Herramientas de Bioinformatic de la expresión del gene y del análisis de Microarray.
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Bingo -
http://www.psb.ugent.be/cbd/papers/BiNGO/ El bingo es una herramienta Java-basada para determinarse son qué categorías de Ontology del gene (VAYA) overrepresented estadístico en un conjunto de genes o un subgraph de una red biológica. - [leído más bingo] |
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APRIETE -
http://www.personal.psu.edu/faculty/n/h/nhs109/Clench/ Un programa para calcular análisis del enriquecimiento del racimo y la visualización integrada de los datos del sitio obligatorio del factor de la expresión, de la anotación y de la transcripción usando el gene Ontology. - [leído más APRIETE] |
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DAVID -
http://david.niaid.nih.gov/ La base de datos para la anotación, la visualización y el descubrimiento integrado (DAVID) es una herramienta Web-basada que proporciona a las soluciones integradas para la anotación y el análisis de los datasets de genoma-scale derivados de tecnologías del alto-rendimiento de procesamiento tales como microarray y proteo - [leído más DAVID] |
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FACILIDAD -
http://david.niaid.nih.gov/david/ease.htm Útil para resumir el "tema biológico predominante" de una lista dada del gene. De una lista de genes de experimentos microarray u otros de genoma-scale, la FACILIDAD puede calcular rápidamente la estadística de la sobre-representacio'n para cada término posible de Ontology del gene con res - [leído más FACILIDAD] |
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ermineJ -
http://microarray.genomecenter.columbia.edu/ermineJ/ el ermineJ es una herramienta para el análisis de los conjuntos del gene (el utilizador definido o ésos definidos cerca VA los términos) en datos de la expresión. El software se diseña para ser utilizado por los biólogos con poco o nada de fondo de la informática. Una comando-li'nea interfaz está disponible para los utilizadores que - [leído más ermineJ] |
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Datos microarray de la gene-expresio'n de Ontologizing: - http://www.charite.de/ch/medgen/ontologizer/ Se describe una aplicación XML-basada de Java que proporciona a una descripción funcio'n-orientada de los resultados del análisis del racimo de los datos microarray de la gene-expresio'n basados en los términos y las asociaciones de Ontology del gene. La aplicación genera un HTML page con listi - [leído más datos microarray de la gene-expresio'n de Ontologizing:] |
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