 |
|---|
Δευτεροβάθμια πρόβλεψη δομών RNA. 2 "δομή του RNA που χρησιμοποιεί τις μ-πτυχές, mfold, τα bioinformatic εργαλεία on-line και το λογισμικό για να προβλέψει διπλώματος και hairpin RNA τους βρόχους.
| CARNAC -
http://bioinfo.lifl.fr/carnac Κεντρικός υπολογιστής που προβλέπει τα συντηρημένα δευτεροβάθμια στοιχεία δομών ομόλογου RNAs. Η είσοδος ενός συνόλου ακολουθιών RNA δεν πρέπει για να ευθυγραμμιστεί προηγουμένως. - [Διαβασμένος περισσότερο CARNAC] |
|
DEQOR -
http://cluster-1.mpi-cbg.de/Deqor/deqor.html Εργαλείο που ενισχύσεις στο σχέδιο και τον ποιοτικό έλεγχο της μικρής παρέμβασης RNAs (siRNAs) για την παρέμβαση RNA (RNAi) και να κατασιγάσει γονιδίων. Αξιολογεί την ανασταλτική δύναμη των πιθανών ακολουθιών siRNA καθώς επίσης και προσδιορίζοντας τις περιοχές γονιδίων που έχουν ένα υψηλό sil - [διαβασμένος περισσότερο DEQOR] |
|
ERPIN -
http://tagc.univ-mrs.fr/erpin/ ERPIN (εύκολο σχεδιάγραμμα IdentificatioN RNA) παίρνει ως είσοδο μια ευθυγράμμιση ακολουθίας RNA και έναν δευτεροβάθμιο σχολιασμό δομών και θα προσδιορίσει μια ευρεία ποικιλία των γνωστών μοτίβων RNA (όπως tRNAs, 5S RNA rRNAs, SRP, C/D κιβώτιο snoRNAs, hammerhead μοτίβα, miRNAs και othe - [διαβασμένος περισσότερο ERPIN] |
|
ILM -
http://cic.cs.wustl.edu/RNA/ Κεντρικός υπολογιστής που παρέχει το επαναλήφθείτ ταίριασμα βρόχων και τους μέγιστους σταθμισμένους ταιριάζοντας με αλγορίθμους για το pseudoknot που περιέχει τη δευτεροβάθμια πρόβλεψη δομών RNA. Οι αλγόριθμοι μπορούν να εφαρμόσουν τις θερμοδυναμικές και συγκριτικές πληροφορίες, και μπορούν έτσι να χρησιμοποιηθούν για είτε ευθυγραμμισμένος είτε - [διαβασμένος περισσότερο ILM] |
|
Kinefold -
http://kinefold.u-strasbg.fr/ Το Kinefold υπολογίζει (και ζωντανεύει) τις κινητικές διπλώματος των ακολουθιών RNA συμπεριλαμβανομένου pseudoknots. - [Διαβασμένος περισσότερο Kinefold] |
|
Mfold -
http://www.bioinfo.rpi.edu/applications/mfold/old/rna/ Προβλέψτε τη δευτεροβάθμια δομή RNA από την ακολουθία δεν προβλέπει pseudoknots - δείτε PKNOTS. - [Διαβασμένος περισσότερο Mfold] |
|
MolMovDB -
http://molmovdb.org/ Η βάση δεδομένων των μακρομοριακών Κινημάτων (MolMovDB) περιέχει μια συλλογή των ζωντανεψοντων δομών πρωτεϊ'νης και RNA για να βοηθήσει στην εξερεύνηση της μακρομοριακής ευελιξίας. Το λογισμικό για την ανάλυση δομών είναι επίσης διαθέσιμο. - [Διαβασμένος περισσότερο MolMovDB] |
|
MOLPROBITY -
http://kinemage.biochem.duke.edu/molprobity/main.php?use_king=1 MOLPROBITY είναι ένα πρόγραμμα ανάλυση και επικύρωση δομών που μπορεί να υπολογίσει και να παρουσιάσει στερικό, την χ-σύνδεση, και βαν δερ Waals τις αλληλεπιδράσεις για τις γνωστές δομές των πρωτεϊνών, των νουκλεϊνικών οξέων, και των συγκροτημάτων. - [Διαβασμένος περισσότερο MOLPROBITY] |
|
PKNOTS -
http://www.genetics.wustl.edu/eddy/software/#pk Προβλέψτε pseudoknot τις δομές στην ακολουθία RNA κώδικας πηγής μόνο. - [Διαβασμένος περισσότερο PKNOTS] |
|
RDfolder -
