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Herramientas de la alineación y de la visualización de la secuencia
| BoxShade - http://www.ch.embnet.org/software/BOX_form.html Impresión y shading de los ficheros múltiples de la alineación. - [Leído más BoxShade] |
| Servidor de CHAOS/DIALIGN WWW - http://dialign.gobics.de/chaos-dialign-submission El servidor de CHAOS/DIALIGN WWW es un sitio múltiple de la alineación de la secuencia que pasa secuencias de entrada de información con CAOS para crear una lista de similarites locales. Estas semejanzas sirven como puntos de anclaje, permitiendo que DIALIGN conduzca alineaciones globales más rápidamente. El ABC puede - [leído más servidor de CHAOS/DIALIGN WWW] |
| GRABE - http://cbrmain.cbr.nrc.ca/EMBOSS/ Habitación diversa de las herramientas para el análisis de la secuencia; muchos programas análogos a GCG; ayuda sensible al contexto para cada herramienta. - [Leído más GRABE] |
| GeneDoc - http://www.psc.edu/biomed/genedoc/ Editor de la alineación de la secuencia, analizador y utilitario múltiples del shading para Windows. - [Leído más GeneDoc] |
| GraphAlign - http://darwin.nmsu.edu/cgi-bin/graph_align.cgi Proporciona a representaciones gráficas de las alineaciones globales de ClustalW en parejas para la interrogación y de las secuencias sujetas del tipo búsquedas de la RÁFAGA. La representación gráfica proporciona a la información en secciones de la alta calidad de la alineación global. - [Leído más GraphAlign] |
| ALEGRÍA - http://www-cryst.bioc.cam.ac.uk/~joy/ Programa para visualizar la información estructural 3D en una alineación múltiple de la secuencia. - [Leído más ALEGRÍA] |
| De color de malva - http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve/documentation.php El color de malva es una herramienta de software independiente para construir alineaciones múltiples del genoma. - [Más de color de malva leída] |
| Seaview - http://pbil.univ-lyon1.fr/software/seaview.html SeaView es un editor múltiple gráfico de la alineación de la secuencia que puede leer y escribir los varios formatos de la alineación (NEXO, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE). Permite corregir manualmente la alineación, y también funcionar con programas de DOT-PLOT o de CLUSTALW al local - [leído más Seaview] |
| SequenceJuxtaposer - http://www.cs.ubc.ca/~tmm/papers/sj/ SequenceJuxtaposer es una herramienta para visualizar y comparar secuencias biomoleculares. Utiliza una técnica de la visualización llamada el gráfico del acordión que permite que los utilizadores enfoquen en regiones de interés en alineaciones. - [Leído más SequenceJuxtaposer] |
| SeqVISTA - http://zlab.bu.edu/SeqVISTA/ Herramienta para la visualización y la comparación de la característica de la secuencia; integra con Internet Explorer; valida los ficheros " planos " de GenBank, HTML de GenBank, ficheros de FASTA; los enchufes existen para la visualización de la salida de RepeatMasker, de PsiPred, y de Cister. - [Leído más SeqVISTA] |
| CORREA - http://www.charite.de/bioinf/strap/ El programa estructural de la alineación para las proteínas (CORREA) es un programa Java-basado que se puede funcionar con sobre el Web usando un hojeador permitido comienzo del Web de Java o descargar y funcionamiento como aplicación independiente. Las alineaciones se pueden hacer usando uno de varios métodos, inc. - [leído más CORREA] |
| WAViS - http://wavis.img.cas.cz/ El servidor de la visualización de la alineación del Web (WAViS) proporciona a las varias herramientas del Web para realzar la presentación de las alineaciones múltiples de la secuencia del aminoácido o del nucleótido. - [Leído más WAViS] |
| WebLogo - http://weblogo.berkeley.edu/ WebLogo permite que uno cree las representaciones gráficas (insignias de la secuencia) de las alineaciones múltiples de la secuencia. Esto se puede hacer del Web site y el código fuente para WebLogo está también disponible para la transferencia directa. - [Leído más WebLogo] |
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