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Limitaciones De Microarray Del Anticuerpo

Proteína y anticuerpo Microarrays

Problemas y soluciones posibles para el anticuerpo Microarrays

Disponibilidad de anticuerpos
            Otro desafío a las matrices del anticuerpo es obtener los anticuerpos contra ≥ las 100.000 proteínas que abarcan el proteome humano.  Hay actualmente una fracción muy pequeña de los anticuerpos disponibles del proteome.  Además, la especificidad de muchos de estos anticuerpos se documenta mal y los anticuerpos adicionales se pueden requerir a
permita la detección de modificaciones poste-de translacio'n.  La detección de proteínas por interacciones–del antígeno del anticuerpo también es caracterizada por un amplio rango de la especificidad y de la afinidad.  También, es difícil obtener un conjunto grande del anticuerpo altamente específico
moléculas. Por lo tanto, la mayoría de las matrices del anticuerpo se limitan en su uso y contienen algunos agentes bien definidos de la captura dirigidos en una clase determinada de las etiquetas de plástico de la proteína (9.17) 
- no actuar glycosylation similar

Otros problemas que hacen frente al anticuerpo Microarrays y a soluciones posibles
Las estrategias clásicas de la generación del anticuerpo por la inmunización animal se parecen ser imprácticas. Las bibliotecas recombinant de la visualización del anticuerpo son más prometedoras (59-61). Recientemente, muchos métodos recombinant de generar los anticuerpos se han investigado.
Éstos incluyen phage anticuerpo-visualizan, visualización del ribosome, SELEX (evolución sistemática de ligands por el enriquecimiento exponencial), visualización del mRNA, y visualización affibody, que se han desarrollado para avanzar la producción de los anticuerpos y/o de los imitadores del anticuerpo (16.54.56.62).  Estos métodos todos implican la construcción de los repertorios grandes de las regiones viables con actividad obligatoria potencial, que entonces son seleccionadas por los redondos múltiples de las purificaciones de la afinidad. El candidato se reproduce puede ser seleccionado más a fondo usando la selección de la maduración que mejora afinidades obligatorias.  Sin embargo, un sistema ideal de la selección, que es costo rápido, robusto, sensible, bajo, automatizado, y reducido al mínimo, debe todavía ser convertido completamente (16.54).  Estos fragmentos más pequeños del anticuerpo han disminuido generalmente reactividad cruzada y características similares sobre la conexión (7.8.9.27).
La también porque los anticuerpos recombinant tienen una afinidad potencialmente alta, alta especificidad, y su peso molecular más pequeño, que es generalmente el kDa cerca de 30 mientras que los anticuerpos no-non-recombinant son el kDa cerca de 150, densa y orientada conexión a las superficies de la ayuda se facilita (63.64).
            Los anticuerpos no son las únicas moléculas que pueden atar las proteínas.  Aptamers es los oligonucleotids cortos que pueden atar y reticular las proteínas covalentes de la blanco.  Esto facilita
condiciones más altas de la colada del rigor que promueve la detección del atascamiento específico.  Además, estas moléculas se seleccionan, se ponen en orden, y se sintetizan fácilmente.  La blanco purificada de la proteína es un requisito para su uso sin embargo, y los aptamers pueden exhibir el atascamiento en polarización negativa mientras que RNAs tiende para ser cargado altamente negativamente (9). Un aptamer contra-humano inmovilizado recientemente usado de la inmunodeficiencia virus-gp120 del grupo (Somalogic) para detectar concentraciones subnanomolar de la proteína de la blanco en el suero humano del 5% (65). 

Después: Métodos y análisis de detección de Microarray de la proteína

Referencias para la proteína y el anticuerpo Microarrays

De nuevo a:

Introducción y fondo a las virutas de la proteína y a las virutas del anticuerpo.

Tipos de virutas del anticuerpo y de la proteína