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Aplicaciones de los Microarrays de la proteína

Microarrays de la proteína y del anticuerpo

Aplicaciones de la viruta de la proteína

Aplicaciones de las virutas de la proteína
1) Proteomics
            Las tecnologías de la viruta de la proteína proporcionarán a de gran alcance, alto-rendimiento de procesamiento y la herramienta versátil para genoma-escala el análisis de la función del gene (véase el cuadro 4).  La actividad enzimática, las interacciones de la proteína-proteína y del proteína-nucléico-ácido, y las interacciones de droga de la pequeño-molécula se pueden todos analizar directamente en el nivel de la proteína (77.78).  Las matrices se pueden dirigir para tratar la identificación de la proteína, la cuantificación, y estudios de la afinidad.  Un arsenal de perfilado puede cuantificar los niveles de proteínas específicas en una escala global teniendo en cuenta una comparación de los estados del normal y de la enfermedad.  Un arsenal de la afinidad puede analizar las interacciones de péptidos, las proteínas, los oligonucleótidos, los azúcares, los lípidos, o las pequeños moléculas y productos químicos con las proteínas inmovilizadas tales como receptores, enzimas, o anticuerpos (8). 
            Actualmente, el paso de progresión tarifa-limitador es la producción de una gran cantidad de proteínas. La capacidad de automatizar la producción y las proteínas de la proteína fundidas a las etiquetas de la alto-afinidad apresurará grandemente el desarrollo de la proteína-viruta.  Las virutas de alta densidad que contienen conjuntos grandes de proteínas o aún de proteomes enteros permitirán el análisis del alto-rendimiento de procesamiento de actividades bioquímicas, de interacciones de la proteína-proteína y de modificaciones poste-de translación, tales como fosforilación, defosforilización, metilación de la proteína, y ubiquitination.

            El objetivo último del proteomics está a las actividades bioquímicas del estudio de cada proteína codificada por un organismo o un proteome.  Un estudio de la señal conducido preparó la primera viruta del proteome reproduciendo el ~94% (>5800 de 6200) de los bastidores de lectura abiertos de la levadura en un vector de la expresión de la levadura que expresó las proteínas como la N-terminal GST-Su x6 dobla fusiones marcadas con etiqueta.  Un método de la purificación de la proteína de la levadura del alto-rendimiento de procesamiento fue desarrollado para purificar individualmente las proteínas. los 80% de proteínas de la levadura eran integrales y de suficiente cantidad ser perceptibles por la mayoría de los tipos del análisis. Las proteínas entonces fueron purificadas usando las etiquetas de GST y después asociadas a las diapositivas de cristal Ni-NTA-revestidas usando las etiquetas HisX6.  Además de identificar interacciones sabidas, 33 proteínas obligatorias nuevas fueron detectadas.  150 proteínas lípido-obligatorias nuevas también fueron identificadas.  Este estudio demostró que un proteome entero se puede inmovilizar en una superficie de cristal para defender directamente para las interacciones con las proteínas y las pequeñas moléculas (26).
            El acoplador de las virutas de la masa-espectrometría y de la proteína tendrá aplicaciones amplias en la identificación de jugadores en interacciones de la proteína-proteína, y también en el descubrimiento de la droga (80).  Las proteínas y los ligands de la pequeño-molécula limitan a las proteínas inmovilizadas en viruta se pueden identificar usando el tiempo matriz-asistido de la desorción/de la ionización del laser de la espectroscopia total del vuelo (MADLI-TOF).  Los formatos de Microwell se adaptan determinado con este fin. Así, las moléculas y las proteínas que atan específicamente a muchas diversas proteínas pueden ser identificadas y esta información se pueden utilizar para deducir redes y caminos moleculares.
            Una área que requerirá mejoras tecnológicas es el análisis de las proteínas de la membrana.  Una gran cantidad de proteínas es probable ser membrana-limita, puesto que tanto pues una mitad de todas las proteínas de la levadura es proteínas de la membrana o las proteínas secretadas (81). Debido al hecho de que muchas de estas proteínas sean activas cuando en membranas, por lo tanto puede ser necesario purificarlas o reconstituir con los lípidos asociados. Sin embargo, esto puede no ser tan difícil. Un grupo podía inmovilizar las membranas biotinylated que contienen el rhodopsin G-proteína-juntado del receptor en una superficie de cristal gold-coated, y establece un análisis funcional para esa proteína (82).  Los procedimientos similares pueden permitir analizar las proteínas de la membrana en un formato de la viruta.
2) diagnósticos
Otra área que se beneficiará de áreas de la proteína es diagnósticos. El análisis altamente paralelo en matrices permitirá la determinación de las etiquetas de plástico de la enfermedad (e.g etiquetas de plástico del tumor) en extractos con solamente un mínimo de material de la biopsia (muestra), creando las nuevas posibilidades de vigilar el tratamiento y la terapia (83) de la enfermedad (cáncer).

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Referencias para los Microarrays de la proteína y del anticuerpo

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Introducción y fondo a las virutas de la proteína y a las virutas del anticuerpo.

Tipos de virutas del anticuerpo y de la proteína

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