Bioinformática

Usando AFPredictor, fue demostrado que el `pidió los carbones superficiales (OSCs) es una característica de distinción de AFPs y, más específicamente, sus superficies hielo-obligatorias. AFPredictor identificó AFPs dentro de un conjunto grande de estructuras con la especificidad mayor del de 99%. Además, fue utilizado para identificar una proteína hielo-obligatoria nueva defendiendo una biblioteca de las estructuras modeladas homología basadas en las secuencias del cDNA obtenidas del centeno de invierno frío-acclimated (cereale del Secale). - [Leído un protocolo de cómputo de la investigación para el anticongelante/las proteínas de Hielo-Estructuración]

Las búsquedas no se obligan para solamente los péptidos trípticos, y las bases de datos puestas en un índice (bases de datos que contienen solamente los péptidos trípticos) no se utilizan. En caso de que haya muy complejo las mezclas, tales como lysates de la célula, las hendiduras no específicas pueden ocurrir. Por lo tanto, los péptidos nontryptic serían faltados en la búsqueda de base de datos. - [Leído el uso de la espectrometría total en Proteomics: Búsqueda de la base de datos]