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Reihenfolgen-Ausrichtungs-und Sichtbarmachung-Hilfsmittel
| BoxShade - http://www.ch.embnet.org/software/BOX_form.html Drucken und Schattierung der mehrfachen Ausrichtungsdateien. - [Gelesen mehr BoxShade] |
| CHAOS/DIALIGN WWW Server - http://dialign.gobics.de/chaos-dialign-submission Der CHAOS/DIALIGN WWW Server ist eine mehrfache Reihenfolgenausrichtungssite, die Inputreihenfolgen durch CHAOS führt, um eine Liste der lokalen similarites zu erstellen. Diese Ähnlichkeiten dienen als Startpunkte und lassen DIALIGN globale Ausrichtungen schneller leiten. ABC kann - [gelesen mehr CHAOS/DIALIGN WWW Server] |
| PRÄGEN Sie - http://cbrmain.cbr.nrc.ca/EMBOSS/ Verschiedene Suite der Hilfsmittel für Reihenfolgenanalyse; viele Programme analog GCG; kontextsensitive Hilfe für jedes Hilfsmittel. - [Gelesen mehr PRÄGEN Sie] |
| GeneDoc - http://www.psc.edu/biomed/genedoc/ Mehrfacher Reihenfolgenausrichtungsherausgeber, Analysator und Schattierunghilfsprogramm für Windows. - [Gelesen mehr GeneDoc] |
| GraphAlign - http://darwin.nmsu.edu/cgi-bin/graph_align.cgi Stellt grafische Darstellungen ClustalW der globalen paarweise Ausrichtungen für Abfrage und der vorbehaltlichen Reihenfolgen vom BÖE-Typen Recherchen zur Verfügung. Grafische Darstellung stellt Informationen auf Qualitätskapiteln der globalen Ausrichtung zur Verfügung. - [Gelesen mehr GraphAlign] |
| FREUDE - http://www-cryst.bioc.cam.ac.uk/~joy/ Programm für das Anzeigen der strukturellen Informationen 3D in einer mehrfachen Reihenfolgenausrichtung. - [Gelesen mehr FREUDE] |
| Malvenfarben - http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve/documentation.php Malvenfarbe ist ein unabhängiges Software-Tool für das Konstruieren der mehrfachen Genomausrichtungen. - [Gelesene Malvenfarbenere] |
| Seaview - http://pbil.univ-lyon1.fr/software/seaview.html SeaView ist ein grafischer mehrfacher Reihenfolgenausrichtungsherausgeber, der ist, verschiedene Ausrichtungsformate (VERBINDUNG, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE) zu lesen und zu schreiben. Es darf die Ausrichtung manuell bearbeiten, und DOT-PLOT oder CLUSTALW Programme zum Einheimischen auch laufen lassen - [gelesen mehr Seaview] |
| SequenceJuxtaposer - http://www.cs.ubc.ca/~tmm/papers/sj/ SequenceJuxtaposer ist ein Hilfsmittel für die Sichtbarmachung und das Vergleichen der biomolekularen Reihenfolgen. Verwendet eine Sichtbarmachungtechnik, die Akkordeonzeichnung genannt wird, die Benutzern erlaubt, in Regionen des Interesses an den Ausrichtungen laut zu summen. - [Gelesen mehr SequenceJuxtaposer] |
| SeqVISTA - http://zlab.bu.edu/SeqVISTA/ Hilfsmittel für Reihenfolgenmerkmalssichtbarmachung und -vergleich; integriert mit Internet Explorer; nimmt GenBank flache Dateien, GenBank HTML, FASTA Dateien an; Steckverbindungen existieren für Sichtbarmachung der Ausgabe von RepeatMasker, von PsiPred und von Cister. - [Gelesen mehr SeqVISTA] |
| BRÜCKE - http://www.charite.de/bioinf/strap/ Das strukturelle Ausrichtungs-Programm für Proteine (BRÜCKE) ist ein Java-gegründetes Programm, das über das Web unter Verwendung einer aktivierten Datenbanksuchroutine des Java-Webs laufen gelassen werden Anfang oder und Durchlauf als unabhängige Anwendung downloadet werden kann. Ausrichtungen können unter Verwendung ein einiger Methoden, Inc. erfolgt werden - [gelesen worden mehr BRÜCKE] |
| WAViS - http://wavis.img.cas.cz/ Der Web-Ausrichtungs-Sichtbarmachung-Server (WAViS) liefert verschiedene Web-Hilfsmittel, um die Darstellung der mehrfachen Reihenfolgenausrichtungen der Aminosäure oder des Nukleotids zu erhöhen. - [Gelesen mehr WAViS] |
| WebLogo - http://weblogo.berkeley.edu/ WebLogo lässt ein grafische Darstellungen (Reihenfolgenfirmenzeichen) der mehrfachen Reihenfolgenausrichtungen erstellen. Dieses kann von der Web site getan werden und der Quellencode für WebLogo ist auch für Download vorhanden. - [Gelesen mehr WebLogo] |
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