GSTP1 υποστηρικτής - μη συγκεκριμένο προϊόν

[rob86]

Γειάσου,

Έχω ένα πρόβλημα με την ερμηνεία pcr του μήκους των προϊόντων. Το μήκος μιας ακολουθίας DNA προτύπων (ανθρώπινο γονίδιο-υποκινητής GSTP1) είναι για 1650bp και το μήκος ενός βασικού pcr προϊόντος είναι μεταξύ 700-800bp. Στο silico PCRs δείχνουν ότι το προϊόν πρέπει να είναι συγκεκριμένο. Τους ιοντικούς όρους (Mg), οι θερμοκρασίες και ο χρόνος pcr των φάσεων άλλαξαν στο σχετικά ευρύ φάσμα. Το αποτέλεσμα ήταν πάντα το ίδιο.

Εντούτοις, όταν επιλέγεται για να δώσει ο σωστός (αντίστροφος) εγχυτήρας ένα κοντύτερο προϊόν, περίπου 1500, από το αποτέλεσμα είναι σωστά.

Επίσης έχουμε χρησιμοποιήσει mfold για να μιμηθούμε εάν η ακολουθία προτύπων είναι σε θέση να δημιουργήσει μερικές πολύ σταθερές δομές. Για τους μέσους όρους 1.5mM το MG και το NA 50mM στην υψηλότερη θερμοκρασία 95°C μπορούν εκεί να υπάρξουν ένας ισχυρός μίσχος-βρόχος στην περιοχή 1570-1590bp αλλά ακόμα δεν εξηγεί το μήκος προϊόντων στο πεδίο 700-800bp.

Έχετε μερικές απόψεις, προτάσεις χρήσιμες να λύσουν αυτό το πρόβλημα;

Ευχαριστίες για οποιεσδήποτε οδηγίες!