GIPFEL (hoch entwickelte zufriedene abgleichende Maschine für Reihenfolgen) ist ein Server, der benutzt werden kann, um Wiederholungen (zwischen 3 und 10 000 Unterseiten) über mehrfacher Sorte kurz zu suchen. Benutzer können Resultate einer Recherche durch Schlüsselwortrecherchen begrenzen. - [Gelesen mehr GIPFELN]
Tagesordnung ist ein Web-Hilfsmittel, das die genomic Reihenfolgen von evolutionarily in Verbindung stehenden Organismen vergleicht, um Genvorhersagen zu bilden. Sie nimmt Paare der genomic Reihenfolgen als Input, richtet die Reihenfolgen aus und bildet die Vorhersagen, die auf Spleißsignalen, Anfang und basieren - [gelesen mehr Tagesordnung]
Gen, das Server formt, der auf die Formung des alternativen Verbindens sich konzentriert. Er basiert auf der Ausrichtung von mRNA, von EST und von Proteinreihenfolgen und kombiniert Genom-gegründete Bündeln und Abschrift. Unterstützt Menschen-, Mäuse- und Rattegenome. - [Gelesen mehr ASmodeler]
Der ConSurf Server lässt ein Niveaus des bekannten Proteins der Aminosäureerhaltung abbilden strukturiert zwecks Studienbereiche von möglicher Funktionsbedeutung auf der Oberfläche des Proteins. Eine VEH-Datei wird als Input benötigt, und eine mehrfache Reihenfolge alignmen - [gelesen mehr ConSurf]
Wechselbeziehunganalyse des Aminosäureersatzes in den Proteinreihenfolgen (CRASP) nimmt mehrfache Ausrichtungen der Aminosäurereihenfolgen als Input und entdeckt koordinierten Rückstandersatz. Dieser Ersatz kann abhängige Entwicklung von Funktions vorschlagen - [gelesen mehr CRASP]
Die Datenbanksuchroutine ECR-(konservierte Evolutionsregionen) ist ein web-basiert Hilfsmittel für die Sichtbarmachung und die Steuerung durch vollständige Genomausrichtungen einiger fest gefügter Sorten. Benutzer können Reihenfolgen für Annäherung an eins der dargestellten Genome auch eingeben. - [Gelesen mehr ECR-Datenbanksuchroutine]
Ein Hilfsmittel für das phylogenetische Beschatten der mehrfachen Reihenfolgen von den eng verwandten Sorten. Dieses Analysen der mehrfachen Reihenfolgenausrichtungen kann verwendet werden, um mutmaßliche Funktionselemente vorauszusagen. - [Gelesen mehr eShadow]
Becher erlaubt dem Benutzer, ein oder mehreres Protein- oder Nukleotidreihenfolgen ZU SPRENGEN gegen Datenbanken, die die Reihenfolgen haben, die zu den Ausdrücken des Genabgebildet werden Ontology (GEHEN Sie). Resultate können für einzelne Reihenfolgen oder als Übersichtsstatistiken für die Gruppe angesehen werden, wenn mehr als ein s - [gelesen worden mehr Becher]
Die Berkeley-Genom-Rohrleitung alias Godzilla, liefert precomputed VISTA-Pläne der Reihenfolgenerhaltung zwischen Paaren des Menschen, Maus oder Rattegenomen. - [Gelesen mehr Godzilla]
LowComplexity ist ein Hilfsmittel, das nach niedrigen Kompliziertheitsregionen der DNA-oder Proteinreihenfolgen sucht. Unter Verwendung LowComplexity können Sie lange Reihenfolgen (Chromosomen, Genome) oder ein Set ausgerichtete Reihenfolgen suchen. Dieses Hilfsmittel enthält auch Links zu anderen Algorithmen f - [gelesen mehr LowComplexity]
Das mehrfache Ausrichtungs-Variante-Verknüpfungsprogramm (MAVL) überprüft ein vor-ausgerichtetes Set Nukleotid- oder Proteinreihenfolgen und entdeckt die positiven und negativen interpositional Wechselbeziehungen. Die Resultate können als StickWRLD Darstellung dann angesehen werden. - [Gelesen worden mehr MAVL/StickWRLD]
PDA (Rohrleitung-Verschiedenartigkeit-Analyse) ist ein Server, der nach polymorphen Reihenfolgen in den großen Datenbanken sucht und schätzt ihre genetische Verschiedenartigkeit. Resultate enthalten die Reihenfolgenausrichtungen (festgelegt von ClustalW) und umfassen Statistiken über Polymorphie, synonymo - [gelesen mehr PDA]
PipMaker berechnet Ausrichtungen der ähnlichen Regionen in zwei DNA-Reihenfolgen. MultiPipMaker erlaubt dem Benutzer, Verhältnisse unter mehr als zwei Reihenfolgen zu sehen. - [Gelesen mehr PipMaker]
Viskose (Sichtbarmachung und Vergleich der Übereinstimmung Reihenfolgen) ist ein Web gegründetes Hilfsmittel, das ein Set Reihenfolgen (ausgerichtet oder nichtausgerichtet) nimmt und eine Übereinstimmungsreihenfolge und die Erhaltungskinetik für die Reihenfolgenausrichtung berechnet und produziert ein einfaches zum interpre - [gelesene dickflüssigere]
Set Hilfsmittel für vergleichbaren Genomics; erlaubt Sichtbarmachung der langen DNA-Reihenfolgenausrichtungen von 2 oder mehr Sorten mit Anmerkungsinformationen; fähig zur Kombination von Recherche Datenbank der verbindlichen Sites des Übertragungfaktors mit vergleichbarer Reihenfolgenanalyse. - [Gelesen mehr VISTA]
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