Regulación del gene

Las CUMBRES (motor que corresponde con contento avanzado para las secuencias) son un servidor que se puede utilizar para buscar para las repeticiones cortas (entre 3 y 10 000 bases) a través de la especie múltiple. Los utilizadores pueden limitar resultados de una búsqueda por búsquedas de palabra clave. - [Leído más CUMBRES]

Trate la extracción por lotes y el análisis de las regiones cis-Reguladoras (BEARR) toma una lista de identificadores del gene (tales como IDs de RefSeq y de Unigene), de modelos del consenso, y (opcionalmente) de una matriz del peso de la posición como la entrada de información y vueltas una lista de emparejamientos para los modelos en bot - [leído más BEARR]

Servidor que explora contracorriente desde genes en el mismo racimo de la expresión de gene para los adornos reguladores de la secuencia usando una estrategia de muestreo de Gibbs. El modelo de Markov del fondo se utiliza para las bases del no-adorno, mejorando la especificidad de las localizaciones previstas del adorno. - [Leído más BioProspector]

El servidor que analiza microarray y datos de la secuencia del promotor se asoció a una respuesta a un estímulo específico. Después de análisis se crea una red reguladora transcriptiva potencial. CARRIE también determina qué factores de la transcripción eran invol probable - [leído más CARRIE]

El servidor que intenta identificar cualquier adorno se relacionó con los genes previstos a los elementos reguladores de la parte. Altera el muestreo de Gibbs con predisponer búsquedas hacia secuencias conservadas a través de especies múltiples. - [Leído más CompareProspector]

El buscador conservado del punto de enlace del factor de la transcripción (CONFAC) toma una lista de nombres humanos y de identificadores del gene como entrada de información, y los compara con sus orthologues del ratón para identificar puntos de enlace conservados del factor de la transcripción. Información adicional de t - [leído más CONFAC]

Detecte los puntos de enlace del factor de la transcripción en secuencias genomic usando huella filogenético y perfiles obligatorios experimental-confirmados. - [Leído más Consite]

La NATA (explorador Cis-Regulador del módulo para el genoma humano) es una herramienta para identificar y visualizar los módulos cis-reguladores para un conjunto dado de los genes que potencialmente co-se expresan o co-se regulan. Toma como la entrada de información una lista de números de accesión, y re - [leído más NATA]

Este Web site contiene software de análisis del microarray (Argus y Z-piscina), una base de datos endotelial de la expresión de la célula, y otros recursos relacionados con la investigación vascular del endotelio. Vea los extractos de PubMed para más información. - [Leído más programas transcriptivos de definición en endotelio vascular]

Filetee que ayuda en el diseño y el control de calidad de pequeño RNAs de interferencia (siRNAs) para interferencia del ARN (RNAi) y silenciar del gene. Evalúa la potencia inhibitoria de las secuencias potenciales del siRNA así como la identificación de las regiones del gene que tienen un alto sil - [leído más DEQOR]

Base de datos de los puntos de enlace del factor de la transcripción creados del curation de la literatura y de la anotación sistemáticos del genoma de las huellas de la ADNasa I para la Drosophila. - [Leído más base de datos de la huella de la ADNasa I de la Drosophila]

Eponine es un método de probabilidad para detectar los sitios del comienzo de la transcripción (TSS) en secuencia genomic mamífera, con buena especificidad y exactitud posicional excelente. - [Leído más Eponine]

El primer buscador del exón (FirstEF) es ' programa terminal de la predicción del exón 5 y del promotor. Consiste en diversas funciones discriminantes estructuradas como árbol de decisión. - [Leído más FirstEF]

Tenga acceso a las bases de datos, a los programas y a los papeles relacionados con la regulación del gene. - [Leído más regulación del gene]

