Herramientas De la Identificación De la Proteína

AACompIdent. Identifique una proteína por su composición de aminoácido. ExPASY. - [leído más AACompIdent]

AACompSim es una herramienta que permite que la comparación de la composición de aminoácido de una entrada del Suizo-Prot con el resto de las entradas del Suizo-Prot para encontrar las proteínas que composiciones de aminoácido están las más cercanas a la de la entrada seleccionada. ExPASY. - [leído más herramienta de AACompSim]

Aldente. Identifique las proteínas con datos de la huella dactilar de la masa del peptide. Una herramienta nueva, rápida y de gran alcance que se aprovecha de la transformación de Hough para la recalibración de los espectros y la exclusión del afloramiento. ExPASy - [leído más Aldente]

Las tomas de CysView como varios formatos anotados de la entrada de información de las secuencias de la proteína, y visualizan gráficamente el cysteine que empareja modelos. También agrupa las proteínas con los modelos similares de la conectividad del disulfuro. - [leído más CysView]

Prediga las modificaciones poste-de translacio'n de la proteína potencial y las solas substituciones potenciales del aminoácido en peptides. Las masas experimental medidas del peptide se comparan con los peptides teóricos calculados de una entrada especificada del Suizo-Prot. ExPASy - [leído más FindMod]

Identifique los peptides que resultan de la hendidura no específica de proteínas de sus masas experimentales, considerando las modificaciones químicas artefactual, modificaciones poste-de translacio'n (PTM), hendidura autolytic del protease. ExPASy - [leído más FindPept]

El programa del análisis del disulfuro de Genomic (GDAP) predice los enlaces de disulfuro para una secuencia user-supplied de la proteína. GDAP también proporciona al acceso a las predicciones pre-computadas de los enlaces de disulfuro para más de 100 genomas microbianos. - [leído más GDAP]

Prediga las estructuras posibles del oligosaccharide que ocurren en las proteínas de sus masas experimental resueltas (puede ser utilizado para los oligosaccharides libres o derivatizados y para los glycopeptides). ExPASy - [leído más GlycoMod]

IsotopIdent. Predice la distribución isotópica teórica de un compuesto del peptide, de la proteína, del polynucleotide o del producto químico. - [leído más IsotopIdent]

El LINKER es una herramienta para diseñar las secuencias del peptide del linker para el uso en la construcción de las proteínas de la fusión. El utilizador proporciona a la longitud deseada del linker en angstromes o el número de residuos, y varios otros apremios se pueden también especificar, inc. - [leído más LINKER]

Mascota. Huella digital total del peptide, interrogación de la secuencia y búsqueda del ion de MS/MS ciencia Ltd., Londres de la matriz. - [leído más mascota]

MultiIdent. Identifique las proteínas con el pi, el Mw, la composición de aminoácido, la etiqueta de la secuencia y datos totales de la huella dactilar del peptide. ExPASY. - [leído más MultiIdent]

OMSSA. Identificación de los espectros del peptide de MS/MS buscando las bibliotecas de las secuencias sabidas de la proteína. - [leído más OMSSA]

PepMAPPER. Herramienta total de UMIST, Reino Unido de la huella dactilar del peptide. - [leído más PepMAPPER]

PepSea. Identificación de la proteína por el peptide que asocia o el peptide que ordena de Protana, Dinamarca - [leído más PepSea.]

Masa Del Peptide. Calcule las masas de peptides y de sus modificaciones poste-de translacio'n para una entrada de UniProtKB/Swiss-Prot o de UniProtKB/TrEMBL o para una secuencia de utilizador. ExPASY. - [leído más masa del peptide]

Cortador del peptide. Predice sitios potenciales del protease y de la hendidura y los sitios hendidos por los productos químicos en una secuencia dada de la proteína. ExPASY. - [leído más Peptidecutter]

Hiende una secuencia de la proteína con una enzima elegida y computa las masas de los peptides generados. - [leído más PeptideMass]

PFMUTS. Muestra las mutaciones solas y dobles posibles de un fragmento del peptide de la huella dactilar de la masa del peptide de MALDI. - [leído más PFMUTS]

Phenyx. Proteína y peptide identification/characterization de datos de PMF y de MS/MS de GeneBio, Suiza - [leído más Phenyx]

Favorable encontrado es Search Engine de Proteometrics para obtener secuencias de la proteína ese mejor emparejamiento una lista de las masas del peptide. Utiliza un algoritmo bayesian bien-probado para identificar las proteínas basadas en muchos criterios, por ejemplo: - [ más profundo leída.]

La proteína Info es Search Engine de Proteometrics que obtiene las secuencias de la proteína que corresponden con un adorno determinado de la secuencia. Los fragmentos de la información de la secuencia se pueden incorporar y todas las secuencias que corresponden con que el modelo en una base de datos determinada está extraído. Proteína - [leído más ProteinInfo]

Prospector De la Proteína. Una variedad de herramientas de UCSF (Ms-Quepa, Ms-Etiqueta, Ms-Digieren, etc.) para las bases de datos de la secuencia que minan conjuntamente con experimentos del spectrometry total. - [leído más ProteinProspector]

Peso molecular del cálculo, pi teórico, composición de aminoácido, composición atómica, coeficiente de la extinción, período estimado, índice de la inestabilidad, índice alifático y promedio magnífico de hydropathicity. - [leído más ProtParam]

VAGABUNDEO. Química de proteína y recurso del spectrometry total de Rockefeller y de universidades de NY - [leído más VAGABUNDEO]

El servidor que proporciona a diagramas del árbol del racimo de una proteína basó en los átomos o el hydrophobicity cargados de cada uno de sus residuos. El diagrama permite el examen visual de la distribución de regiones hidrofóbicas y cargadas en proteínas. - [leído más Qgrid]

El Search Engine del sonar MS/MS es Search Engine de Proteometrics para identificar las proteínas usando la información de MS/MS de los peptides del resumen. Se ha diseñado específicamente para las necesidades de la automatización de la identificación de la proteína, usando conceptos del descubrimiento y diseña t - [leído más Search Engine del sonar MS/MS.]

Identificación De la Etiqueta. Identifique las proteínas con el pi, la etiqueta del Mw y de la secuencia, o genere una lista de proteínas cerca de un pi y de un Mw. dados ExPASY. - [leído más TagIdent]

Incluye las estructuras y las características químicas, accesibilidad solvente, las modificaciones poste-de translacio'n, y más; con referencias. - [más leído el depósito del aminoácido]