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Predicción De la Estructura De la Proteína

Las herramientas de Bioinformatic pueden predecir la estructura de una proteína en 2-dimensions (2.o) o las tres-dimensiones (3-D). Ésta puede no ser una representación verdadera de la estructura real de una proteína, no obstante es un buen punto de partida para predecir los bolsillos enzimáticos, y de dominios de la interacción de la protei'na-protei'na. Después de la predicción, la confirmación de la estructura de la proteína se puede hacer usando técnicas de la cristalografía de la radiografía.

Los programas de Bioinformatic predecían la estructura secundaria:

(vea por favor nuestra proteína estructurar la base de datos de las herramientas de Bioinformatic de la predicción para la 2.a predicción;

y la predicción Bioinformatic de la estructura de la proteína filetea la base de datos para la predicción 3-D.; y nuestra base de datos para extraer datos de la estructura de la proteína de las bases de datos 3-Dimensional.

Los datos experimentales se pueden utilizar para ayudar en estructura de la proteína de la predicción. Los siguientes son los experimentos que pueden ayudar en análisis de la estructura de la proteína:

- localización de los enlaces de disulfuro (proporcione a los alojamientos apretados en la localización de cysteines en espacio)

- datos de la espectroscopia que pueden dar pistas a la composición secundaria de la estructura de su proteína del interés

- los experimentos dirigidos sitio de la mutagénesis, (substituyendo el alanine un ala para los varios aminoácidos y después controlando la función de la proteína) que puede dan la penetración importante a los residuos que son importantes en el sitio activo de una enzima o de sitios obligatorios que obran recíprocamente o de dominios de la protei'na-protei'na.

- obtenga los datos experimentales de modifictions poste-de translacio'n (los sitios e.g. del phosphorylation y del glycosylation pueden sugerir los residuos que deben ser externamente accesibles y así pueden ser residuos superficiales)

- sitios proteolytic de la hendidura.

Tener estos datos presente cuando conducir la predicción de la estructura de la proteína es importante, como esto es los datos estructurales que han sido experimentally.0 probados

Pregunta si las predicciones de la estructura convienen con resultados experimentales. Esto puede probar la validez de las estructuras predichas de la proteína.


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