Protein-Struktur-Vorhersage

Bioinformatic Hilfsmittel sind in der Lage, die Struktur eines Proteins entweder in 2 Maßen (2-D) oder in den Dreimaßen vorauszusagen (3-D). Diese kann möglicherweise nicht eine reale Darstellung der tatsächlichen Struktur eines Proteins, gleichwohl es ein guter Ausgangspunkt, zum ist der enzymatischen Taschen vorauszusagen, und der Proteinprotein Interaktionsgebiete sein. Nach Vorhersage kann Bestätigung der Proteinstruktur unter Verwendung der Röntgenstrahl-Kristallographietechniken gebildet werden.

Bioinformatic Programme verwendet worden, um Sekundärstruktur vorauszusagen:

(Sehen Sie bitte unser Protein, Vorhersage Bioinformatic Hilfsmittel-Datenbank zu strukturieren für 2-D Vorhersage;

und Protein-Struktur-Vorhersage Bioinformatic bearbeitet Datenbank für 3-D Vorhersage. ; und unsere Datenbank für das Zurückholen von Protein-Struktur-Daten von den 3-Dimensional Datenbanken.

Experimentelle Daten können verwendet werden, um in der Vorhersageproteinstruktur zu helfen. Die folgenden ist Experimente, die in der Proteinstrukturanalyse helfen können:

- Lokalisation der Disulfidbindungen (stellen Sie feste Begrenzungen auf dem Standort der Cysteine im Platz) zur Verfügung

- Spektroskopiedaten, die Anhaltspunkte zum Sekundärstrukturaufbau Ihres Proteins des Interesses geben können

- Site verwiesene Mutageneseexperimente, (Alanin ein Ala für verschiedene Aminosäuren ersetzend und Funktion des Proteins dann überprüfend) die wichtigen Einblick zu den Rückständen geben können, die in der aktiven Site eines Enzyms oder Proteinprotein zusammenwirkenden verbindlichen der Sites oder der Gebiete wichtig sind.

- Erhalten Sie experimentelle Daten von Pfosten-Übersetzungsmodifictions (z.B. Phosphorylierung- und glycosylationsites können Rückstände vorschlagen, die außen zugänglich sein müssen und Oberflächenrückstände folglich sein können)

- Proteolytische Spaltungsites.

Diese Daten im Verstand zu führen, wenn, von Vorhersage der Proteinstruktur zu leiten wichtig ist, als dieses ist strukturelle Daten, die nachgewiesene experimentally.0 gewesen ist

Frage, ob Strukturvorhersagen mit experimentellen Resultaten übereinstimmen. Dieses kann die Gültigkeit der vorausgesagten Proteinstrukturen prüfen.