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Outils de prévision de gène, gènes de prévision logiciel et bio-informatique en ligne.
| Ordre du jour - http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/agenda/ L'ordre du jour est un outil de Web qui compare les ordres genomic des organizations evolutionarily relatives afin de faire des prévisions de gène. Il prend des paires d'ordres genomic comme entrée, aligne les ordres, et fait des prévisions basées sur des signaux d'épissure, début et - [lu plus d'ordre du jour] |
| AUGUSTUS - http://augustus.gobics.de/submission AUGUSTUS est un outil eucaryotique de prévision de gène utilisant une méthode plus précise pour modeler la distribution de longueur d'intron. Il est particulièrement pertinent avec de plus grands ordres. Il peut être exécuté par une interface de Web, ou être téléchargé et exécuter localement. - [Lu plus d'AUGUSTUS] |
| SOUFFLE - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ Outil local de base de recherche de cadrage ; recherchez les ordres semblables à votre requête. - [Lu plus de SOUFFLE] |
| GeneComber - http://bioinformatics.ubc.ca/genecomber/index.php GeneComber est ab initio un outil de prévision de gène développé au centre de bio-informatique d'UBC. Il intègre des résultats de deux détecteurs extérieurement développés de gène et traite les lieux qui si ces détecteurs de deux gènes conviennent sur une prévision, nous peuvent être plus de c - [lu plus de GeneComber] |
| GeneMark - http://opal.biology.gatech.edu/GeneMark/ La famille de GeneMark des programmes utilisent des modèles de Markov et sont spécifiquement accordées pour la prévision de gène pour des ordres des prokaryotes, des génomes viraux et des eukaryotes. - [Lu plus de GeneMark] |
| GenomeScan - http://genes.mit.edu/genomescan.html Incorpore l'information de similitude de protéine en prévoyant des gènes ; basé en partie sur GENSCAN. - [Lu plus de GenomeScan] |
| GENSCAN - http://genes.mit.edu/GENSCAN.html Identification des structures complètes de gène en ADN genomic. - [Lu plus de GENSCAN] |
| Lueur vacillante - http://www.tigr.org/softlab/glimmer/glimmer.html Repère de gène et modeleur interpolé de Markov ; ce prokaryote-gène trouvant l'outil est le détecteur microbien primaire de gène utilisé à TIGR ; libérez (code source y compris) avec l'inscription à l'utilisation non-commerciale. - [Lu plus lueur vacillante] |
| Graal - http://compbio.ornl.gov/Grail-1.3/ Le Graal est une suite des outils qui identifie des dispositifs d'ordre comme des instigateurs, des candidats d'exon, des répétitions simples et des éléments réitérés complexes. Il modèle également des gènes basés sur les candidats d'exon. - [Indiqué plus de Graal] |
| HMMgene - http://genome.cbs.dtu.dk/services/HMMgene/ Prévision des gènes de vertébré et d'elegans de C. - [Lu plus de HMMgene] |
| Groupe de bio-informatique d'IBM et de découverte de configuration - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Tspd.html Serveur étendu possédant un éventail d'outils pour la découverte de configuration dans des ordres d'ADN et de protéine aussi bien qu'en le texte. Les outils pour le cadrage multiple d'ordre, la découverte de gène, l'annotation de protéine, et d'autres applications existent également sur ce serveur. Un détail - [lu plus de groupe de bio-informatique d'IBM et de découverte de configuration] |
| Détecteur de cadre ouvert de lecture - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html Trouve les trames de lecture tout ouvertes dans un ordre. - [Lu plus de détecteur de cadre ouvert de lecture] |
| Outils logiciels de TIGR - http://www.tigr.org/software/ Une liste de progiciels d'ouvrir-source disponibles pour exempt de l'institut pour la recherche de Genomic (TIGR). - [Lu plus d'outils logiciels de TIGR] |
| Twinscan - http://genes.cs.wustl.edu/ Twinscan est un système pour la gène-structure de prévision dans des ordres genomic eucaryotiques. Afin de faire ses prévisions, les cartels de Twinscan l'information à partir des régions de codage prévues et de l'épissure situe avec des mesures de conserservation entre l'expert en logiciel de cible - [lu plus de Twinscan] |
| SOUFFLE de WU - http://blast.wustl.edu/ Outil local de base de recherche de cadrage d'université de Washington - [lu plus de SOUFFLE de WU] |
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