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Herramientas de RNAi y de SiRNA
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ARNA del diseño del RNA de Antisense -
http://www.idtdna.com/Scitools/Applications/AntiSense/Antisense.aspx/ Herramienta de diseño del RNA de Antisense - [leído más aRNA del diseño del RNA de Antisense] |
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Diseñador de BLOCK-iT RNAi -
https://rnaidesigner.invitrogen.com/rnaiexpress/ Permite que usted diseñe siRNA, el RNA de Stealth, o las moléculas sintetizado del shRNA de secuencias de la blanco del nucleotide, o convierte una secuencia de la molécula del siRNA en una molécula de Stealth?molecule o del shRNA. Utiliza su algoritmo propietario o las reglas de Tuschl para el siRNA diseñan, - [leído más diseñador de BLOCK-iT RNAi] |
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Herramienta de las guías de consulta del diseño del
shRNA de la conexión del gene -
http://www.genelink.com/sirna/shRNAi.asp Herramienta de las guías de consulta del diseño del shRNA de la conexión del gene. Herramienta de diseño del shRNA del explorador de RNAi - [leído más herramienta de las guías de consulta del diseño del shRNA de la conexión del gene] |
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Buscador de la blanco de GeneScript SiRNA - https://www.genscript.com/ssl-bin/app/rnai Buscador de la blanco de GeneScript SiRNA - [leído más buscador de la blanco de GeneScript SiRNA] |
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Conexiones para SiRNA y las herramientas de la
horquilla -
http://web.mit.edu/mmcmanus/www/home1.2files/siRNAs.htm Conexiones para SiRNA y las herramientas de la horquilla - [leído más conexiones para SiRNA y las herramientas de la horquilla] |
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Herramienta del diseñador de Promega SiRNA - http://www.promega.com/siRNADesigner/program/ Herramienta Del Diseñador De Promega SiRNA. Este programa no predice las horquillas, pero ' parta ' la tecnología desarrollada por Rossi y los colegas. Como varios otros programas enumerados abajo, un aspecto útil del programa es que el utilizador puede hacer clic encendido los siRNAs visualizados - [leído más herramienta del diseñador de Promega SiRNA] |
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convertidor Ambion - http://www.ambion.com/techlib/misc/psilencer_converter.html
del pSilencer Esta herramienta genera la horquilla siRNA-que codifica los separadores de millares del oligonucleotide de la DNA de una secuencia de la blanco del siRNA de la entrada de información. El programa agregará la secuencia y las proyecciones del bucle para reproducirse conforme a los manuales de instrucción de los vectores. Ambion - [leído más convertidor Ambion del pSilencer] |
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Base de datos de RNAi para C.Elegans - http://nematoda.bio.nyu.edu/cgi-bin/rnai/index.cgi Base de datos De RNAi. Esta base de datos contiene datos phenotypic de estudios de interferencia del RNA en elegans de la C.. Entre en RNAiDB usando una de las opciones de la búsqueda abajo - [leído más base de datos de RNAi para C.Elegans] |
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RNAi Oligoretriever -
http://katahdin.cshl.org:9331/RNAi/html/rnai.html RNAi Oligoretriever. Laboratorio de Hannon - [leído más RNAi Oligoretriever] |
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Phenotypes Wormbase - http://www.wormbase.org/db/searches/rnai_search de
RNAi Phenotypes Wormbase de RNAi - [leído más phenotypes Wormbase de RNAi] |
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Herramienta de diseño de SciTools RNAi -
http://www.idtdna.com/Scitools/Applications/RNAi/RNAi.aspx/ Herramienta de diseño de SciTools RNAi con guía. - [leído más herramienta de diseño de SciTools RNAi] |
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Herramienta de diseño expresa de la cartilla de los
kits PCR del cassette de la expresión del siRNA de Silencerâ"¢ -
http://www.ambion.com/techlib/misc/SEC_converter.html Esta herramienta genera secuencias del oligonucleotide de la DNA del modelo de una secuencia de la blanco del siRNA de la entrada de información. Los diseños para el acercamiento del "dos-two-oligonucleotide" y del "solo-single-oligonucleotide" se visualizan. Se generan estos diseños usando el bucle, el adaptador y el RNA - [leído más herramienta de diseño expresa de la cartilla de los kits PCR del cassette de la expresión del siRNA de Silencerâ"¢] |
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SiRNA en Whitehead -
