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Old 02-25-2009, 04:37 PM
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Ciao a tutti, avrei bisogno di aiuto per un saggio di discriminazione allelica. Il mio problema questo:
una volta trovati tutti gli snp del mio gene (ad esempio da HapMap.org) come faccio a capire quali sono quelli "tag" , ovvero quelli che sono pi informativi della mia sequenza?
Dunque, i dati li ho scaricati da HapMap.org (HapMap Genome Browser Phase 1 & 2 - full dataset : "scarica genotyping data" del mio gene)in un file che ho poi inserito in Haploview (la vesione l'ultima,ovvero 4.0).
quello che non capisco :ho cercato i tag snp sia su hapmap.org, sia con Haploview, dal momento che le informazioni sulla sequenza sono le stesse (sono prese direttamente da HapMap.org in entrambi i casi) e si dovrebbero basare entrambi sull'algoritmo di Tagger, perch ottengo risultati diversi?come dovrei interpetrarli?
Ringrazio infinitamente chiunque mi rispondesse, perch la prima volta che mi trovo ad affrontare questi programmi e diciamo pi in generale la "bioinformatica" e al di l dei manuali scaricabili on-line non ho molte risorse...
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