Outils de Bioinformatic d'expression de gène et d'analyse de Microarray.
| Bingo-test - http://www.psb.ugent.be/cbd/papers/BiNGO/ Le bingo-test est un outil Java-basé pour déterminer quelles catégories d'Ontology de gène (ALLEZ) sont statistiquement surreprésentées dans un ensemble de gènes ou un sous-graphe d'un réseau biologique. - [Lu plus de bingo-test] |
| SERREZ - http://www.personal.psu.edu/faculty/n/h/nhs109/Clench/ Un programme pour calculer l'analyse d'enrichissement en batterie et la visualisation intégrée de l'expression, l'annotation et la transcription factorisent des données d'accepteur utilisant l'Ontology de gène. - [Lu plus SERREZ] |
| DAVID - http://david.niaid.nih.gov/ La base de données pour l'annotation, la visualisation et la découverte intégrée (DAVID) est un outil basé sur le WEB qui fournit les solutions intégrées pour l'annotation et l'analyse de génome-mesurent des ensembles de données dérivés des technologies de haut-débit telles que le microarray et le proteo - [lu plus de DAVID] |
| FACILITÉ - http://david.niaid.nih.gov/david/ease.htm Utile pour récapituler le « thème » biologique prédominant d'une liste donnée de gène. D'une liste de gènes de microarray ou d'autre génome-mesurez les expériences, FACILITÉ peut rapidement calculer des statistiques de surreprésentation pour chaque limite possible d'Ontology de gène avec du Re - [lu plus de FACILITÉ] |
| ermineJ - http://microarray.genomecenter.columbia.edu/ermineJ/ l'ermineJ est un outil pour l'analyse des positionnements de gène (définis pour l'utilisateur ou ceux définis près DISPARAISSENT les limites) dans des données d'expression. Le logiciel est conçu pour être employé par des biologistes avec peu ou pas de fond d'informatique. Une commande-ligne interface est disponible pour les utilisateurs qui - [lu plus d'ermineJ] |
| Données de microarray de gène-expression d'Ontologizing : - http://www.charite.de/ch/medgen/ontologizer/ On décrit une application de Java XML-basée qui fournit une vue d'ensemble fonction-orientée des résultats de l'analyse de batterie des données de microarray de gène-expression basées sur des limites et des associations d'Ontology de gène. L'application produit d'un HTML page avec le listi - [lu plus de données de microarray de gène-expression d'Ontologizing :] |
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