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Découverte biologique et bases de données biologiques

 

L'accomplissement de l'ordonnancement du génome humain a été réalisé en avril 2003. Cet accomplissement a exercé un effet exceptionnel sur la façon dont la recherche biologique et biomédicale est conduite. L'ordonnancement nous a fourni l'information sur des données de donnée de variation d'ordre et modèles humaines d'organization d'ordre, et l'information sur la structure et la fonction de gène que tout fournit la terre pour que les chercheurs améliorent la conception et pour interprètent leurs expériences, accomplissant la promesse de la bio-informatique en avançant et en accélérant la découverte biologique.

GenBank est la base de données dans laquelle la plupart des chercheurs sont wth familier. GenBank est la collection annotée de tous publiquement - des ordres disponibles d'ADN et de protéine. Cette base de données, mise à jour par le centre national pour l'information de biotechnologie (NCBI) aux instituts nationaux de la santé, représente un effort de collaboration entre NCBI, le laboratoire de biologie moléculaire européen (EMBL), et la Banque du Japon de données d'ADN (DDBJ).

Le Projet génome humain avec d'autres projets de ordonnancement a tenu compte d'un grand nombre de données d'ordre. Par exemple le nombre de bases dans GenBank double tous les 14 mois, et on s'attend à ce que ce taux de croissance exponentielle continue pendant quelque temps encore.

GenBank, ou n'importe quelle autre base de données biologique pour cette matière, atteint peu d'objectif à moins que les données puissent être facilement recherchées et des entrées être recherchées dans un format utilisable et signicatif. Autrement, en ordonnançant des efforts n'ayez aucune extrémité utile, puisque la communauté biologique dans son ensemble ne peut pas se servir de l'information cachée dans ces millions de bases et d'acides aminés.

Soyez cela comme il peut, l'intervalle de publiquement - les données biologiques disponibles vont bien au-delà de ce qui est inclus dans GenBank. Puisque les bases de données publiques principales d'ordre doivent pouvoir enregistrer des données d'une mode généralisée, chronomètre souvent ces bases de données ne contiennent pas des types plus spécialisés d'information qui seraient d'intérêt aux segments spécifiques au sein de la communauté biologique. Pour adresser ceci, beaucoup de plus petites, spécialisées bases de données ont émergé. Ces bases de données, qui contiennent l'information s'étendant des croix de contrainte aux données d'expression de gène, fournissent un complément valable aux bases de données publiques plus visibles d'ordre, et l'utilisateur est encouragées à faire l'utilisation intelligente des deux types de bases de données dans leurs recherches.

Les bases de données biologiques fournissent un rôle utile et instructif dans la communauté de biologie, fournissant la première étape en pouvant exécuter des analyses bioinformatic vigoureuses et précises.