Bioinformatics, Protocols, DNA RNA Protein Proteomics Bioinformatiikka, pöytäkirjat, DNA-RNA-Proteiini proteomiikka

Biology Home Protocols Bioinformatic Tools Biology Forums Molecular Biology Encyclopaedia Molecular Biology Images Bookmark Us! Biologia Etusivu pöytäkirjojen bioinformatiikan välineitä Biologia Forums Molecular Biology Encyclopaedia Molecular Biology Images Bookmark Us!

home > protein > bioinformatics > protein-structure > index.php etusivu> proteiinin> bioinformatiikka> proteiini-rakenteen> index.php

Molecular Biology Home Science News Science Videos DNA RNA Protein Proteomics Research BETA! Bioinformatics Lab Equipment Molecular Biology Techniques Molecular Biology Products and Services Related Biology Links Molecular Biology Etusivu Tiede Uutiset Science Videos DNA-RNA-Proteiini proteomiikka Tutkimus BETA! Bioinformatics Lab-laitteet Molecular Biology Techniques Molecular Biology liittyviä tuotteita ja palveluja Biology Links

Molecular Biology Blog Molecular Biology Blog

Send this page to a friend Send this page to a friend

Intracellular Stations Solunsisäiset asemat

Antibody Botany Common Buffers Buffers Alphabetic Bookstore Cell Biology and Culture Gel Electrophoresis Histology Microarrays Immunology Mass Spectrometry Microbiology Molecular Imaging Peptide Proteomics Protein Microarray Chips PCR Real-Time PCR RNAi and SiRNA Stem Cell Biology Transfection Western Blot Vasta Botany yhteisen Puskurit Puskurit Alphabetic Bookstore solubiologian ja kulttuuri geelielektroforeesilla histologian microarray Immunology massaspekrometria mikrobiologian laitos Molecular Imaging peptidi proteomiikka Proteiini Microarray Chips PCR-Real-Time PCR RNAi ja SiRNA Stem Cell Biology Transfection Western Blot

Protein Protocols Proteiini pöytäkirjat

Protein Encyclopedia Proteiini Encyclopedia

Protein Bioinformatics Protein Bioinformatics

Protein Science Forum Protein Science Forum

Protein Blog Proteiini Blog

DNA News DNA Uutiset

Protein Structure Prediction Proteiinin rakenne Prediction

Bioinformatic Tools are able to predict a protein's structure either in 2-dimensions (2-D) or three-dimensions (3-D). Bioinformatiikan välineitä on voitava ennustaa proteiinin rakenne joko 2-mitat (2-D) tai kolme-mitat (3-D). This may not be a real representation of the actual structure of a protein, however it is a good starting point to predict enzymatic pockets, and protein-protein interaction domains. Tämä ei voi olla todellinen edustus todellinen rakenne proteiini, mutta se on hyvä lähtökohta ennustaa entsymaattisella taskuihin, ja proteiini-proteiini vuorovaikutus verkkotunnuksia. After prediction, confirmation of protein structure can be made using X-ray Crystallography techniques. Kun ennustamiseen, vahvistus proteiinin rakenne voidaan tehdä käyttämällä X-ray crystallography tekniikoita.

Bioinformatic Programs Used to Predict Secondary Structure: Bioinformatiikan Ohjelmat Käytetyt ennustaa Secondary Structure:

(Please see our Protein Structure Prediction Bioinformatic Tools Database for 2-D prediction; (Tutustu Protein Structure Prediction bioinformatiikan välineitä Database for 2-D ennustaminen;

and Protein Structure Prediction Bioinformatic Tools Database for 3-D prediction. ; and our database for Retrieving Protein Structure Data from 3-Dimensional Databases. ja Protein Structure Prediction bioinformatiikan välineitä Database 3-D ennustamiseen., ja meidän tietokanta Haetaan Proteiinin rakenne Data 3-ulotteisten Tietokannat.

Experimental data can be used to help in prediction protein structure. Kokeellista tietoa voidaan käyttää apuna ennusteen proteiinin rakenne. The following are experiments that can help in protein structure analysis: Seuraavat ovat kokeiluja, jotka voivat auttaa proteiinin rakenteen analyysi:

- Localization of disulphide bonds (provide tight restraints on the location of cysteines in space) -- Sijainnilla disulphide joukkovelkakirjalainat (säädettävä tiukat rajoitukset sijainti cysteines avaruudessa)

- Spectroscopy data which can give clues to the secondary structure composition of your protein of interest -- Spektroskopia tietoja, jotka voivat antaa viitteitä, että johdetun rakenteen kokoonpano teidän proteiinin edun

- Site directed mutagenesis experiments, (substituting Alanine A Ala for various amino acids and then checking function of the protein) which can give important insight to the residues which are important in the active site of an enzyme or protein-protein interacting binding sites or domains. -- Site suunnattu mutageneesi kokeiluja, (korvaamatta alanine A Ala eri aminohappoja ja sitten tarkkailun tehtävänä on proteiini), jotka voivat antaa tärkeitä tietoja, jäämiä, jotka ovat tärkeitä aktiivisen sivuilla entsyymiä tai proteiini-proteiini vuorovaikutteisina sitovia sivustoja tai verkkotunnuksiin .

- Obtain experimental data of post-translational modifictions (eg phosphorylation and glycosylation sites can suggest residues that must be externally accessible and thus may be surface residues) -- Saada kokeellista tietoa post-translaatiotutkimuksessa modifictions (esim. phosphorylation ja glycosylation sivustot voivat ehdottaa jäännöksiä, jotka on oltava ulkoisesti saatavilla ja voi siten olla pinta-jäämät)

- Proteolytic Cleavage sites. -- Proteolyyttiset cleavage sites.

Keeping this data in mind when conducting prediction of protein structure is important, as this is structural data that has been proved experimentally.0 Pidä nämä tiedot huomioon suoritettaessa ennustaminen proteiinin rakenne on tärkeä, koska tämä on rakenteellista tietoa, joka on osoittautunut experimentally.0

Question whether structure predictions agree with experimental results. Kysymys, onko rakenne ennustukset samaa mieltä kokeellisia tuloksia. This can test the validity of the predicted protein structures. Tämä voi testata voimassaoloaikaa on ennustettu proteiinien rakenteita.