Bioinformática de la proteína

La regulación de la proteína, localización de la proteína, adornos de la proteína, expresión de la proteína, estructura de la proteína, modificaciones poste-de translación de la proteína, de las interacciones de la proteína, y de la función de la proteína es importante porque las proteínas constituyen la entidad de funcionamiento más grande dentro de la célula. La bioinformática de Proteomic es thecollection, organización y análisis de granes cantidades de datos proteomic, usando redes de ordenadores y de bases de datos.

El conseguir comenzado con bioinformática de la proteína

Usted debe comenzar con su secuencia de la proteína. Para obtener la secuencia de su proteína haga el siguiente. Visite las conexiones y la búsqueda siguientes para la proteína que usted está estudiando.

Las bases de datos de la secuencia de la proteína se categorizan como primarias, compuestas o secundario. Las bases de datos primarias contienen secuencias y la función de la proteína como depósito para las informaciones en bruto.

Búsqueda para las proteínas y secuencias de la proteína usando:

Secuencia de aminoácido primaria de la proteína
Características físicas o químicas
Secuencias de nucleótido
Secuencias del péptido
Cadenas de texto

Búsqueda para las proteínas usando secuencia de aminoácido primaria de la proteína

PepSea - identificación de la proteína buscando una secuencia

Búsqueda para las proteínas usando características físicas o químicas

MassSearch: - Búsqueda SwissProt o bases de datos de EMBL por la masa de la proteína después de la digestión en ETH-Zürich
TagIdent: - Extraiga las proteínas de SwissProt dadas el pi y el Mw en ExPASy
AACompIdent - es una herramienta que permite la identificación de una proteína de su composición de aminoácido. Busca las bases de datos del Suizo-Prot y/o de TrEMBL para las proteínas, cuyas composiciones de aminoácido están las más cercanas a la composición de aminoácido dada.

Búsqueda para las proteínas usando secuencias de nucleótido

RÁFAGA (RÁFAGA: Herramienta local básica) de la investigación de la alineación (NCBI)
BELLEZA (utilitario realzado RÁFAGA de la alineación)

Búsqueda para las proteínas usando secuencias del péptido

RÁFAGA (RÁFAGA: Herramienta local básica) de la investigación de la alineación (NCBI)
Aldente identifica las proteínas con datos de la huella dactilar de la masa del péptido. Una herramienta nueva, rápida y de gran alcance que se aprovecha de la transformación del corvejón para la recalibración de los espectros y la exclusión del afloramiento
PepSea - identificación de la proteína por el péptido que asocia o el péptido que ordena de Protana, Dinamarca.
Herramienta de MultiIdent - identifique las proteínas con el pi, el Mw, la composición de aminoácido, la etiqueta de la secuencia y datos totales de la huella dactilar del péptido

Busque para las proteínas usando cadenas de texto

Integr8

Interrogación de la proteína de Entrez-Pubmed

Secuencia de la proteína - secuencia primaria de proteínas (primarias)

SWISS-PROT
PIR-Internacional
Interrogación de la proteína de Entrez-Pubmed

Secuencia de la proteína (secundaria)

Las bases de datos secundarias contienen la información derivada de secuencias de la proteína y ayudan al utilizador a determinar si una nueva secuencia pertenece a una familia sabida de la proteína.

PROSITE
IMPRIME
Pfam

Secuencia de la proteína (compuesta)

Las bases de datos compuestas tales como BUHO y el NRDB compilan y filtran datos de la secuencia de diversas bases de datos primarias para producir los conjuntos non-redundant combinados que son más completos que las bases de datos individuales y también incluir datos de la secuencia de la proteína de las regiones de codificación traducidas en la DNA ordene las bases de datos.

BUHO
NRDB

Noticias de la ciencia

Resultados en la infección temprana de la TB

Nueva evidencia genética de los primeros americanos

Riesgo de cáncer reducido de Colorectral con terapia de la hormona

Conexión y riesgo del trauma de la niñez para el síndrome crónico de la fatiga

El gene bivalente hace la parte en cánceres de pecho con pronóstico pobre

Penetración en cáncer agresivo de la niñez

Nuevas etiquetas de plástico genéticas para la colitis ulcerosa

Modelo nuevo del ratón de Glioblastoma

Nueva manera de fundir las células

Continuación del crecimiento de la acuacultura

Para más haga clic aquí: Noticias de la ciencia