Έκφραση γονιδίων και ανάλυση Microarray

Το BiNGO είναι ένα Ιάβα-βασισμένο στην εργαλείο για να καθορίσει ποιες κατηγορίες οντολογίας (GO) γονιδίων είναι στατιστικά υπεραντιπροσωπευμένες σε ένα σύνολο γονιδίων ή subgraph ενός βιολογικού δικτύου. - [Διαβασμένος περισσότερο BiNGO]

Ένα πρόγραμμα για την ανάλυση εμπλουτισμού τομέων και την ενσωματωμένη απεικόνιση των στοιχείων περιοχών συσχετισμών παράγοντα έκφρασης, σχολιασμών και μεταγραφής που χρησιμοποιούν την οντολογία γονιδίων. - [Διαβασμένος περισσότερο CLENCH]

Η βάση δεδομένων για το σχολιασμό, την απεικόνιση και την ενσωματωμένη ανακάλυψη (ΔΑΒΙΔ) είναι ένα βασισμένο στο WEB εργαλείο που παρέχει τις ενσωματωμένες λύσεις για το σχολιασμό και την ανάλυση των συνόλων δεδομένων γονιδίωμα-κλίμακας που προέρχονται από τις τεχνολογίες υψηλός-ρυθμοαπόδοσης όπως microarray και το proteo - [διαβασμένος περισσότερο ΔΑΒΙΔ]

Χρήσιμος για το κυρίαρχο βιολογικό "θέμα" ενός δεδομένου καταλόγου γονιδίων. Από έναν κατάλογο γονιδίων από τα microarray ή άλλα πειράματα γονιδίωμα-κλίμακας, η ΕΥΚΟΛΙΑ μπορεί γρήγορα να υπολογίσει τις στατιστικές υπερπαρουσίασης για κάθε πιθανό όρο οντολογίας γονιδίων με το Πε - [διαβασμένος περισσότερη ΕΥΚΟΛΊΑ]

ermineJ είναι ένα εργαλείο για την ανάλυση των συνόλων γονιδίων (χρήστης που καθορίζεται ή εκείνοι που καθορίζονται από GO τους όρους) στα στοιχεία έκφρασης. Το λογισμικό σχεδιάζεται για να χρησιμοποιηθεί από τους βιολόγους με ελάχιστο ή κανένα υπόβαθρο πληροφορικής. Μια διαπροσωπεία εντολή-γραμμών είναι διαθέσιμη για τους χρήστες που - [διαβασμένος περισσότερο ermineJ]

Μια ξμλ-βασισμένη εφαρμογή της Ιάβας περιγράφεται που παρέχει μια λειτουργία-προσανατολισμένη στο επισκόπηση των αποτελεσμάτων της ανάλυσης τομέων των microarray στοιχείων γονίδιο-έκφρασης βασισμένων στους όρους και τις ενώσεις οντολογίας γονιδίων. Η εφαρμογή παράγει μια σελίδα HTML με το listi - [διαβασμένος σε περισσότερη γονίδιο-έκφραση Ontologizing τα microarray στοιχεία:]