ordres économisés à travers des espèces multiples. - [Lu plus de CompareProspector]

Le détecteur économisé d'accepteur de facteur de transcription (CONFAC) prend une liste de noms humains et d'identificateurs de gène comme entrée, et les compare à leurs orthologues de souris pour identifier les accepteurs économisés de facteur de transcription. Les informations supplémentaires de t - [lu plus de CONFAC]

Détectez les accepteurs de facteur de transcription dans des ordres genomic utilisant l'empreinte phylogénétique et les profils obligatoires expérimental-confirmés. - [Lu plus de Consite]

La CRÈME (explorateur Cis-De normalisation de module pour le génome humain) est un outil pour identifier et visualiser les modules cis-de normalisation pour un ensemble donné de gènes qui Co-sont potentiellement exprimés ou Co-réglés. Elle prend comme entrée une liste de numéros de référence, et Re - [lu plus de CRÈME]

Ce site Web contient le logiciel d'analyse de microarray (Argus et Z-regroupement), une base de données endothéliale d'expression de cellules, et d'autres ressources liées à la recherche vasculaire d'endothélium. Voyez les abrégés sur PubMed pour plus d'information. - [Lu plus de programmes Transcriptional de définition dans l'endothélium vasculaire]

Usinez qui facilite la conception et le contrôle de qualité de petit RNAs de intervention (siRNAs) pour l'interférence d'ARN (RNAi) et l'amortissement de gène. Il évalue le pouvoir inhibiteur des ordres potentiels de siRNA aussi bien qu'identifier les régions de gène qui ont un sil élevé - [lu plus de DEQOR]

Base de données des accepteurs de facteur de transcription créés du curation de littérature et de l'annotation systématiques de génome des empreintes de pas de la DNase I pour la drosophile. - [Lu plus de base de données d'empreinte de pas de DNase I de drosophile]

Eponine est une méthode probabiliste pour détecter des sites de début de transcription (SOLIDES SOLUBLES TOTAUX) dans l'ordre genomic mammifère, avec la bonne spécificité et l'excellente exactitude de position. - [Lu plus d'Eponine]

Le premier détecteur d'Exon (FirstEF) est ' programme terminal de prévision de l'exon des 5 et de l'instigateur. Il se compose de différentes fonctions discriminantes structurées comme arbre de décision. - [Lu plus de FirstEF]

Accédez aux bases de données, aux programmes et aux papiers liés au règlement de gène. - [Lu plus de règlement de gène]

Serveur étendu possédant un éventail d'outils pour la découverte de configuration dans des ordres d'ADN et de protéine aussi bien qu'en le texte. Les outils pour le cadrage multiple d'ordre, la découverte de gène, l'annotation de protéine, et d'autres applications existent également sur ce serveur. Un détail - [lu plus de groupe de bio-informatique d'IBM et de découverte de configuration]

JASPAR est une collection non-redundant et curated de profils obligatoires de facteur de transcription. Chaque profil est produit des accepteurs édités et expérimentalement définis de facteur eucaryotique de transcription. - [Lu plus de JASPAR]

Recherche des accepteurs de facteur potentiel de transcription dans vos propres ordres utilisant des matrices de TRANSFAC ; libérez pour l'usage non-commercial. - [Lu plus de MatInspector]

Le serveur a conçu pour indiquer exactement des sites de l'interaction protéine-ADN aux paires de base de niveau. Les utilisations Puce-rangent des données, l'énumération de mot et la matrice position-spécifique de poids mettant à jour pour rechercher des motifs représentant ces sites d'interaction. - [Lu plus de MDscan]

MSCAN prend pendant que l'entrée un ou plusieurs ordres d'ADN et un ensemble de transcription factorisent des profils d'accepteur. Il détecte alors des batteries des accepteurs dans les ordres. - [Lu plus de MSCAN]

Le site Web du groupe humain de bio-informatique de la génétique de Cancer d'université de l'Etat d'Ohio. Ce site a beaucoup de ressources, y compris des bases de données des instigateurs et des facteurs de transcription, des outils logiciels pour prévoir les accepteurs du consensus P53 potentiel et à prévoir - [lu plus de bio-informatique d'OSU et de biologie de calcul]

Un serveur pour la détection, la comparaison et la vérification de la transcription factorisent des motifs d'accepteur dans les instigateurs. L'analyse d'amorce de POBO s'est appliquée à un ou deux batteries des gènes Co-réglés détecte des motifs sous les niveaux extrêmes de la représentation. - [Lu plus de POBO]

Compare deux ordres d'ADN tenant compte des inversions et des translocations, idéal pour des instigateurs. - [Lu plus de PromoterWise]

Base de données des familles et des domaines de protéine définis de la base de données de SwissProt ; envisagez de contrôler également les bases de données spécifiques de motif telles que PhosphoBase. - [Lu plus de PROSITE]

Réseau rechercheable de littérature des gènes humains avec des outils pour l'analyse d'expression de gène. Choisissez du service public libre, ou achetez le module commercial. - [Lu plus de PubGene]

Le programme de recherche de motif d'ARN qui identifie des motifs d'ARN a appelé les riboswitches qui sont des domaines obligatoires métaboliques dans l'ADN messagère qui règlent l'expression de gène. Le programme a été initialement conçu autour d'un ensemble de riboswitches trouvés dans Bacillus subtilis. - [Lu plus de détecteur de Riboswitch]

RiceTFDB (base de données de facteur de transcription de riz) est une base de données des ordres et des cadrages pour des facteurs de transcription en riz. - [Lu plus de RiceTFDB]

Serveur qui détecte les accepteurs de facteur de transcription (TFBS) en combinant la prévision de TFBS, comparaison d'ordre et analyse de batterie. - [Lu plus de rVISTA]

Serveur avec trois outils pour la conception raisonnable de petit RNAs de intervention (Sirna), d'oligonucléotides antisens (Soligo), et de transport-fendre des ribozymes (Sribo). Un quatrième outil, Srna, renvoie la sortie comprenant les dispositifs se pliants généraux. - [Lu plus de Sfold]

Serveur facilitant la conception de RNAs de intervention court (siRNAs) en fournissant des informations sur la stabilité, le SNPs et la spécificité d'un siRNA potentiel. - [Lu plus de serveur de sélection de siRNA]

Cette ressource inclut le siSearch, l'AOSearch, et un siRNAdb qui fournit une plate-forme pour le mien d'une base de données de siRNA, et rechercher les allumettes non spécifiques à votre siRNA (petit RNAs de intervention). - [Lu plus de siRNAdb]