http://rna.cbi.pku.edu.cn:1977/rna/index.php Ένα δευτεροβάθμιο πρόγραμμα πρόβλεψης δομών RNA που εφαρμόζει δύο μεθόδους, μια βασισμένη στην τυχαία συσσώρευση και άλλη βασισμένη στις ελικοειδείς διανομές περιοχών. - [Διαβασμένος περισσότερο RDfolder] |
|
RNAfold -
http://www.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAfold.cgi Προβλέψτε τη δευτεροβάθμια δομή RNA από την ακολουθία σημειώστε το όριο μήκους ακολουθίας. - [Διαβασμένος περισσότερο RNAfold] |
|
RNAsoft -
http://www.rnasoft.ca/ Λογισμικό για το RNA/ti δευτεροβάθμια πρόβλεψη και το σχέδιο δομών DNA - [διαβασμένος περισσότερο RNAsoft] |
|
Sfold - http://sfold.wadsworth.org Κεντρικός υπολογιστής με τρία εργαλεία για το λογικό σχέδιο της μικρής παρέμβασης RNAs (Sirna), αντιαγγελιαφόρα oligonucleotides (Soligo), και της δια-διάσπασης ribozymes (Sribo). Ένα τέταρτο εργαλείο, Srna, επιστροφής έξοδος συμπεριλαμβανομένων των γενικών διπλώνοντας χαρακτηριστικών γνωρισμάτων. - [Διαβασμένος περισσότερο Sfold] |
|
siDirect -
http://design.RNAi.jp/ Κεντρικός υπολογιστής για τον υπολογισμό των μικρών παρεμβαίνοντας ακολουθιών RNA (siRNA) που είναι καταλληλότερες για τη μαστοφόρο παρέμβαση RNA (RNAi). Η περιοχή αποδέχεται μια ακολουθία ως είσοδο και επιστρέφει έναν κατάλογο υποψηφίων siRNA. - [Διαβασμένος περισσότερο siDirect] |
|
siRNA κεντρικός υπολογιστής επιλογής - http://jura.wi.mit.edu/bioc/siRNA Κεντρικός υπολογιστής που βοηθά το σχέδιο της σύντομης παρέμβασης RNAs (siRNAs) με την παροχή των πληροφοριών για τη σταθερότητα, SNPs και την ιδιομορφία ενός πιθανού siRNA. - [Διαβασμένος περισσότερο κεντρικό υπολογιστή επιλογής siRNA] |
| siRNAdb -
http://sirna.cgb.ki.se/ Αυτό το στοιχείο συμπεριφοράς περιλαμβάνει siSearch, AOSearch, και ένα siRNAdb που παρέχει μια πλατφόρμα για να εξαγάγει μια βάση δεδομένων siRNA, και την έρευνα για τις μη συγκεκριμένες αντιστοιχίες σε siRNA σας (μικρή παρέμβαση RNAs). - [Διαβασμένος περισσότερο siRNAdb] |
|
SStructView -
http://smi-web.stanford.edu/projects/helix/sstructview/ Δευτεροβάθμιο applet εμφανίσεων δομών RNA πρέπει να ενσωματωθείτε ιστοσελίδας που εφαρμόζεται μπορέστε να συνδέσετε με τα πολλαπλάσια υπολογιστικά backends. - [Διαβασμένος περισσότερο SStructView] |
| ΠΡΟΧΩΡΗΜΕΝΟΣ -
http://www.cellbio.unige.ch/RNAi.html T7 οληγο ενισχύσεις σχεδιαστών RNAi (ΠΟΥ ΠΡΟΧΩΡΟΎΝΤΑΙ) στο σχέδιο oligonucleotides DNA για τη σύντομη παρεμβαίνοντας σύνθεση RNA (siRNA) με T7 την πολυμεράση RNA. Παίρνει μια είσοδο μιας ακολουθίας DNA και των αποτελεσμάτων ένας κατάλογος oligos DNA για τη διαταγή. - [Διαβασμένος ΠΡΟΧΩΡΗΜΕΝΟΣ] |
|
Συσκευασία RNA της Βιέννης -
http://www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/ Περιλαμβάνει τη βιβλιοθήκη κώδικα εναλλασσόμενου ρεύματος και διάφορα αυτόνομα προγράμματα για την πρόβλεψη και τη σύγκριση των δευτεροβάθμιων δομών RNA. - [Διαβασμένος περισσότερη συσκευασία RNA της Βιέννησ] |
Στείλετε αυτήν την σελίδα
σε έναν φίλο
