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Antikörper Microarray Beschränkungen

Protein und Antikörper Microarrays

Probleme und mögliche Lösungen für Antikörper Microarrays

Verwendbarkeit der Antikörper
            Eine andere Herausforderung zu den Antikörperreihen soll Antikörper gegen die 100.000 ≥ Proteine erhalten, die das menschliche proteome enthalten.  Es gibt aktuell einen sehr kleinen Bruch der Antikörper, die vom proteome vorhanden sind.  Zusätzlich wird die Besonderheit von vielen dieser Antikörper schlecht dokumentiert und zusätzliche Antikörper können zu benötigt werden
ermöglichen Sie die Abfragung von Pfosten-post-translational Änderungen.  Die Abfragung der Proteine durch Antikörper-–Antigeninteraktionen wird auch durch eine ausgedehnte Strecke der Besonderheit und der Affinität gekennzeichnet.  Auch es ist schwierig, ein großes Set des in hohem Grade spezifischen Antikörpers zu erhalten
Moleküle. Folglich werden die meisten Antikörperreihen in ihrem Gebrauch begrenzt und einige gut definierte Sicherung Mittel enthalten, die an einer bestimmten Kategorie Proteinmarkierungen (9.17) verwiesen werden 
- nicht fungieren ähnliches glycosylation

Andere Probleme, die Antikörper Microarrays und mögliche Lösungen gegenüberstellen
Klassische Strategien des Antikörpererzeugung durch Tierimmunisierung scheinen, unpraktisch zu sein. Recombinant Antikörperbildschirmanzeigebibliotheken sind vielversprechender (59-61). Vor kurzem sind viele recombinant Methoden des Festlegens der Antikörper nachgeforscht worden.
Diese enthalten Bakteriophagen Antikörper-anzeigen, Ribosombildschirmanzeige, SELEX (systematische Entwicklung von ligands durch exponentiale Bereicherung), mRNA Bildschirmanzeige und affibody Bildschirmanzeige, die entwickelt worden sind, um die Produktion der Antikörper und/oder der Antikörpernachahmer (16.54.56.62) vorzurücken.  Diese Methoden alle beziehen den Aufbau der großen Repertoire der entwicklungsfähigen Regionen in mögliche verbindliche Aktivität mit ein, die dann durch mehrfache Umläufe der Affinität Reinigungen ausgewählt werden. Anwärter klont kann mit Entwicklung Auswahl weiter ausgewählt werden, die verbindliche Affinitäten verbessert.  Jedoch soll ein ideales Auswahlsystem, das die schnellen, robusten, empfindlichen, niedrigen Kosten ist, automatisiert, und herabgesetzt, schon völlig sich entwickeln (16.54).  Diese kleineren Antikörperfragmente normalerweise haben Cross-reactivity und ähnliche Eigenschaften nach Zubehör (7.8.9.27) verringert.
Auch, weil recombinant Antikörper eine möglicherweise hohe Affinität, hohe Besonderheit haben und ihr kleineres Molekulargewicht, das normalerweise kDa ungefähr 30 ist, während nicht-non-recombinant Antikörper kDa ungefähr 150 sind, dichtes und orientiertes Zubehör zu den Unterstützungsoberflächen wird erleichtert (63.64).
            Antikörper sind nicht die einzigen Moleküle, die Proteine binden können.  Aptamers sind kurze oligonucleotids, die kovalente Zielproteine binden und querverbinden können.  Dieses erleichtert
höhere Strengewäschezustände, das Abfragung der spezifischen Schwergängigkeit fördert.  Ausserdem werden diese Moleküle leicht ausgewählt, gekleidet und synthetisiert.  Gereinigtes Proteinziel ist eine Anforderung für ihren Gebrauch jedoch, und aptamers können voreingenommene Schwergängigkeit ausstellen, während RNAs neigen, in hohem Grade negativ aufgeladen zu werden (9). Ein Gruppe (Somalogic) vor kurzem benutztes stillgestelltes Anti-menschliches Immunodeficiency virus-gp120 aptamer, zum von von subnanomolar Konzentrationen des Zielproteins 5% im menschlichen Serum (65) zu entdecken. 

Zunächst: Protein Microarray Abfragung Methoden und Analyse

Referenzen für Protein und Antikörper Microarrays

Zurück zu:

Einleitung und Hintergrund zu den Protein-Chips und zu den Antikörper-Chips.

Typen der Antikörper-und Protein-Chips