Las CUMBRES (motor que corresponde con contento avanzado para las secuencias) son un servidor que se puede utilizar para buscar para las repeticiones cortas (entre 3 y 10 000 bases) a través de la especie múltiple. Los utilizadores pueden limitar resultados de una búsqueda por búsquedas de palabra clave. - [Leído más CUMBRES]
Alinea elementos conservados del ácido nucléico; utiliza el reconocimiento de modelo para encontrar elementos conservados en un conjunto de secuencias de la DNA; libere para el uso no comercial con el contrato de licencia. - [Leído más AlignACE]
Trate la extracción por lotes y el análisis de las regiones cis-Reguladoras (BEARR) toma una lista de identificadores del gene (tales como IDs de RefSeq y de Unigene), de modelos del consenso, y (opcionalmente) de una matriz del peso de la posición como la entrada de información y vueltas una lista de emparejamientos para los modelos en bot - [leído más BEARR]
BioMart es un sistema interactivo de la integración de datos que facilita interrogaciones en grande de los datos. Puede ser instalado y ser utilizado en el local, o con uno de existencia las fuentes de datos a las cuales está se han aplicado ya (IE. UniProt, Ensembl). - [Leído más BioMart]
Servidor que explora contracorriente desde genes en el mismo racimo de la expresión de gene para los adornos reguladores de la secuencia usando una estrategia de muestreo de Gibbs. El modelo de Markov del fondo se utiliza para las bases del no-adorno, mejorando la especificidad de las localizaciones previstas del adorno. - [Leído más BioProspector]
Contenido de la CROMATOGRAFÍA GASEOSA del hallazgo y frecuencia del uso del codón para cualquie organismo que tenga una secuencia en GenBank. - [Leído más base de datos del uso del codón]
El servidor que intenta identificar cualquier adorno se relacionó con los genes previstos a los elementos reguladores de la parte. Altera el muestreo de Gibbs con predisponer búsquedas hacia secuencias conservadas a través de especies múltiples. - [Leído más CompareProspector]
Detecte los puntos de enlace del factor de la transcripción en secuencias genomic usando huella filogenético y perfiles obligatorios experimental-confirmados. - [Leído más Consite]
La NATA (explorador Cis-Regulador del módulo para el genoma humano) es una herramienta para identificar y visualizar los módulos cis-reguladores para un conjunto dado de los genes que potencialmente co-se expresan o co-se regulan. Toma como la entrada de información una lista de números de accesión, y re - [leído más NATA]
Este sitio proporciona a varias herramientas de software de la bioinformática embaladas juntas para la instalación fácil en los ordenadores de MacOSX. El software incluye las herramientas de NCBI, LAS GRABA, ClustalW, Staden, T-Café y Primer3. - [Leído más eBioinformatics]
Habitación diversa de las herramientas para el análisis de la secuencia; muchos programas análogos a GCG; ayuda sensible al contexto para cada herramienta. - [Leído más GRABE]
Eponine es un método de probabilidad para detectar los sitios del comienzo de la transcripción (TSS) en secuencia genomic mamífera, con buena especificidad y exactitud posicional excelente. - [Leído más Eponine]
Secuencias de nucleótido de las búsquedas del VENTILADOR (análisis de la huella digital de las secuencias de nucleótido) contra la base de datos de las IMPRESIONES, una colección de huellas digitales de la proteína usadas para asignar secuencias desacostumbradas a las familias conocidas y por lo tanto para deducir funciones tentativas. - [Leído más VENTILADOR]
El primer buscador del exón (FirstEF) es ' programa terminal de la predicción del exón 5 y del promotor. Consiste en diversas funciones discriminantes estructuradas como árbol de decisión. - [Leído más FirstEF]
Esta herramienta permite que usted identifique adornos o regiones conservadas en proteína o secuencias de la DNA. - [Leído más dechado del adorno de Gibbs]
La máquina segador proporciona a de rápido acceso a las bases de datos y a los servidores bioinformatic públicos para las proteínas humanas. Los resultados se vuelven como solo HTML page que contenga la salida ocultada y reticulada de las bases de datos/de los servidores siguientes: Uniprot/SWISSprot, ensEMBL, - [leído más máquina segador]
Servidor extenso que posee una amplia gama de las herramientas para el descubrimiento del modelo en secuencias de la DNA y de la proteína así como en el texto. Las herramientas para la alineación múltiple de la secuencia, el descubrimiento del gene, la anotación de la proteína, y otras aplicaciones también existen en este servidor. Un detalle - [leído más grupo de la bioinformática de IBM y del descubrimiento del modelo]
IslandPath ayuda a la detección genomic de la isla en seqeunces procarióticos del genoma, usando características tales como diagonal del dinucleótido, G+C, la localización de los genes del tRNA, las anotaciones de los genes de la movilidad, las islas del etc. Genomic se definen aquí como regiones genomic de horizonta potencial - [leído más IslandPath]
JASPAR es una colección non-redundant, curated de perfiles obligatorios del factor de la transcripción. Cada perfil se genera de puntos de enlace eucarióticos publicados, experimental definidos del factor de la transcripción. - [Leído más JASPAR]
LowComplexity es una herramienta que busca para las regiones bajas de la complejidad de secuencias de la DNA o de la proteína. Usando LowComplexity usted puede buscar secuencias largas (cromosomas, genomas) o un conjunto de secuencias alineadas. Este recurso también contiene conexiones a otros algoritmos f - [leído más LowComplexity]
El hojeador del genoma de Ensembl EnsMart (MartView) es una herramienta para la explotación minera de la extracción de datos y de datos que integra datos de Ensembl. A través del interfaz del Web MartView permite que usted aplique una serie de filtros para crear los grupos de datos de encargo que se pueden convertir a s - [leído más MartView]
MaskerAid es un realce a RepeatMasker que pueda efectuar alrededor de un aumento de 30 dobleces en la velocidad de RepeatMasker mientras que mantiene sensibilidad. - [Leído más MaskerAid]
Búsqueda para los puntos de enlace potenciales del factor de la transcripción en sus propias secuencias usando matrices de TRANSFAC; libere para el uso no comercial. - [Leído más MatInspector]
Las estadísticas de las aplicaciones del servidor de la predicción del promotor de la cadena de Markov (McPromoter) para predecir sitios eucarióticos del comienzo de la transcripción de la DNA. - [Leído más McPromoter]
El servidor diseñó establecer claramente sitios de la interacción proteína-DNA en los pares bajos llanos. Las aplicaciones Viruta-ponen en orden los datos, la enumeración de la palabra y la matriz posición-específica del peso poniéndose al día para buscar para los adornos que representan estos sitios de la interacción. - [Leído más MDscan]
Analiza un conjunto de las secuencias de la DNA o de la proteína para las semejanzas entre ellas y produce una descripción (adorno) para cada modelo que descubre. - [Leído más MEME]
Crea el modelo de Markov ocultado del adorno de la salida de MEME y busca la base de datos de la secuencia para los emparejamientos a este adorno. - [Leído más Meta-MEME]