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RNS Gele

Copyright 2007 - Molekulare Station

 

Geschichte von RNS Gel-Elektrophorese

RNS Gele sind benutzt worden, damit Dekaden aussondern und qualitativ die Qualität von RNS lokalisiert von den Proben festsetzen. Wenn Sie nicht sicher sind, welche RNS Prüfung ist:

AUDIOMolekularbiologie-Audio hören zu einer ausführlichen RNS Erklärung! und sehen Sie unseren RNS-Enzyklopädienartikel.

RNS Gel-Elektrophorese - Hintergrundinformationen

Nach Lokalisierung der RNS-Proben, wird die Qualität der lokalisierten RNS-Vorbereitung normalerweise durch Elektrophorese auf einem denaturierenagarosegel festgesetzt. Obgleich die Resultate hauptsächlich qualitativ sind, können Sie etwas Informationen über den Ertrag der RNS außerdem erhalten.

Gele denaturierend, werden verwendet, weil RNS neigt, sich nach sich zu falten und umfangreiche und beständige Sekundärstruktur über die intramolekulare niedrige Paarung zu bilden. Diese Sekundärstruktur von RNS verhindert, dass sie hauptsächlich entsprechend seiner Größe migriert.

Überprüfen Sie, ob Sie eine positive Steuerung der RNS auf dem Gel einschließen, im Falle, dass Sie ungewöhnliche Resultate erhalten, können Sie dann feststellen, ob das Problem mit dem Gel war oder ein Problem mit der RNS war, die Sie analysieren. Sie können Molekulargewichtmarkierungen der RNS, eine RNS-Probe auch benutzen, die bekannt ist, um intakt zu sein, oder beide, können zu diesem Zweck verwendet werden.

RNS-Gele werden mit dem befleckenden Äthidiumbromid sichtbar gemacht, während Äthidiumbromid zwischen der Sekundärstruktur der RNS-Moleküle einschiebt und erlaubt, dass RNS unter UVlicht gesehen wird.

RNS wird durch Gelelektrophorese ausgesondert (normalerweise Agarosegelelektrophorese). Nach dem Betrieb eines RNS-Gels, können Sie einen Nordfleck mit folgender Übertragung auf Membrane, Hybridation mit Prüfspitze und schließlich Abfragung leiten. Oder einfach (und viel schneller), Fleck für RNS unter Verwendung des Äthidiumbromids oder SYBR (oder ähnliche Färbung -, die als sie besser ist, ist ungiftig und sicherer).

 

Anwendungen der RNS Gele

Da Nordflecken viel langwieriger als RNS-Gele und Echtzeit-PCR abzuschließen sind, sind sie nicht benutzte soviel wie RNS-Gele.

Die RNS-Gelelektrophorese und seine Varianten werden in der Molekularbiologieforschung verwendet:

  • entdecken Sie RNS
  • Probe für die Qualität von RNS lokalisiert
  • lassen Sie allgemeine Ermittlung der RNS-Quantität oder -ertrags zu
  • Probe für RNS-Verminderung

Nachteile der RNS Gele

Die Nachteile der Anwendung von RNS-Gelelektrophorese umfaßt:

  • RNS-Gele sind nicht sehr quantitativ. Sie können nicht den RNS-Ertrag genau feststellen oder sogar mit Standards betragen. Radioaktive Methoden wie Nordbeflecken oder Punktflecken sind viel genauer.
  • Häufig wird Äthidiumbromid benutzt, um die RNS zu entdecken. Äthidiumbromid ist ein biohazard, da es mutagen und giftig ist.
  • RNS-Gele lassen eine Schnellanalyse des RNS-Ertrags sind jedoch nicht so schnell wie UVspektralphotometrie oder andere Methoden zu.

