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RNS-Sekundärstrukturvorhersage. ' Struktur 2 von RNS unter Verwendung Falten sich, mfold, bioinformatic Hilfsmittel online und Software, um RNS-Falte- und -haarnadelschleifen vorauszusagen.
| CARNAC - http://bioinfo.lifl.fr/carnac Server, der voraussagt, konservierte Sekundärstrukturelemente von übereinstimmendem RNAs. Der Input eines Sets RNS-Reihenfolgen werden nicht benötigt, vorher ausgerichtet zu werden. - [Gelesen worden mehr CARNAC] |
| DEQOR - http://cluster-1.mpi-cbg.de/Deqor/deqor.html Bearbeiten Sie, das im Entwurf und in der Qualitätskontrolle von kleinem behindernRNAs (siRNAs) für RNS-Störung (RNAi) und das Genzum schweigen bringen hilft. Es wertet die hemmende Kraft der möglichen siRNA Reihenfolgen sowie die Bestimmung der Genregionen aus, die ein hohes sil haben - [gelesen mehr DEQOR] |
| ERPIN - http://tagc.univ-mrs.fr/erpin/ ERPIN (einfaches RNS Profil-Kennzeichen) nimmt als Input eine RNS-Reihenfolgenausrichtung und eine Sekundärstrukturanmerkung und wird eine große Vielfalt der bekannten RNS-Motive identifizierenen (wie tRNAs, rRNAs 5S, SRP RNS-, C-/Dkasten snoRNAs, Hammerhaimotive, miRNAs und othe - [gelesen mehr ERPIN] |
| ILM - http://cic.cs.wustl.edu/RNA/ Server, der die wiederholte Schleife liefert, die abgleicht und Maximum belasteten abgleichende Algorithmen für das pseudoknot, das RNS-Sekundärstrukturvorhersage enthält. Algorithmen können die thermodynamischen und vergleichbaren Informationen anwenden, und können für entweder übereingestimmt worden folglich verwendet werden oder - [gelesen mehr ILM] |
| Kinefold - http://kinefold.u-strasbg.fr/ Kinefold berechnet (und belebt), die faltende Kinetik der RNS-Reihenfolgen einschließlich pseudoknots. - [Gelesen mehr Kinefold] |
| Mfold - http://www.bioinfo.rpi.edu/applications/mfold/old/rna/ Sagen Sie RNS-Sekundärstruktur von der Reihenfolge voraus; sagt nicht pseudoknots voraus - sehen Sie PKNOTS. - [Gelesen mehr Mfold] |
| MolMovDB - http://molmovdb.org/ Die Datenbank der makromolekularen Bewegungen (MolMovDB) enthält eine Ansammlung lebhaftes Protein und RNS-Strukturen, um in die Erforschung der makromolekularen Flexibilität zu unterstützen. Software für Strukturanalyse ist auch vorhanden. - [Gelesen mehr MolMovDB] |
| MOLPROBITY - http://kinemage.biochem.duke.edu/molprobity/main.php?use_king=1 MOLPROBITY ist eine Strukturanalyse und ein Gültigkeitserklärungsprogramm, das sterisches berechnen und anzeigen kann, ein H-Abbinden und Interaktionen vander Waals für bekannte Strukturen der Proteine, der Nukleinsäuren und der Komplexe. - [Gelesen mehr MOLPROBITY] |
| PKNOTS - http://www.genetics.wustl.edu/eddy/software/#pk Sagen Sie pseudoknot Strukturen in der RNS-Reihenfolge voraus; nur Quellencode. - [Gelesen mehr PKNOTS] |
| RDfolder - http://rna.cbi.pku.edu.cn:1977/rna/index.php EIN RNS-Sekundärstruktur-Vorhersageprogramm, das zwei Methoden einführt, man gründete auf dem gelegentlichen Stapeln und dem anderen, das auf schraubenartigen Regionverteilungen basierte. - [Gelesen mehr RDfolder] |
| RNAfold - http://www.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAfold.cgi Sagen Sie RNS-Sekundärstruktur von der Reihenfolge voraus; beachten Sie Reihenfolgenlängenbegrenzung. - [Gelesen mehr RNAfold] |
| RNAsoft - http://www.rnasoft.ca/ Software für RNA/DNA Sekundärstrukturvorhersage und -entwurf - [gelesen mehr RNAsoft] |
| Sfold - http://sfold.wadsworth.org Server mit drei Hilfsmitteln für den rationalen Entwurf von kleinem behindernRNAs (Sirna), von antisense Oligonucleotides (Soligo) und von Transport-Spaltung von ribozymes (Sribo). Ein viertes Hilfsmittel, Srna, bringt Ausgabe einschließlich allgemeine faltende Merkmale zurück. - [Gelesen mehr Sfold] |
| siDirect - http://design.RNAi.jp/ Server für das Berechnen der kleinen behindernreihenfolgen der RNS (siRNA), die gut für Säugetier- RNS-Störung (RNAi) entsprochen werden. Die Site nimmt eine Reihenfolge als Input an und bringt eine Liste der siRNA Anwärter zurück. - [Gelesen mehr siDirect] |
| siRNA Auswahl-Server - http://jura.wi.mit.edu/bioc/siRNA Server, der den Entwurf von kurzem behindernRNAs (siRNAs) unterstützt durch die Lieferung von Informationen auf Stabilität, SNPs und Besonderheit des möglichen siRNA. - [Gelesen mehr siRNA Auswahl-Server] |
| siRNAdb - http://sirna.cgb.ki.se/ Dieses Hilfsmittel umfaßt siSearch, AOSearch und ein siRNAdb, das eine Plattform für das Bergbau einer siRNA Datenbank zur Verfügung stellt, und das Suchen nach unspezifischen Abgleichungen zu Ihrem siRNA (kleines behindernRNAs). - [Gelesen mehr siRNAdb] |
| SStructView - http://smi-web.stanford.edu/projects/helix/sstructview/ RNS-Sekundärstrukturprojektor-applet; muss in die eingeführt zu werden Webseite integriert sein; kann mit mehrfachem Computer binden backends. - [Gelesen mehr SStructView] |
| GETRETEN - http://www.cellbio.unige.ch/RNAi.html T7 RNAi Oligo Hilfsmittel des Entwerfers (GETRETEN) im Entwurf DNAoligonucleotides kurz der behindernsynthese der RNS (siRNA) mit Polymerase der RNS T7. Sie nimmt einen Input einer cDNA Reihenfolge und gibt eine Liste von DNA oligos für die Einrichtung aus. - [Gelesen GETRETEN] |
| Wien-RNS Paket - http://www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/ Enthält Wechselstrom-Codebibliothek und einige unabhängige Programme für die Vorhersage und den Vergleich der RNS-Sekundärstrukturen. - [Gelesen mehr Wien-RNS Paket] |
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