Πρωτεϊνική μεταλλακτική βιοπληροφορική ανάλυσης.

Τα εργαλεία Bioinformatic είναι σε θέση να προβλέψουν τη δομή μιας πρωτεϊ'νης είτε στις 2-διαστάσεις (2$ος) είτε τις τρεις-διαστάσεις (τρισδιάστατες). Αυτό μπορεί να μην είναι μια πραγματική αντιπροσώπευση της πραγματικής δομής μιας πρωτεϊ'νης, εντούτοις είναι μια καλή αφετηρία για να προβλέψει τις ενζυματικές τσέπες, και πρωτεϊνικός-πρωτεϊνικές δικτυακές γειτονιές αλληλεπίδρασης. Μετά από την πρόβλεψη, η επιβεβαίωση της πρωτεϊνικής δομής μπορεί να γίνει χρησιμοποιώντας τις των ακτίνων X τεχνικές κρυσταλλογραφίας.

Προγράμματα Bioinformatic που χρησιμοποιούνται στις πρωτεϊνικές μεταλλαγές:

Συσχετισμένη πρωτεϊνική ανάλυση μεταλλαγών των συσχετισμένων μεταλλαγών

MutaProt: Σύγκριση των αρχείων PDB που διαφέρουν από τις μεταλλαγές σημείου

Βάσεις δεδομένων για τις πρωτεϊνικές μεταλλαγές - χρησιμοποιήστε αυτή την βάση δεδομένων στην αναζήτηση των γνωστών πρωτεϊνικών μεταλλαγών:

PMD: Πρωτεϊνική βάση δεδομένων μεταλλάξεων

PMR: Πρωτεϊνικά στοιχεία συμπεριφοράς μεταλλάξεων

HGVS: Ανθρώπινη κοινωνία παραλλαγής γονιδιώματος

Ενιαίοι πολυμορφισμοί νουκλεοτίδας για τη βιοϊατρική έρευνα: Κοινοπραξία SNP

Ενιαία αναζήτηση ονόματος κειμένων Entrez Pubmed πολυμορφισμών νουκλεοτίδας

Τα εργαλεία Bioinformatic μπορούν να προβλέψουν την επίδραση των μεταλλαγών στη δευτεροβάθμια δομή και την πρωτεϊνική λειτουργία. Μπορείτε να συγκρίνετε τα αποτελέσματα της πρωτεϊ'νης άγριος-τύπων με την πρωτεϊ'νη μεταλλάξεων και να εξετάσετε τα προβλεφθέντα πιθανά αποτελέσματα της μεταλλαγής.

Επιπλέον, το πειραματικό στοιχείο απαιτείται για να επιβεβαιώσει οποιαδήποτε bioinformatic πρόβλεψη των πρωτεϊνικών μεταλλάξεων. Αυτό μπορεί να γίνει με την εξέταση των βασικών υπολειμμάτων στην πρωτεϊνική λειτουργία ή τις πρωτεϊνικές δικτυακές γειτονιές αλληλεπίδρασης χρησιμοποιώντας την αντικατάσταση της ΑΛΑ (αλανίνη) και να αναλύσει το πειραματικό στοιχείο που οδηγεί.

Στείλετε αυτήν την σελίδα σε έναν φίλο

Βιοπληροφορική, πρωτόκολλα, RNA πρωτεϊνικό Proteomics DNA

Ενδοκυτταρικοί σταθμοί

Πρωτεϊνική μεταλλακτική βιοπληροφορική ανάλυσης.