http://jura.wi.mit.edu/bioc/siRNAext/ SiRNA en Whitehead. Este sitio le ayuda a seleccionar siRNAs para golpear abajo de su gene del interés. Después de incorporar su secuencia o número de accession/gi, modelo que elige para sus nucleotides del oligo y los varios métodos del filtro, le presentarán con una lista del ol - [leído más SiRNA en Whitehead] |
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Base de datos de SiRNA -
http://www.rnainterference.org/Sequences.html Base de datos de SiRNA - [leído más base de datos de SiRNA] |
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Compilación de la base de datos de SiRNA - http://web.mit.edu/mmcmanus/www/siRNADB.html Base de datos de SiRNA compilada de fuentes publicadas. - [leído más compilación de la base de datos de SiRNA] |
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Base de datos Proteinlounge.com - http://www.proteinlounge.com/sirna_home.asp de
SiRNA Base de datos muy grande de la base de datos Proteinlounge.com SiRNA de SiRNA. ensayo de 5 días. - [leído más base de datos Proteinlounge.com de SiRNA] |
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Buscador a dos caras de SiRNA -
http://bioweb.pasteur.fr/seqanal/interfaces/sirna.html Buscador A dos caras De SiRNA. Duplex del siRNA de los hallazgos en mRNA (GRABE) - [leído más buscador a dos caras de SiRNA] |
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Sirna para el diseño de SiRNA -
http://sfold.wadsworth.org/sirna.pl Herramienta de Sirna para el diseño de SiRNA. - [leído más Sirna para el diseño de SiRNA] |
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Búsqueda Ambion - http://www.ambion.com/catalog/sirna_search.php de
SiRNA Búsqueda Ambion de SiRNA - [leído más búsqueda Ambion de SiRNA] |
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Selector De SiRNA -
http://hydra1.wistar.upenn.edu/Projects/siRNA/siRNAindex.htm La herramienta de diseño del siRNA explora un gene de la blanco para las secuencias del siRNA del candidato que satisfacen reglas utilizador-ajustables. Entonces defienden a los candidatos seleccionados para identificar esas secuencias del siRNA que sean específicas al gene del interés. Entre en su gene, soldado enrolado en el ejército o accessio - [leído más selector de SiRNA] |
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buscador de la blanco del siRNA. Ambion. - http://www.ambion.com/techlib/misc/siRNA_finder.html Sitios de la blanco del siRNA del hallazgo en su mRNA del interés usando las recomendaciones publicadas de Tuschl y a colegas para el diseño del siRNA. Una vez que estén identificadas, las blancos del siRNA se puedan enviar directamente a una de las herramientas de diseño kit-especi'ficas descritas abajo o sujetadas a a - [leído más buscador de la blanco del siRNA. Ambion.] |
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herramienta de diseño del modelo del siRNA -
http://www.ambion.com/techlib/misc/silencer_siRNA_template.html herramienta de diseño del modelo del siRNA para el kit® Ambion de la construcción del siRNA de SilencerÂ. - [leído más herramienta de diseño del modelo del siRNA] |
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SiSearch -
http://sonnhammer.cgb.ki.se/siSearch/siSearch_1.7.html el siSearch se diseña para seleccionar los siRNAs basados en los acercamientos derivados de la explotación minera de los datos de nuestra base de datos del siRNA. También permitimos que los métodos comunes de diseño del siRNA sean incluidos en la búsqueda. Esto incluye reglas del adorno, condiciones de la energía y buscar de la especificidad. En - [leído más SiSearch] |
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La base de datos humana del siRNA - http://itb1.biologie.hu-berlin.de/~nebulus/sirna/ La base de datos humana del siRNA. HuSiDa es una base de datos pública que sirve como almacén para ambos, secuencias de las moléculas funcionales publicadas del siRNA que apuntan genes humanos y los detalles técnicos importantes del gene correspondiente que silencia experimentos. Tiene como objetivo - [más leído la base de datos humana del siRNA] |
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La biblioteca del shRNA del consorcio de RNAi - http://www.broad.mit.edu/genome_bio/trc/rnai.html La biblioteca del shRNA del consorcio de RNAi. El RNA corto de la horquilla (shRNA) se reproduce producido por el TRC, así como los protocolos para las pantallas de dirección y que conducen con las moléculas del shRNA. La biblioteca del shRNA del consorcio de RNAi se distribuye como acción bacteriana del glicerol, plasmid - [más leído la biblioteca del shRNA del consorcio de RNAi] |
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