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Genómica comparativa
| Paginación de la anotación del genoma de IBM - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Annotations/home.html Las anotaciones Bio-Diccionario-basadas de IBM de la paginación terminada de los genomas enumeran las anotaciones para más de 75 genomas completos (archae, bacterias, eurkaryotes, y virus). Usted puede preguntar estas anotaciones en el nivel de la secuencia tan bien como la búsqueda/compara a través de los genomas. - [Leído más paginación de la anotación del genoma de IBM] |
| Genomas microbianos integrados (IMG) - http://img.jgi.doe.gov/ El sistema microbiano integrado de los genomas (IMG) facilita la comparación de los genomas ordenados por el instituto común del genoma (JGI). Puede ser buscado usando palabras claves o BLASTp, y los expedientes del gene diplayed incluyen las características bioquímicas, dominios de la proteína, - [los genomas microbianos más integrados leídos (IMG)] |
| Base de datos de secuencia en grande del proyecto del ISC - http://www.intlgenome.org/viewDatabase.cfm La base de datos de secuencia en grande de secuencia internacional del proyecto del consorcio (ISC) contiene la información sobre corriente y terminada ordenando proyectos, incluyendo cronologías del proyecto, agencias de financiamiento, ordenando estrategia y conexiones hacia fuera para proyectar Web pages. - [Leído más base de datos de secuencia en grande del proyecto del ISC] |
| De color de malva - http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve/documentation.php El color de malva es una herramienta de software independiente para construir alineaciones múltiples del genoma. - [Más de color de malva leída] |
| MIPS - http://mips.gsf.de/ El centro de información de Munich para los proyectos de las secuencias de la proteína incluye: análisis fungicida del genoma, bioinformática del genoma de la planta, anotación estructural de la genómica, del proteomics y del genoma. Los proyectos y las bases de datos incluyen: CYGD, MNCDB, NGFN, MPPI, SIMAP, QUIPOS, MATDB, M - [leído más MIPS] |
| NEMBASE2 - http://zeldia.cap.ed.ac.uk/nematodeESTs/nembase.html NEMBASE2 es un recurso de la base de datos para los grupos de datos del EST para 37 especies de nematodo. Las secuencias se arraciman al redundacy del redunce. Las comparaciones pueden estar por la biblioteca y en un nivel de la secuencia; una herramienta de la visualización es incluida. Predicciones de la región de la codificación para cada racimo, - [leído más NEMBASE2] |
| PartiGeneDB - http://www.partigenedb.org/ PartiGeneDB es una base de datos de cerca de 300 genomas parciales de los organismos eucarióticos que se han ensamblado de datos del EST. - [Leído más PartiGeneDB] |
| PhenomicDB - http://www.phenomicdb.de/ PhenomicDB integra la información del genotipo y del fenotipo de varios organismos de fuentes de datos públicos. El asociar de las zonas de informaciones fenotípicas permite la comparación cross-species del fenotipo. - [Leído más PhenomicDB] |
| Sockeye - http://www.bcgsc.ca/gc/bomge/sockeye/ El Sockeye es una herramienta de la visualización permitiendo que una ensamble y que analice la información genomic en un espacio de trabajo tridimensional. Puede ser utilizado para ver características en los varios niveles, extendiéndose de SNPs a los karyotypes. El Sockeye visualiza características genomic a lo largo de pistas - [leído más Sockeye] |
| Herramientas de software de TIGR - http://www.tigr.org/software/ Una lista de paquetes de programas informáticos de la abrir-fuente disponibles para libre del instituto para la investigación de Genomic (TIGR). - [Leído más herramientas de software de TIGR] |
| TraFaC - http://trafac.cchmc.org/trafac/index.jsp TraFaC (comparación del punto de enlace del factor de la transcripción) es una herramienta a que las regiones reguladoras de los identifes usando un análisis comparativo de la secuencia se acercan. - [Leído más TraFaC] |
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