Υποδοχή στο μοριακό σταθμό!

Πρέπει να καταχωρήσετε προτού να μπορέσετε να ταχυδρομήσετε στα φόρουμ μας ή να χρησιμοποιήσετε τα προηγμένα χαρακτηριστικά γνωρίσματά μας. Κατάλογος τώρα! Ελεύθερος και γρήγορος του!

Ήδη καταχωρημένος; Αδεια εισόδου τώρα κατωτέρω.

Όνομα χρηστών:

Κωδικός πρόσβασης:

Με θυμηθείτε;

Ήδη καταχωρημένος και ξέχασε τον κωδικό πρόσβασής σας; Χτυπήστε κατωτέρω για να το ανακτήσετε.

Ανακτήστε το χαμένο κωδικό πρόσβασης

Ενώστε τώρα - είναι γρήγορο και ελεύθερο!

Ο μοριακός σταθμός είναι το μεγαλύτερο δίκτυο ερευνητών, επιστημόνων και εραστών επιστήμης οπουδήποτε!

Πρόσφατες θέσεις φόρουμ

Ανάλυση έκφρασης γονιδίων - βιοπληροφορική

Η έκφραση γονιδίων μπορεί να καθοριστεί με διάφορες μεθόδους συμπεριλαμβανομένης της γενικά πρωτεϊνικής έκφρασης, και την έκφραση mRNA.

mRNA ανάλυση έκφρασης

mRNA η ανάλυση έκφρασης ή η έκφραση των επιπέδων mRNA μπορεί να δοκιμαστεί από τις πολλαπλάσιες τεχνικές σε μεγάλης κλίμακας επίπεδο που αυτές περιλαμβάνουν:

• Microarray ανάλυση DNA
• EST ή εκφρασμένες ετικέττες ακολουθίας DNA
• ΦΑΣΚΟΜΗΛΙΑ (τμηματική ανάλυση της έκφρασης γονιδίων)
• Μαζικά παράλληλη αλληλοuχία υπογραφών (MPSS)
• πολλαπλασιασμένη επιτόπια υβριδοποίηση

Σε μια μικρότερη κλίμακα ή να επιβεβαιώσει τα αποτελέσματα ενός μεγαλύτερης κλίμακας μπορεί να χρησιμοποιήσει τις ακόλουθες τεχνικές έκφρασης mRNA:

• Ρτ-πθρ
• Σε πραγματικό χρόνο pcr
• Δοκιμή προστασίας ριβονουκλεάσης (rpa)

Εντούτοις, η bioinformatic ανάλυση μπορεί να χρησιμοποιηθεί. Η ανάλυση Bioinformatic επιτρέπει την παράκαμψη της βιολογικής πόλωσης μέτρησης και το θόρυβο των συγκεκριμένων τεχνικών και χρησιμοποιεί τα στατιστικά εργαλεία στη χωριστή σημαντική αλλαγή στην έκφραση γονιδίων από το θόρυβο στις μελέτες έκφρασης μεγάλης κλίμακας ή γονιδίων υψηλός-ρυθμοαπόδοσης.

Τέτοιες μελέτες μπορούν να υιοθετηθούν για να καθορίσουν τα γονίδια που εμπλέκονται σε μια αναταραχή: κάποιος να συγκρίνει τα microarray στοιχεία από τα καρκινώδη epithelial κύτταρα με τα στοιχεία από τα μη-καρκινώδη κύτταρα για να καθορίσει τα αντίγραφα που είναι επάνω-ρυθμισμένα και κάτω-ρυθμισμένα σε έναν ιδιαίτερο πληθυσμό των κυττάρων καρκίνου.

Ανάλυση τεχνολογίας Affymetrix GeneChip

Η τεχνολογία Affymetrix GeneChip χρησιμοποιείται συχνά για να αναλύσει τα πρότυπα έκφρασης mRNA χρησιμοποιώντας μια microarray προσέγγιση.

Τα ακατέργαστα στοιχεία που παράγονται από τις σειρές ελέγχων GeneChip μπορούν να αναλυθούν χρησιμοποιώντας το Affymetrix ((ακολουθία ανάλυσης Microarray) λογισμικό MAS)4.0 και MAS5.0.

Το λογισμικό ακολουθίας ανάλυσης Microarray είναι σε θέση να υπολογίσει μια ποικιλία πολλές μετρήσεις χρησιμοποιώντας τις εντάσεις υβριδοποίησης που μετριούνται από το σαρωτή από τις σειρές ελέγχων.

Μερικοί αλγόριθμοι ανάλυσης Affymetrix

Ακατέργαστη ανάλυση στοιχείων

Η ένταση από την ολόκληρη σειρά ελέγχων χρησιμοποιείται για τους υπολογισμούς υποβάθρου και θορύβου στην ακατέργαστη ανάλυση στοιχείων.

Αλλες μετρικές συγκρίνουν τις εντάσεις των ακολουθία-συγκεκριμένων τέλειων κυττάρων ελέγχων αντιστοιχιών (PM) με τα κύτταρα ελέγχων κακού συνδυασμού (MM) ελέγχου τους για κάθε έλεγχο που τίθεται ως στόχος να καθορίσει εάν ένα αντίγραφο είναι παρόν (P), οριακό (M), ή απόν (A). Έπειτα, οι αριθμοί θετικών και αρνητικών ζευγαριών ελέγχων καθορίζονται για κάθε σύνολο ελέγχων. Οι αριθμοί θετικών και αρνητικών συνόλων ελέγχων χρησιμοποιούνται έπειτα για να παραγάγουν τις μετρικές που περιγράφουν την απόδοση κάθε συνόλου ελέγχων, του θετικού μέρους και της αναλογίας pos/$l*Neg. Η ακατέργαστη ανάλυση στοιχείων οδηγεί επίσης στις κλήσεις απουσίας και παρουσίας, τη μέση διαφορά, και τα επίπεδα έκφρασης.

Ανάλυση σύγκρισης

Η ανάλυση σύγκρισης δίνει την κανονικοποίηση και το ξελέπιασμα, τον υπολογισμό αλλαγής πτυχών και τους συντελεστές συσχετισμού.

Λειτουργικές σχέσεις

Οι λειτουργικές σχέσεις μπορούν να δοκιμαστούν με τη χρησιμοποίηση διάφορων μεθόδων συμπεριλαμβανομένου:

• Γονίδια λιστών από τις αλλαγές στην έκφρασή τους συμπεριλαμβανομένης της πτυχή-αύξησης ή της μείωσης
• Φυλογενετικά δέντρα
• Self-Organizing χάρτες
• Δίκτυα σχετικότητας

Πρωτεϊνική ανάλυση έκφρασης

Δείτε την πρωτεϊνική ανάλυση έκφρασης για περισσότερες πληροφορίες για αυτό το θέμα.

Φόρουμ βιοπληροφορικής έκφρασης γονιδίων

Συζητήστε και ταχυδρομήστε τις ερωτήσεις για την έκφραση γονιδίων στο φόρουμ βιοπληροφορικήσ.