Vorteile der RNS Gele

Die Vorteile der RNS Gele umfassen:

  • Es ist eine weit geltende Methode
  • RNS-Gele sind sehr schnell und einfach durchzuführen
  • Sie können für RNS-Qualität innerhalb 1-2 Stunden prüfen
  • Wenn Sie SYBR oder einen anderen ungiftigen Fleck (d.h. Sie benutzen nicht Äthidiumbromid), benutzen, sind RNS Gele ziemlich sicher.

RNS Gel-Protokoll

Um die Vollständigkeit Ihrer RNS zu überprüfen sollten Sie eine „Nordfleck“ Analyse tun. Um dieses zu vollenden müssen Sie ein denaturierengel laufen lassen.

Für Mini-Gele zu den Midi-Gelen des RNS-Gebrauches: Bilden Sie 50 mL-100mL

Für Groß-Gele bilden Sie 400 ml.

 

Für das Gel 100mL (am geläufigsten laufen gelassen) müssen Sie 1g von Agarose hinzufügen, um 1% Agaroselösung zu bilden.

 

Laufendes Buffer-Rezept für RNS Gele

Zu sich vorbereiten: 500mls 750 mls 1.5 Liter

1X E Buffer (50X) - unten
10 ml 15 ml 30 ml
0.66M Formaldehyd (1/19 von Vol.) 26.3 ml 39.5 ml 79 ml

RNS, die Reagenzien denaturiert

Zu 400ul von RNS vorbereiten Reagens denaturierend:

Fügen Sie das folgende hinzu:

  • 80% Foramide-entionisiertes 300ul
  • UL des 3.7% Formaldehyds 40
  • 1X 50X E UL des Buffers 8
  • dH2O = 400ul 52ul

Buffer 50 x-E pro Liter

Fügen Sie hinzu:

  • 0.9 M Na2 HPO4 Diabas- 127.8 g
  • 0.1M NaH2PO4 einbasischer g 13.8

Protokoll: Jobstepps, wenn ein RNS Gel vorbereitet wird

  1. setzen Sie Agarose in Lösungen ein.
  2. Erhitzen Sie vorbereitete Lösung in Gewebe-eingesteckter Flasche
  3. Lassen Sie kühles zu 60°C
  4. Fügen Sie Formaldehyd hinzu, um 0.66M 2.7 ml 4.0 zu entsprechen 5.3 21.2
  5. (Fügen Sie Äthidiumbromid hinzu, wenn Sie es zur Flasche benutzen)
  6. Gießen Sie Gel (in der Haube, wenn möglich).
  7. Erhitzen Sie 2 ug RNS an 75°C für 10 Min., dann schnell kühl. (dieses lässt RNS denaturieren und single-stranded bleiben).
  8. Fügen Sie hinzu: 2.5 Vol. von RNS Reagens denaturierend
  9. Fügen Sie 1/10 Vol. der Ladenfärbung Proben hinzu.
  10. Laden Sie Proben auf Agarosegelvertiefungen.
  11. Lassen Sie Gel (normalerweise Volt 100V) Stunden lang 30minutes-2 laufen. (Überprüfung RNS, die unter Verwendung der Färbungsmarkierungen läuft)


Spitzen für RNS Gele

Lassen Sie immer ein Agarosegel Ihrer RNS laufen, um die Qualität festzusetzen. Bauen nicht nur nur UVspektralphotometrieresultate.

* Benutzen Sie DEPC behandeltes Wasser und gebackene Glaswaren für alle Jobstepps. Die Buffer müssen RNase frei sein oder Milipore gereinigtes Wasser benutzen, wenn Sie in einem Ansturm sind. RNase ist überall! Tragen Sie Handschuhe, gebackene Glaswaren des Gebrauches nur oder reinen Plastik. DePC Festlichkeit Ihr Wasser, Buffer (ausgenommen Tris). Geben Sie sehr acht.

 

Störungssuche RNS Gele

Wenn Sie aktuell eine bevorzugte Methode für den Betrieb von RNS haben, fahren Sie fort, sie zu benutzen.

Behandeln Sie und Pfostenprobleme oder -fragen über RNS Gele im RNS Protokoll-Forum.

RNS Gel-Referenzen