Protocolos artificiales bacterianos del cromosoma de BACs

Describa un conjunto de BACs que asocia cerca de los extremos cromosómicos centroméricos y distales para cada cromosoma del ratón. - [Leído una técnica triple de los PESCADOS del color para la identificación del cromosoma del ratón]

El protocolo presenta la amplificación de las secuencias del final del separador de millares de copias artificiales bacterianas del cromosoma usando TAIL-PCR. Los productos amplificados son convenientes como puntas de prueba para recorrer y el genoma del cromosoma que asocian y como modelos para la secuencia directa. El protocolo se ha utilizado en estudios del genoma del arroz. - [Amplificación leída de las secuencias del final del separador de millares de las copias de BACs por la polimerización en cadena entrelazada asimétrica termal]

El protocolo utiliza el kit de la reacción de BIOPRIME de GibcoBRL para preparar la DNA biotina-etiquetada del CCB que se detecta usando la FITC-Avidina (laboratorios del vector, grado de DCS). Los reactivo de otros fabricantes pudieron trabajar igualmente bien sino haber sido probados. Incluye: Etiquetado de las copias del CCB; Precipitación del etanol; Hibridación; tratamiento/detección del Poste-hibridación. - [Protocolo leído de BAC-FISH]

Información para BACs, cromosomas artificiales bacterianos. Incluye: Vectores existentes; pBAC108L; pBeloBAC11; pBACe3.6; pFW11 y factor de F; pCC1BAC; vectores del pSMART VC; pIndigoBAC-5; Cósmidos; pWEB-TNCTM; SuperCos 1; pFos1; Vectores de PAC; Purificación del CCB; Poner al CCB en Escherichia Coli. - [Cromosomas artificiales bacterianos leídos de BACs]

Método alcalino rápido del miniprep de la lisis para aislar la DNA de copias grandes de PAC. Es una modificación de un estándar Qiagen-Inclina el método que no utiliza ningunas extracciones o columna orgánicas. Los trabajos del método muy bien para hacer los resúmenes analíticos de la restricción de copias de PAC y se pueden escalar encima de en caso de necesidad. - [Aislamiento leído de la DNA protocolo de las copias del CCB y de PAC]

Ordenando las condiciones probadas para el ABI Grande-Teña los adaptadores (PE-ABI #4303150 para el kit 1000 de la reacción - descripción: TF, KIT BTD RR-1000) con los varios modelos. Importante cuantificar todos los modelos por electroforesis del gel de la agarosa contra estándares de la talla y de la concentración y hacer algunas pruebas con diversas concentraciones del modelo para determinar las condiciones óptimas para sus reacciones. Se dan varias condiciones. - [Protocolos y notas leídos del tinte para el cósmido, CCB, CCB, modelos de Fosmid]

El protocolo describe el aislamiento de la DNA del CCB de culturas bacterianas usando el sistema comercial de NucleoBond. - [Leído aislando la DNA del CCB de culturas bacterianas usando el protocolo del sistema de NucleoBond]

El procedimiento para el aislamiento de la DNA del CCB es ampliado acomodar las culturas de 500 ml, que, en promedio, rinden el µg 20-25 de la DNA purificada del CCB. - [Aislamiento leído de la DNA del CCB del protocolo en grande de las culturas]

Una modificación del método alcalino estándar de la lisis prepara al CCB DNAs a partir de las culturas de 5 ml de células CCB-transformadas (preparación de la DNA del plásmido por lisis alcalina con el SDS: Minipreparation). La producción varía típicamente entre 0.1 y 0.4 µg de DNA del CCB. - [Aislamiento leído de la DNA del CCB del protocolo en reducida escala de las culturas]

Protocolo para la preparación de la DNA del CCB (cromosoma artificial bacteriano) con el sistema de la purificación del plásmido de la pureza elevada del CONCIERTO. Incluye: - [Preparación leída de la DNA del CCB con protocolo del sistema de la purificación del plásmido de la pureza elevada del CONCIERTO]

El protocolo describe la purificación de la DNA del CCB que se ha preparado con el sistema comercial de NucleoBond. - [Purificación leída de la DNA del CCB preparada con el protocolo del sistema de NucleoBond]

El protocolo describe cómo transformar Escherichia Coli con la DNA del CCB por la electroporación. - [Funcionamiento leído con protocolo artificial bacteriano de los cromosomas]