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Herramientas múltiples de Bioinformatic de la alineación de la secuencia.
| Juego de herramientas de la bioinformática - http://protevo.eb.tuebingen.mpg.de/toolkit/index.php?view=search Este juego de herramientas es una colección de una amplia gama de herramientas y de conexiones para el análisis de la secuencia, la función, y la predicción de la estructura. Este recurso ofrece los interfaces convienent del Web para muchas herramientas libremente disponibles. - [Leído más juego de herramientas de la bioinformática] |
| CE-MC - http://cemc.sdsc.edu Un servidor múltiple de la alineación de la estructura de la proteína que crea una todo-a-toda en parejas alineación usando un programa combinatorio de la extensión y entonces usando métodos de la optimización de Monte Carlo conduce una optimización global iterativa. Los resultados se formatan usando JO - [leído más CE-MC] |
| Servidor de CHAOS/DIALIGN WWW - http://dialign.gobics.de/chaos-dialign-submission El servidor de CHAOS/DIALIGN WWW es un sitio múltiple de la alineación de la secuencia que pasa secuencias de entrada de información con CAOS para crear una lista de similarites locales. Estas semejanzas sirven como puntos de anclaje, permitiendo que DIALIGN conduzca alineaciones globales más rápidamente. El ABC puede - [leído más servidor de CHAOS/DIALIGN WWW] |
| ClustalW - http://www.ebi.ac.uk/clustalw/ Alineación múltiple estándar de la secuencia. - [Leído más ClustalW] |
| ClustalX - http://www-igbmc.u-strasbg.fr/BioInfo/ClustalX/ Clustal X es una versión del programa múltiple de la alineación de la secuencia de Clustal W con un interfaz gráfico. Los colores de la visualización permiten que las características conservadas sean destacadas para la visión fácil en la alineación. Está disponible para varias plataformas, incluyendo los Wi - [leído más ClustalX] |
| DIALIGN - http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/dialign/ Programa múltiple de la alineación que ensambla una alineación global de la secuencia de alineaciones boquete-libres del local en parejas. Este método podría ser especialmente útil al comparar las secuencias grandes que tienen solamente semejanzas locales. - [Leído más DIALIGN] |
| eBioinformatics - http://www.ebioinformatics.org/ Este sitio proporciona a varias herramientas de software de la bioinformática embaladas juntas para la instalación fácil en los ordenadores de MacOSX. El software incluye las herramientas de NCBI, LAS GRABA, ClustalW, Staden, T-Café y Primer3. - [Leído más eBioinformatics] |
| GRABE - http://cbrmain.cbr.nrc.ca/EMBOSS/ Habitación diversa de las herramientas para el análisis de la secuencia; muchos programas análogos a GCG; ayuda sensible al contexto para cada herramienta. - [Leído más GRABE] |
| eShadow - http://eshadow.dcode.org/ Una herramienta para sombrear filogenético de secuencias múltiples de especies estrechamente vinculadas. Esto los análisis de las alineaciones múltiples de la secuencia se puede utilizar para predecir elementos funcionales supuestos. - [Leído más eShadow] |
| Grupo de la bioinformática de IBM y del descubrimiento del modelo - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Tspd.html Servidor extenso que posee una amplia gama de las herramientas para el descubrimiento del modelo en secuencias de la DNA y de la proteína así como en el texto. Las herramientas para la alineación múltiple de la secuencia, el descubrimiento del gene, la anotación de la proteína, y otras aplicaciones también existen en este servidor. Un detalle - [leído más grupo de la bioinformática de IBM y del descubrimiento del modelo] |
| LAGAN - http://lagan.stanford.edu/lagan_web/index.shtml El juego de herramientas de la alineación de LAGAN consiste en componentes: CAOS (un alineador en parejas local optimizado para la no-codificación, y otras regiones mal conservadas del genoma.), LAGAN (un programa en parejas global altamente parametrizable de la alineación), Multi-LAGAN, y barajadura - [leído más LAGAN] |
| De color de malva - http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve/documentation.php El color de malva es una herramienta de software independiente para construir alineaciones múltiples del genoma. - [Más de color de malva leída] |
| Mulan - http://mulan.dcode.org/ Mulan es una herramienta de alineación múltiple de la secuencia. Emplea algoritmos nuevos tales como TBA y multiTF para realizar respectivamente alineaciones y para descubrir puntos de enlace del factor de la transcripción. Los resultados se pueden ver como punto-trazan de alineaciones individuales de la secuencia, o - [leído más Mulan] |
| MyHits - http://myhits.isb-sib.ch El servidor de MyHits integra varias herramientas con un foco en la anotación de la proteína y el análisis de los dominios de la proteína. Los utilizadores de la huésped tienen acceso a las herramientas tales como ClustalW y T-Café y las bases de datos como Suizo-Prot, Prosite e Interpro. El registro nos permite - [leído más MyHits] |
| CORREA - http://www.charite.de/bioinf/strap/ El programa estructural de la alineación para las proteínas (CORREA) es un programa Java-basado que se puede funcionar con sobre el Web usando un hojeador permitido comienzo del Web de Java o descargar y funcionamiento como aplicación independiente. Las alineaciones se pueden hacer usando uno de varios métodos, inc. - [leído más CORREA] |
| T-COFFEE - http://www.ch.embnet.org/software/TCoffee.html Herramienta de alineación múltiple de la secuencia para las secuencias de la proteína; más exacto que ClustalW para las secuencias con la identidad menos del de 30%; en la salida, los bloques conservados son color cifrado para indicar la calidad de la alineación. - [Leído más T-COFFEE] |
| zPicture y multi-zPicture - http://zpicture.dcode.org/ el zPicture (en parejas alineación) y multi-zPicture (alineación múltiple) son herramientas de alineación en Internet de la secuencia basadas en el programa de la alineación del blastz. Las alineaciones del zPicture se pueden someter automáticamente al rVista. - [Leído más zPicture y multi-zPicture] |
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