Dominios de la proteína y predicción del adorno

TAJE toma una secuencia de la proteína como entrada de información, y devuelve una lista de fragmentos de la secuencia de la proteína con homología a los dominios del PDB y de Pfam y a las proteínas de la base de datos de SWISS-PROT. - [Leído más TAJADA]

Los racimos de grupos de Orthologous representan dominios conservados antiguos de la proteína; utilice la herramienta de COGnitor para encontrar los DIENTES en orden del interés. - [Leído más dientes]

Herramienta para la predicción de los sitios funcionales de la proteína eucariótica que señala dominio, adorno, y la información del modelo de la secuencia para su secuencia de entrada de información. - [Leído más OLMO: Recurso linear eucariótico del adorno]

FunShift es una base de datos que salva la clasificación de la subfamilia de Pfam para las familias del dominio de la proteína y las analiza para los cambios funcionales usando tarifas de la substitución y rotaciones evolutivas de la conservación. - [Leído más FunShift]

Base de datos integrada de las bases de datos de uso general de la firma (e.g. PROSITE, de las IMPRESIONES, de ELEGANTE, Pfam, ProDom); búsquedas del texto y secuencia-basado. - [Leído más InterPro]

El servidor de MyHits integra varias herramientas con un foco en la anotación de la proteína y el análisis de los dominios de la proteína. Los utilizadores de la huésped tienen acceso a las herramientas tales como ClustalW y T-Café y las bases de datos como Suizo-Prot, Prosite e Interpro. El registro nos permite - [leído más MyHits]

Predice el tipo sitios de la mucina de GalNAc O-glycosylation en proteínas mamíferas. - [Leído más servidor de la predicción de NetOGlyc]

NRPS-PKS es una herramienta que abarca cuatro bases de datos integradas para el análisis de los megasynthases multi-enzimáticos grandes del multi-dominio. El utilizador puede someter una secuencia de la interrogación para buscar para los dominios o para ver las características de los productos. - [Leído más NRPS-PKS]

Colección de alineaciones múltiples de la secuencia y de modelos de Markov ocultados que cubren muchos dominios comunes de la proteína. - [Leído más Pfam]

Base de datos de los sitios experimental verificados de la fosforilación en proteínas eucarióticas. Las anotaciones se hacen manualmente y las entradas de la base de datos vienen de y se conectan de nuevo a la literatura científica. Phospho.ELM incorpora los datos encontrados antes en PhosphoBase. - [Leído más Phospho.ELM]

PhosphoSite es una base de datos curated de los sitios ines vivo de la fosforilación del ser humano y del ratón. La base de datos contiene secuencias y localizaciones dentro de dominios y los adornos para los sitios de la fosforilación, y conexiones del péptido a los recursos y a las referencias útiles de la literatura. F - [leído más PhosphoSite]

Base de datos de las familias y de los dominios de la proteína definidos de la base de datos de SwissProt; considere también controlar bases de datos específicas del adorno tales como PhosphoBase. - [Leído más PROSITE]

Explore su secuencia contra la base de datos de PROSITE para los adornos funcionales; considere también controlar bases de datos específicas del adorno tales como PhosphoBase. - [Leído más ScanProsite]

SledgeHMMER es una herramienta para buscar la base de datos de Pfam usando una versión hecha parelelismo del hmmpfam del programa. El utilizador puede realizar interrogaciones con una o más secuencias al mismo tiempo y después recibir los resultados por el email. - [Leído más SledgeHMMER]

ELEGANTE (herramienta modular simple de la investigación de la configuración) es una herramienta del Web para la identificación y la anotación de los dominios de la proteína, y proporciona a una plataforma para el estudio comparativo de las configuraciones complejas del dominio en genes y proteínas. - [MÁS ELEGANTES leída]