Herramientas de la predicción del gene, genes que predicen software y bioinformática en línea.
| Agenda - http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/agenda/ La agenda es una herramienta del Web que compara las secuencias genomic de organismos evolutionarily relacionados para hacer predicciones del gene. Toma pares de secuencias genomic como entrada de información, alinea las secuencias, y hace las predicciones basadas en las señales del empalme, comienzo y - [leído más agenda] |
| AUGUSTUS - http://augustus.gobics.de/submission AUGUSTUS es una herramienta eucariótica de la predicción del gene que emplea un método más exacto para modelar la distribución de la longitud del intrón. Es determinado eficaz con secuencias más grandes. Puede ser ejecutado a través de un interfaz del Web, o ser descargado y ejecutarse localmente. - [Leído más AUGUSTUS] |
| RÁFAGA - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ Herramienta local básica de la búsqueda de la alineación; extraiga las secuencias similares a su interrogación. - [Leído más RÁFAGA] |
| GeneComber - http://bioinformatics.ubc.ca/genecomber/index.php GeneComber es ab initio una herramienta de la predicción del gene desarrollada en el centro de la bioinformática de UBC. Integra resultados a partir de dos buscadores externamente desarrollados del gene y funciona encendido la premisa que si estos buscadores de dos genes están de acuerdo con una predicción, nosotros puede ser más c - [leído más GeneComber] |
| GeneMark - http://opal.biology.gatech.edu/GeneMark/ La familia de GeneMark de programas emplea modelos de Markov y se templa específicamente para la predicción del gene para las secuencias de prokaryotes, de genomas virales y de eucariotas. - [Leído más GeneMark] |
| GenomeScan - http://genes.mit.edu/genomescan.html Incorpora la información de la semejanza de la proteína al predecir genes; basado en parte en GENSCAN. - [Leído más GenomeScan] |
| GENSCAN - http://genes.mit.edu/GENSCAN.html Identificación de las estructuras completas del gene en la DNA genomic. - [Leído más GENSCAN] |
| Luz tenue - http://www.tigr.org/softlab/glimmer/glimmer.html Localizador del gene y Modeler de Markov interpolado; este prokaryote-gene que encuentra la herramienta es el buscador microbiano primario del gene usado en TIGR; libere (código fuente incluyendo) con el registro para el uso no comercial. - [Leído más luz tenue] |
| Grail - http://compbio.ornl.gov/Grail-1.3/ El Grail es una habitación de herramientas que reconoce características de la secuencia como promotores, candidatos del exón, repeticiones simples y elementos repetidores complejos. También modela los genes basados en los candidatos del exón. - [Leído más Grail] |
| HMMgene - http://genome.cbs.dtu.dk/services/HMMgene/ Predicción de los genes del vertebrado y de los elegans de la C. - [Leído más HMMgene] |
| Grupo de la bioinformática de IBM y del descubrimiento del modelo - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Tspd.html Servidor extenso que posee una amplia gama de las herramientas para el descubrimiento del modelo en secuencias de la DNA y de la proteína así como en el texto. Las herramientas para la alineación múltiple de la secuencia, el descubrimiento del gene, la anotación de la proteína, y otras aplicaciones también existen en este servidor. Un detalle - [leído más grupo de la bioinformática de IBM y del descubrimiento del modelo] |
| Buscador del ORF - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html Encuentra marcos de lectura todo abiertos en una secuencia. - [Leído más buscador del ORF] |
| Herramientas de software de TIGR - http://www.tigr.org/software/ Una lista de paquetes de programas informáticos de la abrir-fuente disponibles para libre del instituto para la investigación de Genomic (TIGR). - [Leído más herramientas de software de TIGR] |
| Twinscan - http://genes.cs.wustl.edu/ Twinscan es un sistema para la gene-estructura que predice en secuencias genomic eucarióticas. Para hacer sus predicciones, las cosechadoras de Twinscan la información de regiones de codificación previstas y del empalme localizan con medidas del conserservation entre el SE de la blanco - [leído más Twinscan] |
| RÁFAGA de WU - http://blast.wustl.edu/ Herramienta local básica de la búsqueda de la alineación de la universidad de Washington - [leído más RÁFAGA de WU] |
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