Servidor extenso que posee una amplia gama de las herramientas para el descubrimiento del modelo en secuencias de la DNA y de la proteína así como en el texto. Las herramientas para la alineación múltiple de la secuencia, el descubrimiento del gene, la anotación de la proteína, y otras aplicaciones también existen en este servidor. Un detalle - [leído más grupo de la bioinformática de IBM y del descubrimiento del modelo]

JASPAR es una colección non-redundant, curated de perfiles obligatorios del factor de la transcripción. Cada perfil se genera de puntos de enlace eucarióticos publicados, experimental definidos del factor de la transcripción. - [Leído más JASPAR]

Búsqueda para los puntos de enlace potenciales del factor de la transcripción en sus propias secuencias usando matrices de TRANSFAC; libere para el uso no comercial. - [Leído más MatInspector]

El servidor diseñó establecer claramente sitios de la interacción proteína-DNA en los pares bajos llanos. Las aplicaciones Viruta-ponen en orden los datos, la enumeración de la palabra y la matriz posición-específica del peso poniéndose al día para buscar para los adornos que representan estos sitios de la interacción. - [Leído más MDscan]

MSCAN toma mientras que la entrada de información una o más secuencias de la DNA y un conjunto de transcripción descompone en factores perfiles del punto de enlace. Entonces detecta los racimos de los puntos de enlace en las secuencias. - [Leído más MSCAN]

El Web site del grupo humano de la bioinformática de la genética del cáncer de la universidad de estado de Ohio. Este sitio tiene muchos recursos, incluyendo bases de datos de promotores y de factores de la transcripción, herramientas de software para predecir puntos de enlace potenciales del consenso P53 y a predecir - [leído más bioinformática de OSU y biología de cómputo]

Un servidor para la detección, la comparación y la verificación de la transcripción descomponen en factores adornos del punto de enlace en promotores. El análisis de la carga inicial de POBO aplicado a uno o dos racimos de genes co-regulados detecta adornos bajo niveles extremos de representación. - [Leído más POBO]

Compara dos secuencias de la DNA teniendo en cuenta inversiones y desplazamientos, ideal para los promotores. - [Leído más PromoterWise]

Base de datos de las familias y de los dominios de la proteína definidos de la base de datos de SwissProt; considere también controlar bases de datos específicas del adorno tales como PhosphoBase. - [Leído más PROSITE]

Red investigable de la literatura de genes humanos con las herramientas para el análisis de la expresión de gene. Elija del servicio público libre, o compre el conjunto comercial. - [Leído más PubGene]

El programa de la búsqueda del adorno del ARN que identifica adornos del ARN llamó los riboswitches que son los dominios obligatorios metabólicos en el mRNA que regulan la expresión de gene. El programa fue diseñado originalmente alrededor de un conjunto de riboswitches encontrados en bacilo subtilis. - [Leído más buscador de Riboswitch]

RiceTFDB (base de datos del factor de la transcripción del arroz) es una base de datos de secuencias y de alineaciones para los factores de la transcripción en arroz. - [Leído más RiceTFDB]

Servidor que detecta los puntos de enlace del factor de la transcripción (TFBS) con combinar la predicción de TFBS, comparación de la secuencia y análisis de racimo. - [Leído más rVISTA]

Servidor con tres herramientas para el diseño racional de pequeño RNAs de interferencia (Sirna), de oligonucleótidos antisentido (Soligo), y de transporte-hender los ribozymes (Sribo). Una cuarta herramienta, Srna, vuelve salida incluyendo características plegables generales. - [Leído más Sfold]

Servidor que ayuda al diseño de RNAs de interferencia corto (siRNAs) proporcionando a la información en estabilidad, SNPs y la especificidad de un siRNA potencial. - [Leído más servidor de la selección del siRNA]

Este recurso incluye el siSearch, AOSearch, y un siRNAdb que proporcione a una plataforma para minar una base de datos del siRNA, y la búsqueda para los emparejamientos no específicos a su siRNA (pequeño RNAs de interferencia). - [Leído más siRNAdb]